A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z

T

T - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.ICaL の変数

T - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.IKs の変数

T - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.INaCa の変数

T - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.INaK の変数

T - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.ICab の変数

T - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.IK1 の変数

T - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.IKr の変数

T - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.IKs の変数

T - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.INa の変数

T - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.INab の変数

T - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.INaCa の変数

T - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.INaK の変数

T - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.Ito の変数

T - クラス org.simBio.bio.kuratomi_et_al_2003.current.carrier.INaCa の変数

absolute temperature[K]

T - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.Troponin の変数

T - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.INaK の変数

absolute temperature[K]

T - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.INaCa の変数

absolute temperature[K]

T - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.INaK の変数

absolute temperature[K]

T - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.ConstantField の変数

the absolute temperature (K)

t - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.Diffusion_t の変数

T - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.ReversalPotential の変数

the absolute temperature (K)

T - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.Zvalue の変数

T - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.INaCa の変数

absolute temperature [K]

T - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.carrier.INaCa の変数

T - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.carrier.INaK の変数

T - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.ICa の変数

T - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.function.ReversalPotential2 の変数

T - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.Tonicity の変数

extracellular fluid tonicity

t0 - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function.Average の変数

starting time

t0 - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.ICaPump の変数

a starting time point for calculation of ATPconsumingRate

t0 - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.INaK の変数

startTime of calculation

t0 - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.TroponinNL の変数

t0 - クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.Qrel の変数

t0 - クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.function.Rate の変数

starting time

t1 - クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.Qrel の変数

target - クラス org.simBio.bio.function.StepChanger の変数

値の設定先。

target - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function.Average の変数

target to sum

target - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.Diffusion の変数

target - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.Diffusion_a の変数

target - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.Diffusion_t の変数

target - クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.function.Rate の変数

target to sum

target - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.AbstractGraph の変数

描画対象となるNode (target X)

target - クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.Amplitude の変数

to analyze

target - クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.AmplitudeInCycle の変数

to analyze

target - クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.Limitter の変数

計測対象

target - クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.PeakDetect の変数

targetAttribute_ - クラス org.simBio.sim.dm.exchange.Exchanger の変数

targetName - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.AbstractGraph の変数

描画対象となるNode名 (page.Graph.target X)

targets_ - クラス org.simBio.sim.analyzer.csv.ALaCarte の変数

記録対象となっているNodeのList

targets_ - クラス org.simBio.sim.analyzer.csv.result.ALaCarte の変数

記録対象となっているNodeのList TODO graphコンポーネントと共通化する。

targetScale - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.AbstractGraph の変数

描画対象となるNodeの拡大倍率 (target X scale)

targetShortName - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.AbstractGraph の変数

描画対象となる短いNode名 (target X)

tau - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.function.Diffusion の変数

tau - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.Transfer の変数

(ms)

tau - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.Diffusion の変数

tau - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.Diffusion_a の変数

tau - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.Diffusion_t の変数

TCa - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.Troponin の変数

TCa - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.TroponinNL の変数

TCa - クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.exp.Model の変数

TCa - クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.Troponin の変数

TCaCB - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.CrossBridgeForce の変数

TCaCB - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.Troponin の変数

TCaCB - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.TroponinNL の変数

TCaCB - クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.CrossBridge の変数

TCaCB - クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.exp.Model の変数

TCaCB - クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.Troponin の変数

TCB - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.CrossBridgeForce の変数

TCB - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.Troponin の変数

TCB - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.TroponinNL の変数

TCB - クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.CrossBridge の変数

TCB - クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.exp.Model の変数

TCB - クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.Troponin の変数

Tchange - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.experiment.TonicityChange の変数

tonicity to change

Tension - クラス org.simBio.bio.noble_et_al_1998.Model の変数

test - クラス org.simBio.bio.sarai_noma_2004.VoltageClamp の変数

testPotential - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.pipette.VoltageClamp の変数

designated potential for simulation

thisGraph - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.AbstractGraph の変数

サブクラスから、このGraphにアクセスするための情報

threshold - クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.APDforSA の変数

活動電位と見なす閾値 (mV)

timeconstant - クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.kinetics.RateConstantCaGate の変数

time constant at a given pX (ms)

timeMax - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.results.TimeSeriesValues の変数

timeMin - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.results.TimeSeriesValues の変数

times - クラス org.simBio.bio.function.StepChanger の変数

値を設定する時間のリスト。

TimeSeriesSingle - org.simBio.sim.analyzer.graph.results の クラス

TimeSeriesValues の１系列をカプセル化するためのクラス.

