A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z

C

c1 - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.INaCa の変数
 
c1 - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.RateConstant の変数
 
C1 - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.Iha の変数
 
c2 - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.INaCa の変数
 
c2 - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.RateConstant の変数
 
c2 - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.ComplexIV の変数
cytochrome c2+ (reduced) concentration
C2 - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.Iha の変数
 
c3 - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.RateConstant の変数
 
c4 - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.RateConstant の変数
 
c5 - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.RateConstant の変数
 
c6 - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.RateConstant の変数
 
c7 - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.RateConstant の変数
 
Ca - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.ICaL の変数
 
Ca - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.NSR の変数
 
Ca - クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.IKs の変数
intracellular Ca2+ concentration
Ca - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.molecule.CaBuffer_RK の変数
free Ca concentration (mM)
Ca - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.Troponin の変数
 
Ca - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.IKs の変数
intracellular Ca2+ concentration
Ca - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium.IKs の変数
intracellular Ca2+ concentration
Ca - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.Analytic の変数
 
Ca - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.Analytic_RK の変数
free calcium concentration (mM)
Ca - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.InstantCaBuffer の変数
 
Ca - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.ODE の変数
free Ca2+ concentration (mM)
Ca - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.TroponinNL の変数
 
Ca - クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.exp.Model の変数
 
Ca - クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.Qpump の変数
 
Ca - クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.Qrel の変数
 
Ca - クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.Troponin の変数
 
Ca - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.function.Electroneutrality の変数
concentration of intracellular Ca2+ [mM]
Ca - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium.IKs の変数
intracellular Ca2+ concentration
CaBuffer - org.simBio.bio.faber_rudy_2000.molecule の クラス
analytic equation of Calcium buffering.
CaBuffer() - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.molecule.CaBuffer のコンストラクタ
 
CaBuffer_RK - org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.molecule の クラス
Calculate using ordinary differential equation, working with analytic buffer.
CaBuffer_RK() - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.molecule.CaBuffer_RK のコンストラクタ
 
CaCalmod - クラス org.simBio.bio.noble_et_al_1998.Model の変数
 
CaCaM - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.IPMCA の変数
 
CachedBuffer - org.simBio.sim.analyzer.graph.results の クラス
キャッシュ機能付きの、時系列データバッファ.
CachedBuffer(File) - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.results.CachedBuffer のコンストラクタ
 
CaDiadic - クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.ICaL の変数
local Ca2+ concentration near the mouth of L-type Ca channel (mM)
CaDiadic - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.ICaL の変数
local Ca2+ concentration near the mouth of L-type Ca channel (mM)
CaDiadic - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.IRyR の変数
local Ca2+ concentration near the mouth of RyR channel.
CaDiadic - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.ICaL の変数
local Ca2+ concentration near the mouth of L-type Ca channel (mM)
CaDiadic - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.channel.IRyR の変数
local Ca2+ concentration near the mouth of RyR channel
CaDiadic - クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.current.cf.ICaL の変数
local Ca2+ concentration near the mouth of L-type Ca channel (mM)
CaDiadic - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.ICaL の変数
local Ca2+ concentration near the mouth of L-type Ca channel (mM)
CaDiadic - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.IRyR の変数
local Ca2+ concentration near the mouth of RyR channel
CaDiadic - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.ICaL の変数
local Ca2+ concentration near the mouth of L-type Ca channel (mM)
Cads - クラス org.simBio.bio.noble_et_al_1998.Model の変数
 
Caext - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.complex.WaterFlux の変数
concentration of extracellular Ca2+ [mM]
Caext - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.experiment.TonicityChange の変数
concentration of extracellular Ca2+ [mM]
Caext - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.Tonicity の変数
concentration of extracellular Ca2+ [mM]
CaFigure - org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.figure の クラス
Utility class to set figure parameters.
CaFigure() - クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.figure.CaFigure のコンストラクタ
 
Cafree - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.molecule.CaBuffer の変数
 
Cafree - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.molecule.DualCaBuffer の変数
 
Cai - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.ICaL の変数
 
Cai - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.IKs の変数
 
Cai - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.INaCa の変数
 
Cai - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.IpCa の変数
 
Cai - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.RyR の変数
 
Cai - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.SRCA の変数
 
Cai - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.JSR の変数
 
Cai - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.NSR の変数
 
Cai - クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.ICaL の変数
intracellular Ca2+ concentration (mM)
Cai - クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.Ist の変数
intracellular calcium concentration (mM)
Cai - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.complex.SR の変数
 
Cai - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.ICab の変数
 
Cai - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.ICaL の変数
 
Cai - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.INaCa の変数
 
Cai - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.IpCa の変数
 
Cai - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.Leak の変数
[Ca]i (mM)
Cai - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.Release の変数
 
