A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z

R

R - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.ICaL の変数
 
R - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.IKs の変数
 
R - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.INaCa の変数
 
R - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.INaK の変数
 
R - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.ICab の変数
 
R - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.IK1 の変数
 
R - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.IKr の変数
 
R - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.IKs の変数
 
R - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.INa の変数
 
R - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.INab の変数
 
R - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.INaCa の変数
 
R - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.INaK の変数
 
R - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.Ito の変数
 
R - クラス org.simBio.bio.kuratomi_et_al_2003.current.carrier.INaCa の変数
gas constant default value is 8.3143[C*mV/K/mmol]
R - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.INaK の変数
gas constant default value is 8.3143[C*mV/K/mmol]
R - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.INaCa の変数
gas constant default value is 8.3143[C*mV/K/mmol]
R - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.INaK の変数
gas constant default value is 8.3143[C*mV/K/mmol]
R - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.ConstantField の変数
Gas constant
R - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.ReversalPotential の変数
Gas constant
R - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.Zvalue の変数
 
R - クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.exp.Model の変数
 
r - クラス org.simBio.bio.noble_et_al_1998.Model の変数
 
R - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.INaCa の変数
gas constant default value is 8.3143[C*mV/K/mmol]
R - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.carrier.INaCa の変数
 
R - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.carrier.INaK の変数
 
R - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.ICa の変数
 
r - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.Ito の変数
 
r - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.Ito_endo の変数
 
R - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.function.ReversalPotential2 の変数
 
r1 - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.Troponin の変数
 
r2 - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.Troponin の変数
adjusted by 2.5 * r1
radius - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.Cell の変数
 
ramda - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.INaK の変数
relative depth of access channel
ramda - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.INaK の変数
relative depth of access channel
Rate - org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.function の クラス
Rate.
Rate() - クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.function.Rate のコンストラクタ
 
RateConstant - org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function の クラス
function, c1/(c2*exp((x+c3)/c4)+c5*exp((x+c6)/c7))
RateConstant() - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.RateConstant のコンストラクタ
 
RateConstantCaGate - org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.kinetics の クラス
Calculate the forward and backward rate constans of two-state model by using time constant, pKd and Hill coefficient
RateConstantCaGate() - クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.kinetics.RateConstantCaGate のコンストラクタ
 
RateConstantK - org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function の クラス
 
RateConstantK() - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.RateConstantK のコンストラクタ
 
RateConstantVm - org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function の クラス
 
RateConstantVm() - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.RateConstantVm のコンストラクタ
 
RateGraph - org.simBio.sim.analyzer.graph.simple の クラス
sample graph for bio.function
RateGraph() - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.RateGraph のコンストラクタ
 
RateGraph_KA - org.simBio.sim.analyzer.graph.simple の クラス
sample graph for bio.function
RateGraph_KA() - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.RateGraph_KA のコンストラクタ
 
ratio - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.INaK の変数
 
ratio - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.Volume の変数
ratio
ratio - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.PartialPotential の変数
ratio of partial potential
ratio - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.VolumeRatio の変数
volume ratio
Ratio - org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.function の クラス
Ratio.
Ratio() - クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.function.Ratio のコンストラクタ
 
ratio - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.Volume の変数
ratio
ratio() - クラス org.simBio.sim.analyzer.StopWatch のメソッド
 
rbuffermito - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.ATPsynthase の変数
buffering capacity for proton in mitochondrial matrix
rbuffermito - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.OxidativePhosphorylation の変数
buffering capacity for proton in mitochondrial matrix
rbuffermito - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.Transporter.ANT の変数
buffering capacity for proton in mitochondrial matrix
rbuffermito - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.Transporter.PhosphateCarrier の変数
buffering capacity for proton in mitochondrial matrix
rbuffermito - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.Transporter.ProtonLeak の変数
buffering capacity for proton in mitochondrial matrix
RCI - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.PKA の変数
RCI concentration (mM)
Rcm - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.ConcentrationPi の変数
volume ratio between cytosol and mitochondrial matrix
Rcm - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.ATPsynthase の変数
ratio of cytosol volume and mitochondria volume
Rcm - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.OxidativePhosphorylation の変数
ratio of cytosol volume and mitochondria volume
Rcm - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.SubstrateDehydrogenation の変数
ratio of cytosol active volume and mitochondria volume
Rcm - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.Transporter.ANT の変数
ratio of cytosol volume and mitochondria volume
Rcm - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.Transporter.PhosphateCarrier の変数
ratio of cytosol volume and mitochondria volume
Rcm - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.Transporter.ProtonLeak の変数
ratio of cytosol volume and mitochondria volume
Reactor - org.simBio.core の クラス
set of equations.
Reactor() - クラス org.simBio.core.Reactor のコンストラクタ
 
