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P
P
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.
Leak
の変数
permeability factor (/ms)
P
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.
Release
の変数
P
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.
Uptake
の変数
permeability factor (mM/ms)
P
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.carrier.
NKCC
の変数
factor to define the maximum flux via NKCC1 [amol]
pa
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
IKr
の変数
PA2MS
-
org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function
の クラス
Average and Convert pA to M/S.
PA2MS()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function.
PA2MS
のコンストラクタ
page
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
AbstractGraph
の変数
このGraphが配置されるViewer
page
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.
Axis
の変数
page
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.
RelationGraph_LP
の変数
pAI
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
ICaL
の変数
AI state probability for voltage-dependent gate
pAI
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
ICaL
の変数
AI state probability for voltage-dependent gate
pAI
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
ICaL
の変数
AI state probability for voltage-dependent gate
pAI
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
INa
の変数
AI state probability for voltage-dependent gate
pAI
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.current.cf.
ICaL
の変数
AI state probability for voltage-dependent gate
pAI
- クラス org.simBio.bio.sarai_noma_2004.fourState.
ODE
の変数
pAI
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
ICaL
の変数
AI state probability for voltage-dependent gate
pAI
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
ICaL
の変数
AI state probability for voltage-dependent gate
pAI
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
INa
の変数
AI state probability for voltage-dependent gate
paintAxises(Graphics2D, IPlot)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
AbstractGraph
のメソッド
Initialize graph area, and draw axes and grids.
paintBackground(Graphics2D, IPlot)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
AbstractGraph
のメソッド
Draw background.
paintComponent(Graphics)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
AbstractGraph
のメソッド
Graphの画面用描画を行う.
paintComponent(Graphics)
- インタフェース org.simBio.sim.analyzer.graph.
IViewer
のメソッド
paintComponent(Graphics)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.
Viewer
のメソッド
Viewerの画面用描画を行う.
paintComponent(Graphics)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
Viewer
のメソッド
Viewerの画面用描画を行う.
paintComponent(Graphics)
- クラス org.simBio.sim.gui.
GUI.JPrintablePanel
のメソッド
paintGraph(Graphics2D, IPlot)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
AbstractGraph
のメソッド
Draw graph.
paintGraph(Graphics2D, IPlot)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
BasicGraph
のメソッド
paintGraph(Graphics2D, IPlot)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
Graph
のメソッド
Draws a graph.
paintGraphSub(Graphics2D, IPlot)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
BasicGraph
のメソッド
グラフ描画を行う。
paintGraphSub(Graphics2D, IPlot)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
RelationGraph
のメソッド
paintLegend(Graphics2D, IPlot)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
AbstractGraph
のメソッド
Draw legend.
pAP
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
ICaL
の変数
AP state probability for voltage-dependent gate
pAP
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
ICaL
の変数
AP state probability for voltage-dependent gate
pAP
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
ICaL
の変数
AP state probability for voltage-dependent gate
pAP
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
INa
の変数
AP state probability for voltage-dependent gate
pAP
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.current.cf.
ICaL
の変数
AP state probability for voltage-dependent gate
pAP
- クラス org.simBio.bio.sarai_noma_2004.fourState.
ODE
の変数
pAP
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
ICaL
の変数
AP state probability for voltage-dependent gate
pAP
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
ICaL
の変数
AP state probability for voltage-dependent gate
pAP
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
INa
の変数
AP state probability for voltage-dependent gate
parabola
-
org.simBio.bio
の クラス
for test.
parabola()
- クラス org.simBio.bio.
parabola
のコンストラクタ
ParallelElementForce
-
org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction
の クラス
Parallel element force of NL contraction model, Negroni JA and Lascano EC.
ParallelElementForce()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.
ParallelElementForce
のコンストラクタ
Parameter
-
org.simBio.core
の クラス
labeled public double, Component of the Composite Pattern.
Parameter()
- クラス org.simBio.core.