Cai - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.Uptake の変数
[Ca2+]i (mM)
Cai - クラス org.simBio.bio.kuratomi_et_al_2003.current.carrier.INaCa の変数
concentration of intracellular Calcium[mM]
Cai - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.ICaPump の変数
Ca2+ concentration in cytoplasm (mM)
Cai - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.IPMCA の変数
Ca2+ concentration in cytoplasm (mM)
Cai - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.ICaL の変数
intracellular Ca2+ concentration (mM)
Cai - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.IRyR の変数
intracellular calcium concentration (mM)
Cai - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.ICaPump の変数
Ca2+ concentration in cytoplasm (mM)
Cai - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.INaCa の変数
concentration of intracellular Calcium[mM]
Cai - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.ICaL の変数
intracellular calcium concentration (mM)
Cai - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.ILCCa の変数
intracellular calcium concentration (mM)
Cai - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.Ist の変数
intracellular calcium concentration (mM)
Cai - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.channel.IRyR の変数
intracellular calcium concentration (mM)
Cai - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.Diffusion の変数
concentration of intracellular Ca2+ [mM]
Cai - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.TroponinNL の変数
 
Cai - クラス org.simBio.bio.noble_et_al_1998.Model の変数
 
Cai - クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.current.carrier.IPMCA の変数
Ca2+ concentration in cytoplasm (mM)
Cai - クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.current.cf.ICaL の変数
intracellular calcium concentration (mM)
Cai - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.ICaL の変数
intracellular Ca2+ concentration (mM)
Cai - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.INaCa の変数
concentration of intracellular Ca2+ [mM]
Cai - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.IRyR の変数
intracellular calcium concentration (mM)
Cai - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.PMCA の変数
concentration of intracellular Ca2+ [mM]
Cai - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.complex.SR の変数
 
Cai - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.carrier.INaCa の変数
 
Cai - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.ICa の変数
 
Cai - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.IpCa の変数
 
Cai - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.flux.Leak の変数
 
Cai - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.flux.Release の変数
 
Cai - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.flux.UpTake の変数
 
Cai - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.ICaL の変数
intracellular Ca2+ concentration (mM)
Cai - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.ILCCa の変数
intracellular calcium concentration (mM)
Cai - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.Ist の変数
 