ReactorList - org.simBio.core の クラス
List of the Reactors
ReactorList() - クラス org.simBio.core.ReactorList のコンストラクタ
 
reactors - クラス org.simBio.core.VariableList の変数
list of reactors
read() - インタフェース org.simBio.serialize.Serializer のメソッド
deserialize.
read() - クラス org.simBio.serialize.xml.XMLSerializer のメソッド
Deserialize from xml file.
read() - クラス org.simBio.sim.dm.util.StringInputStream のメソッド
 
readToolBarConfig(Properties, JFrame, String) - クラス org.simBio.sim.gui.toolKit.dndmenu.DnDJToolBar のメソッド
ツールバーの設定を Properties から復元する。
rebuild() - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.GraphReplotBuffer のメソッド
再描画バッファの再構築を行う. TimeSeriesValues オブジェクトから、Graph.AxisX で表示する時間の計算結果を、 取得し、内部の再描画バッファを再構築する。
rectangleBounds - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.plot.AbstractPlot の変数
 
rectanglePage - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.plot.AbstractPlot の変数
 
rectangleView - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.plot.AbstractPlot の変数
 
rectPrintableArea - クラス org.simBio.sim.gui.GUI.JPrintablePanel の変数
 
RedoxPotential - org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function の クラス
Calculation of the redox potential.
RedoxPotential() - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.RedoxPotential のコンストラクタ
 
RedoxPotentialCyta - org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function の クラス
Calculation of the redox potential of cytochrome a Ema = Emc + dP * (2 + 2 * u) / 2
RedoxPotentialCyta() - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.RedoxPotentialCyta のコンストラクタ
 
referenceHeight - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.Viewer の変数
 
referenceHeight - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.Viewer の変数
 
referenceWidth - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.Viewer の変数
 
referenceWidth - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.Viewer の変数
 
register(Map) - クラス org.simBio.util.taglets.EnOff の static メソッド
Register this Taglet.
register(Map) - クラス org.simBio.util.taglets.EnOn の static メソッド
Register this Taglet.
register(Map) - クラス org.simBio.util.taglets.JaOff の static メソッド
Register this Taglet.
register(Map) - クラス org.simBio.util.taglets.JaOn の static メソッド
Register this Taglet.
RelationGraph - org.simBio.sim.analyzer.graph の クラス
2D graph of relation between two parameters.
RelationGraph() - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.RelationGraph のコンストラクタ
 
RelationGraph - org.simBio.sim.analyzer.graph.simple の クラス
2D graph of relation between two parameters
RelationGraph() - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.RelationGraph のコンストラクタ
 
RelationGraph_LP - org.simBio.sim.analyzer.graph.simple の クラス
2D graph of relation between two parameters for org.simBio.sim.analyzer.measure.LeadPotential.
RelationGraph_LP() - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.RelationGraph_LP のコンストラクタ
 
relativeP - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.Ito の変数
relative permeability of sodium to potassium
relativePK - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.ILCCa の変数
ratio of K+ conductance to Na+ conductance
relativePK - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.Ist の変数
 
relativePNa - クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.IKs の変数
the permeability ratio of K+ and Na+
relativePNa - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.IKs の変数
the permeability ratio of K+ and Na+
relativePNa - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium.IKs の変数
the permeabilities ratio of K+ and Na+
relativePNa - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.Ito の変数
relative
relativePNa - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium.IKs の変数
the permeability ratio of K+ and Na+
Release - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.complex.SR の変数
 
Release - org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux の クラス
 
Release() - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.Release のコンストラクタ
 