Parameter
のコンストラクタ
ParameterChanger
-
org.simBio.sim.dm
の クラス
パラメータを変更したXMLデータを生成するクラス。
ParameterChanger(InputStream, InputStream)
- クラス org.simBio.sim.dm.
ParameterChanger
のコンストラクタ
Parse XML files and run randomizer.
ParameterChanger(InputStream)
- クラス org.simBio.sim.dm.
ParameterChanger
のコンストラクタ
Parse XML files and run randomizer.
ParameterSpace
-
org.simBio.sim.ps
の クラス
ResultGeneratorの計算結果を集めて保持する。
ParameterSpace(String, String)
- クラス org.simBio.sim.ps.
ParameterSpace
のコンストラクタ
paramRef
- クラス org.simBio.sim.ps.
Result
の static 変数
reference value of the changing parameters
params
- クラス org.simBio.sim.ps.serialize.
ParseXMLs.Result
の変数
parent
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.plot.
AbstractPlot
の変数
parseXML(InputStream)
- クラス org.simBio.sim.dm.util.
DOMHandler
の static メソッド
Parse XML-file.
ParseXMLs
-
org.simBio.sim.ps.serialize
の クラス
Query XML files, write a table of contents in a Csv and a XML.
ParseXMLs(InputStream)
- クラス org.simBio.sim.ps.serialize.
ParseXMLs
のコンストラクタ
ParseXMLs(Document)
- クラス org.simBio.sim.ps.serialize.
ParseXMLs
のコンストラクタ
ParseXMLs.NameVal
-
org.simBio.sim.ps.serialize
の クラス
ParseXMLs.NameVal()
- クラス org.simBio.sim.ps.serialize.
ParseXMLs.NameVal
のコンストラクタ
ParseXMLs.Result
-
org.simBio.sim.ps.serialize
の クラス
ParseXMLs.Result()
- クラス org.simBio.sim.ps.serialize.
ParseXMLs.Result
のコンストラクタ
PartialPotential
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function
の クラス
calcuration of partial potential.
PartialPotential()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
PartialPotential
のコンストラクタ
PartialPressure
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
PressureToConcentration
の変数
partition
- クラス org.simBio.bio.kuratomi_et_al_2003.current.carrier.
INaCa
の変数
distribution constant
partition
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.
INaCa
の変数
distribution constant
patternString
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
Axis
の変数
ラベルフォーマット文字列
pC
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
ICaL
の変数
C state probability for calcium-dependent gate
pC
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
ICaL
の変数
C state probability for calcium-dependent gate
pC
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
ICaL
の変数
C state probability for calcium-dependent gate
pC
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.current.cf.
ICaL
の変数
C state probability for calcium-dependent gate
pC
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
ICaL
の変数
C state probability for Ca
2+
-dependent gate
pC
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
ICaL
の変数
C state probability for calcium-dependent gate
Pca
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
ICaL
の変数
PCa
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
ICaL
の変数
PCa
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
ICaL
の変数
pCa
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.
TroponinNL
の変数
pCaCB
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.
TroponinNL
の変数
pCB
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.
TroponinNL
の変数
PCl
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
ICaL
の変数
PCl
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
ICaL
の変数
pClose
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.channel.
IRyR
の変数
close state probability
PCr
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
ConcentrationPi
の変数
phosphocreatine concentration in cytosol
PCr
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.enzyme.
CK
の変数
phosphocreatine concentration in cytosol
PD
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.
SubstrateDehydrogenation
の変数
power factor
PDE
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
CAMP
の変数
Phosphodiesterase concentration (mM)
pE1S
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.carrier.
NKCC
の変数
probability of pE1S
pE1total
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
INaCa
の変数
E1 probability
peak
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
APD
の変数
PeakDetect
-
org.simBio.sim.analyzer.measure
の クラス
onsetとoffsetの間でtargetの極値を求める。
PeakDetect()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
PeakDetect
のコンストラクタ
percent
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
APD
の変数
percent
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
APDforSA2
の変数
活動電位と見なす閾値 (%)
period
- クラス org.simBio.bio.noble_et_al_1998.
Model
の変数
permeabilityCa
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.