Cai - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.Diffusion の変数
concentration of intracellular Ca2+ [mM]
Cainitial - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.experiment.TonicityChange の変数
concentration of initial extracellular Ca2+ [mM]
Caint - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.complex.WaterFlux の変数
concentration of intracellular Ca2+ [mM]
Caj - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.Transfer の変数
[Ca2+]rel (mM)
calcCurrent(double) - クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.LeadPotential のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.Compartment のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.cor.Hodgkin_huxley_squid_axon_1952_modified のメソッド
Computation.
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.cor.Vanderpol_model_1928 のメソッド
Computation.
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.Current のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.ICaL のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.ICaT のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.IK1 のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.IKpl のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.IKr のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.IKs のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.INa のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.INaCa のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.INaK のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.IpCa のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.NSRLeak のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.RyR のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.SRCA のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.function.Diffusion のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.function.Stimulus のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.molecule.CaBuffer のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.molecule.DualCaBuffer のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.Cell のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.JSR のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.NSR のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.function.Analytic2state のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.function.StepChanger のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.henriquez_et_al_2001.GapJunction のメソッド
calculate the unitary gap junction conductance (pS) which depends on transjunctional voltage
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.ICaL のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.Iha のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.IKACh のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.IKs のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.Ist のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.hodgkin_huxley_1952.I_K のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.hodgkin_huxley_1952.I_L のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.hodgkin_huxley_1952.I_Na のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.hodgkin_huxley_1952.I_stim のメソッド
apply stimulus current.
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.hodgkin_huxley_1952.Membrane のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.complex.SR のメソッド
convert current (pA) to d[X]/dt (mM)
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.ICab のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.ICaL のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.IK1 のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.IKr のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.IKs のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.INa のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.INab のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.INaCa のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.INaK のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.IpCa のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.Ito のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.Leak のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.Release のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.Transfer のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.Uptake のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.molecule.CaBuffer_RK のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kuratomi_et_al_2003.current.carrier.Carrier のメソッド
calculate total charge movement using reduced 2 state model
2 state gateを用いて電流を計算する
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kuratomi_et_al_2003.current.carrier.INaCa のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.CrossBridgeLength のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.IsotonicContraction のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.Troponin のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.Troponinmit のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.ICaPump のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.INaK のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.IPMCA のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.ICaL のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.ICFTR のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.IKs のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.IK1 のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.IRyR のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function.Average のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function.ConcentrationAMP のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function.KoDependency_IK1 のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function.PA2MS のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.BetaAR_Gs のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.CAMP のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.PKA のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.PLB のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.Compartment のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.complex.ATPsynthesis のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.Carrier のメソッド
calculate total charge movement using reduced 2 state model
2 state gateを用いて電流を計算する
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.ICaPump のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.INaCa のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.INaK のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.CfChannel のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.ICaL のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.ICaT のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.Iha のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.IKpl のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.ILCCa のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.INa のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.Ist のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.Ito のメソッド
calculate transient outward current at time t
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.channel.IRyR のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.Diffusion のメソッド
current = permeability * concentration gradient (in - out)
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter のメソッド
Compartmentの電流に足し合わせる。
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.pipette.CurrentClamp のメソッド
apply stimulus pulsatile current
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.pipette.VoltageClamp のメソッド
to keep Vm constant, Iext is applied.
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium.IK1 のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium.IKACh のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium.IKATP のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium.IKr のメソッド
Calculate current
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium.IKs のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium.PureKchannel のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.Charge のメソッド
dVm/dt = - I / Cm
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.ConstantField のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.Current のメソッド
convert current (pA) to d[X]/dt (mM)
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.Diffusion のメソッド
dy/dt = (inf - y)/ tau
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.Diffusion_a のメソッド
y = inf -(inf - y_old) * exp(-t/tau)
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.Diffusion_t のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.KoDependency のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.RateConstant のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.RateConstantK のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.RateConstantVm のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.ReversalPotential のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.Volume のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.Analytic のメソッド
instantaneous equiribrium
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.Analytic_RK のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.InstantCaBuffer のメソッド
instantaneous equiribrium is iteratively calculated.
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.ODE のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.TroponinNL のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.TroponinNL_RK のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.enzyme.CrossBridgeNL のメソッド
calculate the rate of change in the cross bridge length, dX/dt
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.enzyme.IsometricContraction のメソッド
calculate the tension without contraction (isometric contraction)
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.enzyme.IsotonicContraction のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.current.carrier.ICaPump のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.current.carrier.INaK のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.exp.Anoxia のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.Acidity のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.chemical.CN のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.chemical.FCCP のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.ConcentrationAMP のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.ConcentrationCyta2 のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.ConcentrationPi のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.GradientP のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.GradientpH のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.MassConservation のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.MassConservation2 のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.MembranePotential のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.MetalFreeConcentration のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.PartialPotential のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.PressureToConcentration のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.RedoxPotential のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.RedoxPotentialCyta のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.VolumeRatio のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.Zvalue のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.buffer.Ca.TroponinNL_RK のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.buffer.HBuffering のメソッド
calculate and set the value of rbuffer.
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.Diffusion のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.enzyme.AK のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.enzyme.CK のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.ATPsynthase のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.ComplexI のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.ComplexIII のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.ComplexIV のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.OxidativePhosphorylation のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.SubstrateDehydrogenation のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.Transporter.ANT のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.Transporter.PhosphateCarrier のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.Transporter.ProtonLeak のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.CrossBridge のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.exp.IsotonicContraction のメソッド
set force equilibrated length.
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.exp.LChange のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.exp.Model のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.Qpump のメソッド
Qpump=Kp/(1+(Km/[Ca2+])^2)
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.Qrel のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.Troponin のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.noble_et_al_1998.Model のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.JunctionalConductance のメソッド
Calculate the junctional conductance (nS) using by Gj=N*gj*pOpen.
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.JunctionalPotential のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.kinetics.IndependentGate のメソッド
Calculate the open probability.
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.kinetics.MultiStateModel のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.kinetics.RateConstantCaGate のメソッド
Nothing performed
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.kinetics.TwoStateModel のメソッド
Calculate the open probability
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.structure.GapJunction のメソッド
Calculate the gap junctional current (pA)
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.structure.GapJunctionK のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.parabola のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2003.VoltageClamp のメソッド
SA nodeモデルでVmが設定値になったらVoltage Clampを開始する。
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.current.carrier.IPMCA のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.current.cf.ICaL のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.function.Rate のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.function.Ratio のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.sarai_noma_2004.fourState.MonteCarlo のメソッド
calculate single channels' state transition
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.sarai_noma_2004.fourState.NaChannel のメソッド
calculate state probability by ODE.
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.sarai_noma_2004.fourState.ODE のメソッド
calculate state probability by ODE.
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.sarai_noma_2004.structure.GapJunction のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.sarai_noma_2004.VoltageClamp のメソッド
apply square voltage pulse
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.CfChannel のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.ICaL のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.INaCa のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.IRyR のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.PMCA のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.function.Electroneutrality のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.function.ENaCa のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.function.Ouabain のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.complex.SR のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.carrier.Carrier のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.carrier.INaCa のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.carrier.INaK のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.IbCa のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.IbNa のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.ICa のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.IK1 のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.IKr のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.IKs のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.INa のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.IpCa のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.IpK のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.Ito のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.Ito_endo のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.pipette.CurrentClamp のメソッド
apply stimulus pulsatile current
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.flux.Leak のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.flux.Release のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.flux.UpTake のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.function.Charge のメソッド
dVm/dt = - I / Cm
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.function.Current のメソッド
convert current (pA) to d[X]/dt (mM)
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.function.ReversalPotential2 のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.complex.WaterFlux のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.carrier.NKCC のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.CfChannel のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.ICaL のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.ICaT のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.ICFTR のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.IClb のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.Iha のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.IKpl のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.ILCCa のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.INa のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.INab のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.Ist のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.Ito のメソッド
calculate transient outward current at time t
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.IVRCC のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.Diffusion のメソッド
current = permeability * concentration gradient (in - out)
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.MembraneTransporter のメソッド
CompartmentのCl電流に足し合わせる。
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium.IK1 のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium.IKATP のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium.IKr のメソッド
Calculate current
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium.IKs のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium.PureKchannel のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.experiment.StepChanger のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.experiment.StepChanger2 のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.experiment.TonicityChange のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.experiment.VolumeRatio のメソッド
calculate value = Vt ratio.
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.AmplitudeNaK のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.KoDependency のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.KoDependency2 のメソッド
!!
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.Tonicity のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.TotalVolume のメソッド
calculate value = Vt.
calculate(double) - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.Volume のメソッド
 