Release - org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.flux の クラス
The calcium induced calcium release (CICR) current.
Release() - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.flux.Release のコンストラクタ
 
reload() - クラス org.simBio.sim.gui.toolKit.SimpleGUIFrameWork のメソッド
オープンしているファイルを再読み込みする。
remove(int) - クラス org.simBio.sim.gui.toolKit.dndmenu.DnDJToolBar のメソッド
ツールバーのボタンを削除する。
remove(Component) - クラス org.simBio.sim.gui.toolKit.dndmenu.DnDJToolBar のメソッド
ツールバーのボタンを削除する。
removeCalculationObserver(CalculationObserver) - クラス org.simBio.core.Conductor のメソッド
計算を開始・終了した時に、通知が行われる監視オブジェクトを削除します。
removeCellEditorListener(CellEditorListener) - クラス org.simBio.sim.gui.CheckedJTree.CheckedJTreeCellRenderer のメソッド
 
repaint() - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.Viewer のメソッド
 
repaint() - クラス org.simBio.sim.analyzer.VisualizeAnalyzer のメソッド
再描画パラメータの取り込みと、再描画を行う.
replotBuffer - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.Graph の変数
再描画バッファ
rerativePK - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.INa の変数
ratio of K+ conductance to Na+ conductance
rerativePK - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.INa の変数
ratio of K+ conductance to Na+ conductance
reset() - インタフェース org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.ICanvas のメソッド
get graphics and clear.
reset() - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.Viewer のメソッド
get graphics and clear.
reset() - クラス org.simBio.sim.analyzer.StopWatch のメソッド
 
reset() - クラス org.simBio.sim.dm.util.StringInputStream のメソッド
 
resetBuffer() - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.BasicGraph のメソッド
 
resetBuffer() - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.Graph のメソッド
Resets the screen state.
resetBuffer() - クラス org.simBio.sim.analyzer.VisualizeAnalyzer のメソッド
画面状態をリセットする.
resize(IPlot) - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.AbstractGraph のメソッド
現在の親ウィンドウの大きさに応じて、Graphサイズを再計算する.
resize(IPlot) - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.BasicGraph のメソッド
 
resize(IPlot) - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.Graph のメソッド
Recalculates the Graph size, based on the size of the parent window.
resolveEntity(String, String, String, String) - クラス org.simBio.serialize.xml.LogSax2 のメソッド
Maps references to external entities into input sources.
resolveEntity(String, String) - クラス org.simBio.serialize.xml.LogSax2 のメソッド
Calls the EntityResolver2 resolveEntity method.
resting - クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.APD の変数
 
Result - org.simBio.sim.ps の クラス
一つの結果には、 - パラメータの値 double[] - 評価値 double[] - 時系列データ XYSeriesCollection が含まれる。
Result() - クラス org.simBio.sim.ps.Result のコンストラクタ
 
ResultGenerator - org.simBio の クラス
Apply different protocols to a model, and change the parameters such as magnitude of the currents.
ResultGenerator() - クラス org.simBio.ResultGenerator のコンストラクタ
 
reversalPotential - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium.PureKchannel の変数
reversal potential
reversalPotential - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.RateConstantK の変数
 
ReversalPotential - org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function の クラス
calculate reversal potential of the specific ion.
ReversalPotential() - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.ReversalPotential のコンストラクタ
 
reversalPotential - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium.PureKchannel の変数
reversal potential
ReversalPotential2 - org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.function の クラス
calculate reversal potential of the specific Ion.
ReversalPotential2() - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.function.ReversalPotential2 のコンストラクタ
 
RG - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.BetaAR_Gs の変数
receptor-gs_protein complex concentration
rinfi - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.Ito の変数
 
rinfi - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.Ito_endo の変数
 
rNaCa - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.INaCa の変数
 
rtau - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.Ito の変数
 
rtau - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.Ito_endo の変数
 
run() - クラス org.simBio.core.Conductor のメソッド
main entry of this thread.
Run - org.simBio の クラス
Automatically calculates models.
Run() - クラス org.simBio.Run のコンストラクタ
 
RungeKutta - org.simBio.core.integrator の クラス
RungeKutta法で計算される変数
the variable calculated by RungeKutta method
RungeKutta() - クラス org.simBio.core.integrator.RungeKutta のコンストラクタ
 
RungeKuttaList - org.simBio.core.integrator の クラス
Runge-Kutta engine (& dt adjuster)
RungeKuttaList() - クラス org.simBio.core.integrator.RungeKuttaList のコンストラクタ
 
RunGUI - org.simBio の クラス
Main entry of simBio with GUI.
RunGUI() - クラス org.simBio.RunGUI のコンストラクタ
 
RyR - org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current の クラス
Calcium release channel on SR Faber GM, Rudy Y.
RyR() - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.RyR のコンストラクタ
 
ryr - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.JSR の変数
 

A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z
???(C) 2002-2007 ?????????????????????