IRyR
の変数
membrane permeability
permeabilityCa
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
CfChannel
の変数
channel permeability for Ca2+
permeabilityCa
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.channel.
IRyR
の変数
membrane permeability
permeabilityCa
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.
Diffusion
の変数
membrane permeability for Ca2+
permeabilityCa
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
CfChannel
の変数
channel permeability for Ca2+
permeabilityCa
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
IRyR
の変数
membrane permeability
permeabilityCa
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
PMCA
の変数
factor to define the maximum PMCA current [pA/pF]
permeabilityCa
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
CfChannel
の変数
channel permeability for Ca2+
permeabilityCa
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.
Diffusion
の変数
membrane permeability for Ca2+
permeabilityCaMax
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.current.cf.
ICaL
の変数
maximum Ca permeability
permeabilityCl
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
CfChannel
の変数
channel permeability for Cl- [pA/pF/mM]
permeabilityCl
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
CfChannel
の変数
channel permeability for Cl- [pA/pF/mM]
permeabilityCl
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
IVRCC
の変数
converting factor for IVRCC [pA/pF/mM]
permeabilityCl
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.
Diffusion
の変数
membrane permeability for Cl-
permeabilityK
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
CfChannel
の変数
channel permeability for K+ [pA/pF/mM][pA/pF/mM]
permeabilityK
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.
Diffusion
の変数
membrane permeability for K+
permeabilityK
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium.
PureKchannel
の変数
channel permeability for potassium
permeabilityK
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
CfChannel
の変数
channel permeability for K+ [pA/pF/mM][pA/pF/mM]
permeabilityK
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
CfChannel
の変数
channel permeability for K+ [pA/pF/mM][pA/pF/mM]
permeabilityK
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
IClb
の変数
converting factor (conductance) for K+ background current [pA/pF/mM]
permeabilityK
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
INab
の変数
converting factor (conductance) for K+ background current [pA/pF/mM]
permeabilityK
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.
Diffusion
の変数
membrane permeability for K+
permeabilityK
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium.
PureKchannel
の変数
channel permeability for potassium
permeabilityK0
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
IKs
の変数
permeabilityK0
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
IKs
の変数
permeabilityNa
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
CfChannel
の変数
channel permeability for Na+ [pA/pF/mM]
permeabilityNa
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.
Diffusion
の変数
membrane permeability for Na+
permeabilityNa
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
CfChannel
の変数
channel permeability for Na+ [pA/pF/mM]
permeabilityNa
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
CfChannel
の変数
channel permeability for Na+ [pA/pF/mM]
permeabilityNa
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.
Diffusion
の変数
membrane permeability for Na+
pH
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.buffer.
HBuffering
の変数
a measure of the activity of hydrogen ions (H
+
) in a solution
pHcell
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
GradientpH
の変数
pH of cytosol
pHcell
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.Transporter.
PhosphateCarrier
の変数
pH in cytosol
Phi
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.
IK1
の変数
the proportion of the channels that are in the high-affinity mode (Mode1)
pHmit
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
GradientpH
の変数
pH of mitochondrial matrix
pHmito
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.Transporter.
PhosphateCarrier
の変数
pH in mitochondrial matrix
PhosphateCarrier
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.Transporter
の クラス
Phosphate Transporter.
PhosphateCarrier()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.Transporter.
PhosphateCarrier
のコンストラクタ
Phosphorylation
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
IKs
の変数
Phosphorylation
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.
IPMCA
の変数
Phosphorylation
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
IKs
の変数
Pi
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.
Troponinmit
の変数
Pi
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.
ICaPump
の変数
Pi
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.
INaK
の変数
Pi
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.
IPMCA
の変数
Pi
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.current.carrier.
INaK
の変数
Pi
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.buffer.Ca.
TroponinNL_RK
の変数
Pimit
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
ConcentrationPi
の変数
iorganic phosphate concentration in mitochondria
Pipette
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.pipette
の クラス
external current in the RC membrane model.
Pipette()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.pipette.