calculate(double) - クラス org.simBio.core.Conductor のメソッド
call calculate(double t) of the every Reactor.
calculate(double) - クラス org.simBio.core.Reactor のメソッド
write equations here, and calculate dy over dt.
calculate(double) - クラス org.simBio.core.ReactorList のメソッド
clear value of All Reactors, and call calculate() of All Reactors
IResetBeforeCalcをimplimentsしているクラスの値をゼロにリセットした後、 全てのReactorのcalculate()を呼び出す。
calculate() - クラス org.simBio.util.numerical.MathFunction のメソッド
The object's own value should be setted in this method.
CalculationObserver - org.simBio.core の インタフェース
Conductor が計算を開始・終了した時に、監視オブジェクトに通知を行います。
CaLvsPMCAwoNCX - org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.figure の クラス
Make Fig. 3C in Sarai et al. 2006 Visualize Ca max and min.
CaLvsPMCAwoNCX() - クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.figure.CaLvsPMCAwoNCX のコンストラクタ
 
cAMP - クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.Iha の変数
cAMP concentration
cAMP - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function.ConcentrationAMP の変数
 
CAMP - org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule の クラス
cAMP module.
CAMP() - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.CAMP のコンストラクタ
 
cAMP - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.CAMP の変数
Phosphodiesterase concentration (mM)
cAMP - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.PKA の変数
cAMP concentration (mM)
cAMP - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.ICFTR の変数
concentration of intracellular cAMP [mM]
cAMP0 - クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.Iha の変数
 
cAMP_Vshift - クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.Iha の変数
 
cAMPtot - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.CAMP の変数
total cAMP concentration (mM)
cAMPtot - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.PKA の変数
total cAMP concentration (mM)
Can - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.Transfer の変数
[Ca2+]up (mM)
cancelCellEditing() - クラス org.simBio.sim.gui.CheckedJTree.CheckedJTreeCellRenderer のメソッド
 
canImport(JComponent, DataFlavor[]) - クラス org.simBio.sim.gui.toolKit.dndmenu.DnDTransferHandler のメソッド
ドロップ用: TransferableActionがドラッグされようとしてきた場合のみ、true を返す
Cao - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.ICaL の変数
 
Cao - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.INaCa の変数
 
Cao - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.ICab の変数
 
Cao - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.INaCa の変数
 
Cao - クラス org.simBio.bio.kuratomi_et_al_2003.current.carrier.INaCa の変数
concentration of intracellular Calcium[mM]
Cao - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.ICaPump の変数
Ca2+ concentration in SR (mM, uptake site compartment)
Cao - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.IPMCA の変数
Ca2+ concentration in external solution (mM)
Cao - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.IRyR の変数
calcium concentration in SR release site (mM)
Cao - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.ICaPump の変数
Ca2+ concentration in SR (mM, uptake site compartment)
Cao - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.INaCa の変数
concentration of intracellular Calcium[mM]
Cao - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.channel.IRyR の変数
extracellular calcium concentration (mM)
Cao - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.Diffusion の変数
concentration of extracellular Ca2+ [mM]
Cao - クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.current.carrier.IPMCA の変数
Ca2+ concentration in external solution (mM)
Cao - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.INaCa の変数
concentration of extracellular Ca2+ [mM]
Cao - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.carrier.INaCa の変数
 
Cao - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.ICa の変数
 
Cao - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.Diffusion の変数
concentration of extracellular Ca2+ [mM]
Carel - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.Release の変数
 
Carel - クラス org.simBio.bio.noble_et_al_1998.Model の変数
 
Carel - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.IRyR の変数
calcium concentration in SR rel (mM)
CarelTotal - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.complex.SR の変数
 
CaRest - クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.Qrel の変数
 
Carrier - org.simBio.bio.kuratomi_et_al_2003.current.carrier の クラス
Abstract class for ping-pong model of the carrier.
Carrier() - クラス org.simBio.bio.kuratomi_et_al_2003.current.carrier.Carrier のコンストラクタ
 
Carrier - org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier の クラス
Abstract class for ping-pong model of the carrier.
Carrier() - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.Carrier のコンストラクタ
 