TimeSeriesSingle(TimeSeriesValues, int, String, Component) - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.results.TimeSeriesSingle のコンストラクタ

時系列をカプセル化する。

TimeSeriesValues - org.simBio.sim.analyzer.graph.results の クラス

計算結果バッファ.

TimeSeriesValues(String) - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.results.TimeSeriesValues のコンストラクタ

コンストラクタ データファイル名を元に、テンポラリファイル名を決定する。

timeStep - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.RyR の変数

timeStep - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.pipette.VoltageClamp の変数

time step for integral calculation

timeStep - クラス org.simBio.core.Conductor の変数

time step of integration

TINY - インタフェース org.simBio.core.Variable の static 変数

現在値がこれ以下なら、dy/dt over yを0とする。

title - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.plot.AbstractPlot の変数

titleColor - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.Axis の変数

タイトルの色

titleFont - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.Axis の変数

タイトルのフォント

titleVersion - クラス org.simBio.sim.gui.Constant の static 変数

the version of the simBio, which should be the same as in build.xml.

TocParser - org.simBio.sim.ps.serialize の クラス

Write a table of contents in a XML.

TocParser(String) - クラス org.simBio.sim.ps.serialize.TocParser のコンストラクタ

TocReader - org.simBio.sim.ps.serialize の クラス

Writerで書き出したXMLをParameterSpaceに読み込ませる。

TocReader(ICollector) - クラス org.simBio.sim.ps.serialize.TocReader のコンストラクタ

TocWriter - org.simBio.sim.ps.serialize の クラス

ParameterSpaceにある結果データをXML形式で書き出す。

TocWriter(String) - クラス org.simBio.sim.ps.serialize.TocWriter のコンストラクタ

Tonicity - org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function の クラス

Tonicity of extracellular fluid .

Tonicity() - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.Tonicity のコンストラクタ

TonicityChange - org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.experiment の クラス

Change extracellular fluid tonicity

TonicityChange() - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.experiment.TonicityChange のコンストラクタ

ToolBarMente - org.simBio.sim.gui.toolKit.dndmenu の クラス

Drag&Dropツールバーのメンテナンスを行う.

ToolBarMente(JFrame, String) - クラス org.simBio.sim.gui.toolKit.dndmenu.ToolBarMente のコンストラクタ

This is the default constructor

toolBarPropertyFile - クラス org.simBio.sim.gui.Constant の static 変数

ツールバープロパティファイル名（ホームディレクトリ上）

toString() - クラス org.simBio.sim.gui.toolKit.dndmenu.DnDAction のメソッド

見出し文字列を文字列表現として得る JList に表示する際に、JListModel に DnDAction を格納した時、見出し文字列が表示されるように、 toString() をオーバーライドしました。

toString(Tag) - クラス org.simBio.util.taglets.EnOff のメソッド

Given the Tag representation of this custom tag, return its string representation.

toString(Tag) - クラス org.simBio.util.taglets.EnOn のメソッド

Given the Tag representation of this custom tag, return its string representation.

toString(Tag) - クラス org.simBio.util.taglets.JaOff のメソッド

Given the Tag representation of this custom tag, return its string representation.

toString(Tag) - クラス org.simBio.util.taglets.JaOn のメソッド

Given the Tag representation of this custom tag, return its string representation.

toString(Tag) - クラス org.simBio.util.taglets.Languages のメソッド

Given the Tag representation of this custom tag, return its string representation.

total - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.molecule.CaBuffer の変数

total - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter の変数

total - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.Volume の変数

total value

total - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Buffer の変数

Total concentration (mM)

total - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.ConcentrationCyta2 の変数

total concentration of cytochrome a

total - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.MassConservation の変数

total concentration

total - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.MassConservation2 の変数

total concentration

total - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.MetalFreeConcentration の変数

total concentration

total - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.PartialPotential の変数

membrane potential

total - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.Volume の変数

total value

Total - org.simBio.sim.analyzer.csv の クラス

writes values of all parameters, variables and nodes to csv file
親Reactor以下のTreeに存在する全てのReactorとParameterの値をcsv fileに書き出す

Total() - クラス org.simBio.sim.analyzer.csv.Total のコンストラクタ

TotalAdenosine - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function.ConcentrationAMP の変数

total adenosine concentration

totalAdenosine - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.complex.ATPsynthesis の変数

total adenosine concentration (= [ATP] + [ADP]) (mM).

totalanion - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.function.Electroneutrality の変数

amount of intracellular total anions [pEq]

totalcation - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.function.Electroneutrality の変数

amount of intracellular total cations [pEq]

TotalIonext - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.complex.WaterFlux の変数

sum of extracellular ionic concentration [mM]

TotalIonint - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.complex.WaterFlux の変数

sum of intracellular ionic concentration [mM]

totalTime - クラス org.simBio.sim.analyzer.StopWatch の変数

TotalVolume - org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function の クラス

Calculate total cell volume from cell volume accessible for ion diffusion.

TotalVolume() - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.TotalVolume のコンストラクタ

trans - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.JSR の変数

trans - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.NSR の変数

Transfer - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.complex.SR の変数

Transfer - org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux の クラス

Transfer() - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.Transfer のコンストラクタ

Troponin - org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction の クラス

troponin of Negroni and Lascano contraction model.

Troponin() - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.Troponin のコンストラクタ

troponin - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.enzyme.CrossBridgeNL の変数

Troponin - org.simBio.bio.negroni_lascano_1996 の クラス

Troponin state transition of Cardiac Muscle Model by Negroni and Lascano.

Troponin() - クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.Troponin のコンストラクタ

Troponinmit - org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction の クラス

Troponin state transition of Cardiac Muscle Model by Negroni and Lascano.

Troponinmit() - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.Troponinmit のコンストラクタ

TroponinNL - org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca の クラス

Troponin state transition of Cardiac Muscle Model by Negroni and Lascano.

TroponinNL() - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.TroponinNL のコンストラクタ

TroponinNL_RK - org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca の クラス

Troponin state transition of Negroni and Lascano contraction model for Runge-Kutta.

TroponinNL_RK() - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.TroponinNL_RK のコンストラクタ

TroponinNL_RK - org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.buffer.Ca の クラス

Troponin of Negroni and Lascano contraction model.

TroponinNL_RK() - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.buffer.Ca.TroponinNL_RK のコンストラクタ

trpnbar - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.molecule.DualCaBuffer の変数

Tt - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.Troponin の変数

Tt - クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.exp.Model の変数

TwoStateModel - org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.kinetics の クラス

Two-state model.

TwoStateModel() - クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.kinetics.TwoStateModel のコンストラクタ

TYPE_NAME - クラス org.simBio.sim.dm.exchange.FileNameExchanger の static 変数

TYPE_NAME - クラス org.simBio.sim.dm.exchange.IndexNameExchanger の static 変数

TYPE_NAME - クラス org.simBio.sim.dm.exchange.ListExchanger の static 変数

TYPE_NAME - クラス org.simBio.sim.dm.exchange.NullExchanger の static 変数

TYPE_NAME - クラス org.simBio.sim.dm.exchange.OneTimeListExchanger の static 変数

TYPE_NAME - クラス org.simBio.sim.dm.exchange.UniformRatioExchanger の static 変数

TYPE_NAME - クラス org.simBio.sim.dm.exchange.UniformValueExchanger の static 変数