Pipette
のコンストラクタ
Pipette
-
org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.pipette
の クラス
external current in the RC membrane model.
Pipette()
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.pipette.
Pipette
のコンストラクタ
Pitcell
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.Transporter.
PhosphateCarrier
の変数
inorganic phosphate concentration in cytosol (mM)
Pitmito
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.
ATPsynthase
の変数
inorganic phosphate concentration in mitochondrial matrix
Pitmito
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.Transporter.
PhosphateCarrier
の変数
inorganic phosphate concentration in mitochondrial matrix (mM)
PiTotal
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
ConcentrationPi
の変数
total iorganic phosphate concentration in whole cell
Pk
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
ICaL
の変数
PK
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
ICaL
の変数
PK
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
ICaL
の変数
PKA
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
ICaL
の変数
PKA catalitic domain I concentration
PKA
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
IKs
の変数
PKA
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
Ist
の変数
PKA catalitic domain I concentration
PKA
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.
INaK
の変数
PKA phosphorylation parameter *
PKA
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.
IPMCA
の変数
PKA type I concentration (mM)
PKA
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
ICaL
の変数
PKA catalitic domain I concentration
PKA
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
ICFTR
の変数
PKA catalitic domain I concentration
PKA
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
IKs
の変数
PKA
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
BetaAR_Gs
の変数
PKA catalitic domain I
PKA
-
org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule
の クラス
PKA module.
PKA()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
PKA
のコンストラクタ
PKA
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
PKA
の変数
PKA concentration (mM)
PKA
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
PLB
の変数
PKA catalytic domain I concentration (mM)
pKa
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.Transporter.
PhosphateCarrier
の変数
acid dissociation constant
PKA0
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
ICaL
の変数
PKA0
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
Ist
の変数
PKA0
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
ICaL
の変数
PKA_fac
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
ICaL
の変数
PKA_fac
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
ICaL
の変数
PKACI_PKI
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
PKA
の変数
PKA and PKI complex concentration (mM)
PKAtot
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
IKs
の変数
PKAtot
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
IKs
の変数
PKAtot
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
PKA
の変数
PKI
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
PKA
の変数
protein kinase inhibitor (mM)
PKItot
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
PKA
の変数
pKNa
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.function.
ReversalPotential2
の変数
PKToPCa
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
ICaL
の変数
ratio of K
+
to Ca
2+
permeability
PLB
-
org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule
の クラス
Phospholamban module.
PLB()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
PLB
のコンストラクタ
PLB
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
PLB
の変数
PLB concentration (mM)
PLBItot
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
PLB
の変数
PLB total concentration (mM)
PLBp
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
PLB
の変数
phosphorylated PLB concentration (mM)
PLBphos
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.
ICaPump
の変数
ratio of phosphorylated fraction of phospholamban
PLBphos
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
PLB
の変数
percent of PLB phosphorylation
plot()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.
RateGraph
のメソッド
plot()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.
RateGraph_KA
のメソッド
plotAxis(Graphics2D, IPlot)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
Axis
のメソッド
軸グリッド・ラベルを描画する。
plotAxises(Axis, Axis)
- インタフェース org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.
ICanvas
のメソッド
plot axses and grids
plotAxises(Axis, Axis)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.
Viewer
のメソッド
plot axses and grids
PlotContour
-
org.simBio.sim.ps.view
の クラス
Plot 2D parameters space of the model.
plotDisplay
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
AbstractGraph
の変数
画面描画処理インスタンス
PlotDisplay
-
org.simBio.sim.analyzer.graph.plot
の クラス
画面用の描画処理を行うためのクラス.
PlotDisplay(AbstractGraph)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.plot.
PlotDisplay
のコンストラクタ
PlotDisplay.LegendItem
-
org.simBio.sim.analyzer.graph.plot
の クラス
凡例用の画面描画Itemクラス.
PlotDisplay.LegendItem()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.plot.
PlotDisplay.LegendItem
のコンストラクタ
PlotDisplay.TitleItem
-
org.simBio.sim.analyzer.graph.plot
の クラス
タイトル用の画面描画Itemクラス.