Carrier - org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.carrier の クラス
abstract of ion carrier
Carrier() - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.carrier.Carrier のコンストラクタ
 
Casr - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.NSRLeak の変数
 
Casr - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.RyR の変数
 
Casr - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.flux.Leak の変数
 
Casr - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.flux.Release の変数
 
Catotal - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.molecule.CaBuffer の変数
 
Catotal - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.molecule.DualCaBuffer の変数
 
CaTotal - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.Cell の変数
 
CaTotal - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.JSR の変数
 
CaTotal - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.molecule.CaBuffer_RK の変数
total Ca concentration (mM)
CaTotal - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.Troponin の変数
 
CaTotal - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.Analytic_RK の変数
total calcium concentration (free calcium + buffered calcium + influx/efflux calcium) (mM)
CaTotal - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.TroponinNL_RK の変数
total Ca concentration
CaTotal - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.complex.SR の変数
 
CaTrop - クラス org.simBio.bio.noble_et_al_1998.Model の変数
 
Caup - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.complex.SR の変数
 
Caup - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.Leak の変数
[Ca]up (mM)
Caup - クラス org.simBio.bio.noble_et_al_1998.Model の変数
 
cbuffer - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.buffer.HBuffering の変数
Buffering capacity for H+ (cbuffer). 22.0 (mM Proton / pH) in matrix, 25.0 (mM Proton / pH) in cytosol.
cCa - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter の変数
 
CCa - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter の変数
to see Ca current component
CCa - クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.LeadPotential の変数
 
cCl - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.MembraneTransporter の変数
Cl component (pA)
CCl - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.MembraneTransporter の変数
to see Cl current component
CCl - クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.LeadPotential の変数
 
Cell - org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure の クラス
Cell.
Cell() - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.Cell のコンストラクタ
 
CfChannel - org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf の クラス
calculate current component of Na, K, Ca ion according to the constant field theory.
CfChannel() - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.CfChannel のコンストラクタ
 
CfChannel - org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current の クラス
calculate current component of Na, K, Ca, and Cl ion according to the constant field theory.
CfChannel() - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.CfChannel のコンストラクタ
 
CfChannel - org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf の クラス
calculate current component of Na, K, Ca, and Cl ion according to the constant field theory.
CfChannel() - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.CfChannel のコンストラクタ
 
change() - クラス org.simBio.sim.dm.ParameterChanger のメソッド
 
changeScale() - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.AbstractGraph のメソッド
表示位置/表示範囲が更新された際に、再描画に必要な準備を行う. 現在は、Viewerの同名メソッドを呼び出している。
changeScale() - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.Graph のメソッド
Makes the necessary preparations for redrawing, when the display position / display range has changed
changeScale() - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.Viewer のメソッド
表示位置/表示範囲が更新された際に、再描画に必要な準備を行う. 現在は、repaint() に処理を任せている。
Channel - org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.channel の クラス
template of Channel.
Channel() - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.channel.Channel のコンストラクタ
 
characters(char[], int, int) - クラス org.simBio.serialize.xml.LogSax2 のメソッド
Logs character data when debugging.
characters(char[], int, int) - クラス org.simBio.sim.ps.serialize.TocReader のメソッド
 
Charge - org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function の クラス
keep whole cell current from external solution.
Charge() - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.Charge のコンストラクタ
 
Charge - org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.function の クラス
keep whole cell current from external solution.
Charge() - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.function.Charge のコンストラクタ
 
CheckedJTree - org.simBio.sim.gui の クラス
チェックボックスによる選択機能を持ったJTree.
CheckedJTree(TreeModel) - クラス org.simBio.sim.gui.CheckedJTree のコンストラクタ
 
CheckedJTree.CheckedJTreeCellRenderer - org.simBio.sim.gui の クラス
チェック付きのTreeCellRenderer/TreeCellEditor.
CheckedJTree.CheckedJTreeCellRenderer() - クラス org.simBio.sim.gui.CheckedJTree.CheckedJTreeCellRenderer のコンストラクタ
コンストラクタ.
CheckedJTree.CheckedJTreeCellRenderer(LayoutManager, boolean) - クラス org.simBio.sim.gui.CheckedJTree.CheckedJTreeCellRenderer のコンストラクタ
推奨されていません。  
CheckedJTreeModel - org.simBio.sim.gui の インタフェース
CheckedJTree用の TreeModel.
checkException() - クラス org.simBio.core.Conductor のメソッド
Check if this thread has thrown an exception.
childExchanger_ - クラス org.simBio.sim.dm.exchange.Exchanger の変数
 
CICRfactor - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.IRyR の変数
 
cK - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter の変数
 
CK - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter の変数
to see K current component
CK - org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.enzyme の クラス
Creatine Kinase (CK) System.
CK() - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.enzyme.CK のコンストラクタ
 
CK - クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.LeadPotential の変数
 
Cl - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.function.Electroneutrality の変数
concentration of intracellular Cl- [mM]
CLASS_NAME - クラス org.simBio.core.Initializer の static 変数
attribute name of the class
clear() - クラス org.simBio.core.Initializer のメソッド
clear all attributes.
clear() - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.results.CachedBuffer のメソッド
バッファの内容をクリアする.
Clext - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.complex.WaterFlux の変数
concentration of extracellular Cl- [mM]
Clext - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.experiment.TonicityChange の変数
concentration of extracellular Cl- [mM]
Clext - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.Tonicity の変数
concentration of extracellular Cl- [mM]
ClFlux - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.carrier.NKCC の変数
Cl- current carried by NKCC1 [pA]
Cli - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.carrier.NKCC の変数
concentration of intracellular Cl- [mM]
Cli - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.Diffusion の変数
concentration of intracellular Cl- [mM]
Clinitial - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.experiment.TonicityChange の変数
concentration of initial extracellular Cl- [mM]
Clint - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.complex.WaterFlux の変数
concentration of intracellular Cl- [mM]
ClKratio - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.IClb の変数
ratio of Cl- conductance to K+ conductance
Clo - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.carrier.NKCC の変数
concentration of extracellular Cl- [mM]
Clo - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.Diffusion の変数
concentration of extracellular Cl- [mM]
close - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.IRyR の変数
close state probability
close - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.channel.IRyR の変数
close state probability
close - クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.kinetics.MultiStateModel の変数
closed state probability
close - クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.kinetics.TwoStateModel の変数
closed state probability
close - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.IRyR の変数
close state probability
close() - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.results.CachedBuffer のメソッド
インスタンスを使用終了し、バッファファイルを開放する.
close() - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.results.TimeSeriesValues のメソッド
インスタンスを使用終了し、バッファファイルを開放する.
close() - クラス org.simBio.sim.dm.util.StringInputStream のメソッド
 
close() - クラス org.simBio.sim.gui.toolKit.SimpleGUIFrameWork のメソッド
クローズする ファイルが読み込まれなくてもク終了時のローズされることがあるので、 状態遷移エラーは発生させない。
closedState1 - クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.Iha の変数
 
closedState1 - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.Iha の変数
 
closedState2 - クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.Iha の変数
 
closedState2 - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.Iha の変数
 
Cm - クラス org.simBio.bio.hodgkin_huxley_1952.Membrane の変数
membrane capacitance, initial value = 1.0 (microF_per_cm2)
Cm - クラス org.simBio.bio.kuratomi_et_al_2003.current.carrier.Carrier の変数
membrane capacitance (pF)
Cm - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.IRyR の変数
membrane capacitance (pF)
Cm - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.Carrier の変数
membrane capacitance (pF)
Cm - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.pipette.VoltageClamp の変数
membrane capacitance
Cm - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.Charge の変数
membrane capacitance (pF)
Cm - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.KoDependency の変数
membrane capacitance
Cm - クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2003.VoltageClamp の変数
membrane capacitance (pF)
Cm - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.CfChannel の変数
membrane capacitance [pF]
Cm - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.INaCa の変数
membrane capacitance [pF]
Cm - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.IRyR の変数
membrane capacitance (pF)
Cm - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.PMCA の変数
membrane capacitance [pF]
Cm - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.function.Current の変数
 
Cm - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.complex.WaterFlux の変数
membrane capacitance [pF]
Cm - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.CfChannel の変数
membrane capacitance [pF]
Cm - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.channel.IRyR の変数
membrane capacitance (pF)
Cm - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.Diffusion の変数
membrane capacitance [pF]
Cm - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium.PureKchannel の変数
 
Cm - クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.Vmax の変数
 
Cm - クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.VmaxTime の変数
membrane capacitance (pS)
Cm1 - クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.structure.GapJunction の変数
membrane capacitance of cell #1 (pF)
Cm1 - クラス org.simBio.bio.sarai_noma_2004.structure.GapJunction の変数
membrane capacitance of cell #1
Cm2 - クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.structure.GapJunction の変数
membrane capacitance of cell #2 (pS)
Cm2 - クラス org.simBio.bio.sarai_noma_2004.structure.GapJunction の変数
membrane capacitance of cell #2
cmdnbar - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.molecule.DualCaBuffer の変数
 
CN - org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.chemical の クラス
effect of CN addition.
CN() - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.chemical.CN のコンストラクタ
 
CN - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.chemical.CN の変数
cyanide concentration
cNa - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter の変数
 
CNa - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter の変数
to see Na current component
CNa - クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.LeadPotential の変数
 
collapseAll() - クラス org.simBio.sim.gui.JTreeTableSimBio のメソッド
TreeTableの階層全体を収納する。
Collector - org.simBio.serialize の クラス
Make a List of all the Node values in the model tree.
Collector(Component, List) - クラス org.simBio.serialize.Collector のコンストラクタ
Collect values.
collectXMLs() - クラス org.simBio.sim.ps.serialize.ParseXMLs のメソッド
Check if XML-files should be collected in purpose to write a table of contents in a CSV- and a XML-file.
ColorUtil - org.simBio.sim.analyzer.graph の クラス
色関係のユーティティクラス.
ColorUtil() - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.ColorUtil のコンストラクタ
 
comment(char[], int, int) - クラス org.simBio.serialize.xml.LogSax2 のメソッド
Logs comments when debugging.
Compartment - org.simBio.bio の クラス
Nodes folder, contain no equation.
Compartment() - クラス org.simBio.bio.Compartment のコンストラクタ
 