PlotDisplay.TitleItem()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.plot.
PlotDisplay.TitleItem
のコンストラクタ
PlotLine
-
org.simBio.sim.ps.view
の クラス
Plot parameters space of the model as line chart.
PlotLouncher
-
org.simBio.sim.ps.view
の クラス
ParameterSpaceの持っているデータをグラフ表示する。
PlotLouncher()
- クラス org.simBio.sim.ps.view.
PlotLouncher
のコンストラクタ
plotPrinter
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
AbstractGraph
の変数
印刷描画処理インスタンス
PlotPrinter
-
org.simBio.sim.analyzer.graph.plot
の クラス
印刷用の描画処理を行うためのクラス.
PlotPrinter(AbstractGraph)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.plot.
PlotPrinter
のコンストラクタ
PlotPrinter.LegendItem
-
org.simBio.sim.analyzer.graph.plot
の クラス
凡例用の印刷描画Itemクラス.
PlotPrinter.LegendItem()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.plot.
PlotPrinter.LegendItem
のコンストラクタ
PlotPrinter.TitleItem
-
org.simBio.sim.analyzer.graph.plot
の クラス
タイトル用の印刷描画Itemクラス.
PlotPrinter.TitleItem()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.plot.
PlotPrinter.TitleItem
のコンストラクタ
PlotTimeSeries
-
org.simBio.sim.ps.view
の クラス
Plot time series data of the model as line chart.
PMCA
-
org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current
の クラス
sarcolemmal Ca
2+
pump.
PMCA()
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
PMCA
のコンストラクタ
Pna
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
ICaL
の変数
PNa
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
ICaL
の変数
PNa
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
ICaL
の変数
PNaToPCa
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
ICaL
の変数
ratio of Na
+
to Ca
2+
permeability
pOpen
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
Current
の変数
POpen
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
IKs
の変数
POpen
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
ICFTR
の変数
open probability
POpen
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
IKs
の変数
pOpen
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
CfChannel
の変数
open probability
pOpen
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.channel.
Channel
の変数
open probability.
pOpen
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.channel.
IRyR
の変数
open state probability
pOpen
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium.
PureKchannel
の変数
open probability
pOpen
- クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.
JunctionalConductance
の変数
the mean open probability of the gates
pOpen
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
CfChannel
の変数
open probability
pOpen
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
CfChannel
の変数
open probability
POpen
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
ICFTR
の変数
open probability
POpen
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium.
IKr
の変数
pOpen
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium.
PureKchannel
の変数
open probability
Position_of_energy_barrier
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
INaCa
の変数
Positive
-
org.simBio.core.integrator
の クラス
keep the value positive.
Positive()
- クラス org.simBio.core.integrator.
Positive
のコンストラクタ
PositiveRK
-
org.simBio.core.integrator
の クラス
Keep the value positive, for Runge-Kutta.
PositiveRK()
- クラス org.simBio.core.integrator.
PositiveRK
のコンストラクタ
potassium_channel_g_K
- クラス org.simBio.bio.cor.
Hodgkin_huxley_squid_axon_1952_modified
の変数
potassium_channel_g_K (milliS_per_cm2).
potassium_channel_n_gate_n
- クラス org.simBio.bio.cor.
Hodgkin_huxley_squid_axon_1952_modified
の変数
potassium_channel_n_gate_n (dimensionless).
power
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function.
KoDependency_IK1
の変数
power
power
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
KoDependency
の変数
power
power
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.
KoDependency
の変数
power
power
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.
KoDependency2
の変数
power
PP1
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
PLB
の変数
protein phosphatase-1 concentration (mM)
PP1_Inhib1p
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
PLB
の変数
protein phosphatase-1 and phosphorylated inhibitor-1 complex concentration (mM)
PP1tot
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
PLB
の変数
total protein phosphatase 1 (mM)
ppu
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.
Axis
の変数
prefix_
- クラス org.simBio.sim.dm.exchange.