Compartment - org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003 の クラス
This class is used for Nodes folder, contain no equation.
Compartment() - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.Compartment のコンストラクタ
 
ComplexI - org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain の クラス
NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I).
ComplexI() - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.ComplexI のコンストラクタ
 
ComplexIII - org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain の クラス
Cytochrome bc1 Complex (complex III).
ComplexIII() - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.ComplexIII のコンストラクタ
 
ComplexIV - org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain の クラス
Cytochrome c Oxidase (complex IV).
ComplexIV() - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.ComplexIV のコンストラクタ
 
compliance - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.IVRCC の変数
compliance of membrane
Component - org.simBio.core の クラス
super class of the core package, similar to public String, Component of the Composite Pattern.
Component() - クラス org.simBio.core.Component のコンストラクタ
 
Composer - org.simBio の クラス
Compose model part xmls into a composed model xml.
Composer() - クラス org.simBio.Composer のコンストラクタ
 
Composite - org.simBio.core の クラス
Composite Pattern.
Composite() - クラス org.simBio.core.Composite のコンストラクタ
 
Concentration - org.simBio.core.integrator の クラス
The amount of ion (or molecule) is hold as value.
Concentration() - クラス org.simBio.core.integrator.Concentration のコンストラクタ
 
ConcentrationAMP - org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function の クラス
calculation of AMP concentration (conformed to mass conservation law).
ConcentrationAMP() - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function.ConcentrationAMP のコンストラクタ
 
ConcentrationAMP - org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function の クラス
calculation of AMP concentration (conformed to mass conservation law) [Adenosine]total_cell = [ATP]cell + [ADP]cell + [AMP] [AMP] = [Adenosine]total_cell - [ATP]cell - [ADP]cell
ConcentrationAMP() - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.ConcentrationAMP のコンストラクタ
 
ConcentrationCyta2 - org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function の クラス
Calculation of the concentration of Cytochrome a2+ [Cyt a2+] = [Cyt a]total/(1 + A_3/2) where; A_3/2 = 10^((Ema - Ema0)/Z) :ratio of oxidized cytochrome a3 to reduced cytochrome a3
ConcentrationCyta2() - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.ConcentrationCyta2 のコンストラクタ
 
ConcentrationPi - org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function の クラス
calculation of iorganic phosphate concentration (conformed to mass conservation law) Pitotal = 3*[ATP]cell + 2*[ADP]cell + [AMP] + [PhosphoCreatine] + [Pi]cell + (3*[ATP]mito + 2*[ADP]mito + [Pi]mito) / Rcm [Pi]cell = Pitotal - (3*[ATP]cell + 2*[ADP]cell + [AMP] + [PhosphoCreatine] + (3*[ATP]mito + 2*[ADP]mito + [Pi]mito) / Rcm)
ConcentrationPi() - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.ConcentrationPi のコンストラクタ
 
conductance - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.Current の変数
 
conductance - クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.structure.GapJunction の変数
conductance of gapjunction (nS)
conductance - クラス org.simBio.bio.sarai_noma_2004.structure.GapJunction の変数
resistance of gapjunction
conductance - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.IbCa の変数
 
conductance - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.IbNa の変数
 
conductance - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.ICa の変数
 
conductance - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.IK1 の変数
 
conductance - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.IKr の変数
 
conductance - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.IKs の変数
 
conductance - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.INa の変数
 
conductance - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.IpCa の変数
 
conductance - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.IpK の変数
 
conductance - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.Ito の変数
 
conductance - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.Ito_endo の変数
 
Conductor - org.simBio.core の クラス
root instance to conduct integration.
Conductor() - クラス org.simBio.core.Conductor のコンストラクタ
 
configDirHomeWindows - クラス org.simBio.sim.gui.Constant の static 変数
ホームディレクトリ取得の際に、システムプロパティ"user.home"に追加する文字列(Windows)
configDirKey - クラス org.simBio.sim.gui.Constant の static 変数
ホームディレクトリを得るシステムプロパティ
confirmOverrideDialogBox(String) - クラス org.simBio.sim.gui.toolKit.SimpleGUIFrameWork のメソッド
ファイル保存の際、上書きするかどうかの確認ダイアログボックスを開く
constant - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function.KoDependency_IK1 の変数
constant value
constant - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.KoDependency の変数
constant value
constant - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.Diffusion の変数
rate constant of diffusion
constant - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.KoDependency の変数
constant value
constant - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.KoDependency2 の変数
constant
Constant - org.simBio.sim.gui の クラス
Constants used in GUI.
Constant() - クラス org.simBio.sim.gui.Constant のコンストラクタ
 