FileNameExchanger
の変数
prepare()
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
Cell
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
JSR
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
NSR
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.function.
StepChanger
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
ICaL
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
IKs
のメソッド
initialization for IKs.
prepare()
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.molecule.
CaBuffer_RK
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.kuratomi_et_al_2003.current.carrier.
INaCa
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.
ICaPump
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.
INaK
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.
IPMCA
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
ICaL
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
ICFTR
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
IKs
のメソッド
initialization for IKs.
prepare()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.
IRyR
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function.
Average
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function.
PA2MS
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
BetaAR_Gs
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
PKA
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
PLB
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.
ICaPump
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.
INaCa
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.
INaK
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
ICaL
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
INa
のメソッド
set reversal potential
prepare()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
Ito
のメソッド
set the initial value to permeability
prepare()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.channel.
IRyR
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.
MembraneTransporter
のメソッド
construct null current
prepare()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.pipette.
Pipette
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.pipette.
VoltageClamp
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium.
IKs
のメソッド
initialization for IKs
prepare()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
Current
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
Diffusion_t
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.
ODE
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.
TroponinNL
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.exp.
LChange
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.
Qpump
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.
Qrel
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.kinetics.
IndependentGate
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.kinetics.
MultiStateModel
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.kinetics.
RateConstantCaGate
のメソッド
Calculate forward and backward rate constants
prepare()
- クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.structure.
GapJunctionK
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2003.
ICaL
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2003.
Ist
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2003.
VoltageClamp
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.current.carrier.
IPMCA
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.current.cf.
ICaL
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.function.
Rate
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.sarai_noma_2004.fourState.
MonteCarlo
のメソッド
determine initial state of single channels Method determineInitialState.
prepare()
- クラス org.simBio.bio.sarai_noma_2004.fourState.
NaChannel
のメソッド
read initial values from GUI.
prepare()
- クラス org.simBio.bio.sarai_noma_2004.fourState.
ODE
のメソッド
read initial values from GUI.
prepare()
- クラス org.simBio.bio.sarai_noma_2004.
VoltageClamp
のメソッド
set membrane potential = holding potential
prepare()
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
IRyR
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.carrier.
INaK
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
ICaL
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
ILCCa
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
INa
のメソッド
set reversal potential
prepare()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
Ist
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
Ito
のメソッド
set the initial value of permeability
prepare()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.channel.
IRyR
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium.
IKs
のメソッド
set permeabilityNa using the ratio
prepare()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.experiment.
StepChanger
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.experiment.
StepChanger2
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.experiment.
TonicityChange
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.experiment.
VolumeRatio
のメソッド
Keep initial volume.
prepare()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.
Tonicity
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.
TotalVolume
のメソッド
Keep initial volume.
prepare()
- クラス org.simBio.core.
Component
のメソッド
prepare for integration.
prepare()
- クラス org.simBio.core.
Conductor
のメソッド
initialization for calculation.
prepare()
- クラス org.simBio.core.integrator.
RungeKutta
のメソッド
y_nの値の一時保管
prepare(double, double, double, double)
- クラス org.simBio.core.integrator.
RungeKuttaList
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.core.
Link
のメソッド
if parent Composite has a public double Field of the same name, set value of the Parameter linked.
prepare()
- クラス org.simBio.core.
Parameter
のメソッド
親が自分と同じ名前のpublic doubleを持っていれば、自分の値を設定する。
prepare(double, double, double, double)
- クラス org.simBio.core.
VariableList
のメソッド
call all Euler's start()
dt controlの閾値を設定し、全てのVariableのstart()を呼び出す。
prepare()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.csv.
ALaCarte
のメソッド
get targets to the list.
prepare()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.csv.
CsvMaker
のメソッド
Open csv file, write labels by MakeLabelLine().
prepare()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.csv.result.
ALaCarte
のメソッド
set targets to the list
書き出す対象をlistに登録。
prepare()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
AbstractGraph
のメソッド
Set link to the targets.
prepare()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
Axis
のメソッド
軸ラベルを表示するか否か及びラベル数値フォーマット形式を設定する。
prepare()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
BasicGraph
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
Graph
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.
Axis
のメソッド
set flag is plot label and set pattern of number format
軸ラベルを表示するか否か及びラベル数値フォーマット形式を設定する。
prepare()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.
AxisX
のメソッド
calculate scaling factor
prepare()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.
AxisXFix
のメソッド
calculate scaling factor
prepare()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.
AxisY
のメソッド
calculate scaling factor
prepare()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.
Graph
のメソッド
set link to the targets.
prepare()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.
RelationGraph
のメソッド
set link to the targets.
prepare()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
Viewer
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
AbstractMeasure
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
Amplitude
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
AmplitudeInCycle
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
APD
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
LeadPotential
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
PeakDetect
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
Sum
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
Vmax
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
VmaxTime
のメソッド
prepare()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.
StopWatch
のメソッド
prepareGetRange(long, long, int)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.results.
TimeSeriesValues
のメソッド
指定した系列、インデックス範囲のデータを、キャッシュに読み込む.
prepareLegend(Graphics2D, Rectangle, AttributeString[])
- インタフェース org.simBio.sim.analyzer.graph.plot.
IPlot
のメソッド
凡例描画の準備を行う.
prepareLegend(Graphics2D, Rectangle, AttributeString[])
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.plot.
PlotDisplay
のメソッド
prepareLegend(Graphics2D, Rectangle, AttributeString[])
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.plot.
PlotPrinter
のメソッド
prepareRepaint()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
AbstractGraph
のメソッド
prepareRepaint()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
Axis
のメソッド
When a region of a graph changes, this method is called before doRepaint().
prepareRepaint()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
Viewer
のメソッド
prepareRepaint()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.
VisualizeAnalyzer
のメソッド
再描画を準備する.
prepareTitle(Graphics2D, Rectangle, AttributeString)
- インタフェース org.simBio.sim.analyzer.graph.plot.
IPlot
のメソッド
タイトル描画の準備を行う.
prepareTitle(Graphics2D, Rectangle, AttributeString)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.plot.
PlotDisplay
のメソッド
prepareTitle(Graphics2D, Rectangle, AttributeString)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.plot.
PlotPrinter
のメソッド
PressureToConcentration
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function
の クラス
calculation of concentration of gas-molecule from partial pressure.
PressureToConcentration()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
PressureToConcentration
のコンストラクタ
previous
- クラス org.simBio.bio.function.
Analytic2state
の変数
print(Graphics, PageFormat, int)
- クラス org.simBio.sim.gui.
GUI.JPrintablePanel
のメソッド
print(JComponent, String)
- クラス org.simBio.sim.gui.
PrintGraph
の static メソッド
printAxises(Graphics2D, IPlot)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
AbstractGraph
のメソッド
Initialize graph area, and draw axes and grids.
printBackground(Graphics2D, IPlot)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
AbstractGraph
のメソッド
Draw background.
printComponent(Graphics)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
AbstractGraph
のメソッド
Graphの印刷用描画を行う.
printComponent(Graphics)
- インタフェース org.simBio.sim.analyzer.graph.
IViewer
のメソッド
printComponent(Graphics)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.
Viewer
のメソッド
printComponent(Graphics)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
Viewer
のメソッド
Viewerの印刷用描画を行う.
printComponent(Graphics)
- クラス org.simBio.sim.gui.
GUI.JPrintablePanel
のメソッド
printGraph(Graphics2D, IPlot)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
AbstractGraph
のメソッド
Draw graph.
printGraph(Graphics2D, IPlot)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
BasicGraph
のメソッド
PrintGraph
-
org.simBio.sim.gui
の クラス
グラフ印刷を行う.
PrintGraph()
- クラス org.simBio.sim.gui.
PrintGraph
のコンストラクタ
printLegend(Graphics2D, IPlot)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
AbstractGraph
のメソッド
Draw legend.
Probability
-
org.simBio.core.integrator
の クラス
Keep the value between 0 and 1.
Probability()
- クラス org.simBio.core.integrator.
Probability
のコンストラクタ
processingInstruction(String, String)
- クラス org.simBio.serialize.xml.
LogSax2
のメソッド
Reports processing instruction.
processWindowEvent(WindowEvent)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
OnScreen
のメソッド
ウィンドウが閉じられたときにカウンターを減らす。
Product
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
RedoxPotential
の変数
product and substrate concentrations of reaction
propertyFrameConfig
- クラス org.simBio.sim.gui.
Constant
の static 変数
プロパティファイルのJFrame設定のプレフィックス
propertyToolbarOrder
- クラス org.simBio.sim.gui.
Constant
の static 変数
プロパティファイルのツールバー順のプレフィックス
propertyTreeTableConfig
- クラス org.simBio.sim.gui.
Constant
の static 変数
プロパティファイルのJTreeTable設定のプレフィックス
protocol
- クラス org.simBio.sim.dm.
ProtocolParser
の変数
ProtocolParser
-
org.simBio.sim.dm
の クラス
Protocol XML-file parser.
ProtocolParser(InputStream)
- クラス org.simBio.sim.dm.
ProtocolParser
のコンストラクタ
ProtocolParser(Document)
- クラス org.simBio.sim.dm.
ProtocolParser
のコンストラクタ
Proton
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
Acidity
の変数
Proton
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.enzyme.
CK
の変数
proton concentration in cytosol
ProtonLeak
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.Transporter
の クラス
Proton leak from cytosol to intremitochondoria.
ProtonLeak()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.Transporter.
ProtonLeak
のコンストラクタ
pRP
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
ICaL
の変数
PR state probability for voltage-dependent gate
pRP
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
ICaL
の変数
PR state probability for voltage-dependent gate
pRP
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
ICaL
の変数
PR state probability for voltage-dependent gate
pRP
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
INa
の変数
RP state probability for voltage-dependent gate
pRP
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.current.cf.
ICaL
の変数
PR state probability for voltage-dependent gate
pRP
- クラス org.simBio.bio.sarai_noma_2004.fourState.
ODE
の変数
pRP
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
ICaL
の変数
PR state probability for voltage-dependent gate
pRP
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
ICaL
の変数
PR state probability for voltage-dependent gate
pRP
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
INa
の変数
RP state probability for voltage-dependent gate
Pspm
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.
IK1
の変数
the probability of being in the SPM block state
pU
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
ICaL
の変数
U state probability for calcium-dependent gate
pU
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
ICaL
の変数
U state probability for calcium-dependent gate
pU
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
ICaL
の変数
U state probability for calcium-dependent gate
pU
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.current.cf.
ICaL
の変数
U state probability for calcium-dependent gate
pU
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
ICaL
の変数
U state probability for Ca
2+
-dependent gate
pU
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
ICaL
の変数
U state probability for calcium-dependent gate
pUCa
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
ICaL
の変数
UCa state probability for calcium-dependent gate
pUCa
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
ICaL
の変数
UCa state probability for calcium-dependent gate
pUCa
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
ICaL
の変数
UCa state probability for calcium-dependent gate
pUCa
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.current.cf.
ICaL
の変数
UCa state probability for calcium-dependent gate
pUCa
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
ICaL
の変数
UCa state probability for Ca
2+
-dependent gate
pUCa
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
ICaL
の変数
UCa state probability for calcium-dependent gate
PureKchannel
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium
の クラス
calculate pure potassium channel current.
PureKchannel()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium.
PureKchannel
のコンストラクタ
PureKchannel
-
org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium
の クラス
calculate pure potassium channel current.
PureKchannel()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium.
PureKchannel
のコンストラクタ
pX
- クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.kinetics.
RateConstantCaGate
の変数
p[X].
概要
パッケージ
クラス
使用
階層ツリー
非推奨 API
索引
ヘルプ
前の文字
次の文字
フレームあり
フレームなし
すべてのクラス
A
B
C
D
E
F
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H
I
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K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
???(C) 2002-2007 ?????????????????????