ConstantField - org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function の クラス
calculate constant field.
ConstantField() - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.ConstantField のコンストラクタ
 
constantFieldCa - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.CfChannel の変数
Ca2+ flux calculated by constant field theory [mM]
constantFieldCa - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.CfChannel の変数
Ca2+ flux calculated by constant field theory [mM]
constantFieldCa - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.CfChannel の変数
Ca2+ flux calculated by constant field theory [mM]
constantFieldCl - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.CfChannel の変数
Cl- flux calculated by constant field theory [mM]
constantFieldCl - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.CfChannel の変数
Cl- flux calculated by constant field theory [mM]
constantFieldK - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.CfChannel の変数
K+ flux calculated by constant field theory [mM]
constantFieldK - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.CfChannel の変数
K+ flux calculated by constant field theory [mM]
constantFieldK - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.CfChannel の変数
K+ flux calculated by constant field theory [mM]
constantFieldNa - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.CfChannel の変数
Na+ flux calculated by constant field theory [mM]
constantFieldNa - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.CfChannel の変数
Na+ flux calculated by constant field theory [mM]
constantFieldNa - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.CfChannel の変数
Na+ flux calculated by constant field theory [mM]
container - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.BasicGraph の変数
Graphが属するViewerのcontainer
contentsChange() - クラス org.simBio.sim.gui.toolKit.SimpleGUIFrameWork のメソッド
内容が変更された事を登録する。
converter - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function.Average の変数
convert unit
converter - クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.function.Rate の変数
convert unit
Couabain - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.INaK の変数
ouabain concentration
Couabain - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.carrier.INaK の変数
ouabain concentration (mM)
cPKA - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.ICFTR の変数
fraction of cAMP-activated PKA
Cr - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.enzyme.CK の変数
creatine concentration in cytosol
createTransferable(JComponent) - クラス org.simBio.sim.gui.toolKit.dndmenu.DnDTransferHandler のメソッド
ドラッグ用:データ転送のソースとして使用する Transferable を作成するハンドラ。
crel - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.flux.Release の変数
 
crossBridge - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.TroponinNL の変数
 
CrossBridge - org.simBio.bio.negroni_lascano_1996 の クラス
Cross bridge kinetics of Cardiac Muscle Model by Negroni and Lascano.
CrossBridge() - クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.CrossBridge のコンストラクタ
 
CrossBridge - クラス org.simBio.bio.noble_et_al_1998.Model の変数
 
CrossBridgeForce - org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction の クラス
Cross bridge force of NL contraction model, Negroni JA and Lascano EC.
CrossBridgeForce() - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.CrossBridgeForce のコンストラクタ
 
CrossBridgeLength - org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction の クラス
Length of cross bridge of NL contraction model, Negroni JA and Lascano EC.
CrossBridgeLength() - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.CrossBridgeLength のコンストラクタ
 
CrossBridgeNL - org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.enzyme の クラス
Cross bridge kinetics of Cardiac Muscle Model by Negroni and Lascano.
CrossBridgeNL() - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.enzyme.CrossBridgeNL のコンストラクタ
 
CsvDialog - org.simBio.sim.gui の クラス
CSV出力ダイアログ.
CsvDialog(Frame, Conductor, double, double, double, double, String) - クラス org.simBio.sim.gui.CsvDialog のコンストラクタ
This is the default constructor
CsvHandler - org.simBio.util の クラス
Convert csv file to XY series data.
CsvHandler() - クラス org.simBio.util.CsvHandler のコンストラクタ
 
CsvMaker - org.simBio.sim.analyzer.csv の クラス
csv形式で値をfileに書き出す。
CsvMaker() - クラス org.simBio.sim.analyzer.csv.CsvMaker のコンストラクタ
 
Current - org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current の クラス
sodium background current.
Current() - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.Current のコンストラクタ
 
current - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter の変数
 
Current - org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function の クラス
Calculate concentration (mM) change from current (pA).
Current() - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.Current のコンストラクタ
 
Current - org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.function の クラス
calculate concentration (M) change from current (A).
Current() - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.function.Current のコンストラクタ
 
currentCa - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter の変数
 
currentCa - クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.LeadPotential の変数
 
currentCl - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.MembraneTransporter の変数
link to the Cl component (pA) of compartment
currentCl - クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.LeadPotential の変数
 
CurrentClamp - org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.pipette の クラス
current clamp, external current in the RC membrane model.
CurrentClamp() - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.pipette.CurrentClamp のコンストラクタ
 
CurrentClamp - org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.pipette の クラス
current clamp, external current in the RC membrane model.
CurrentClamp() - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.pipette.CurrentClamp のコンストラクタ
 
currentK - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter の変数
 
currentK - クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.LeadPotential の変数
 
currentNa - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter の変数
 
currentNa - クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.LeadPotential の変数
 
cutDuration - クラス org.simBio.ResultGenerator の static 変数
 
cycle - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function.Average の変数
cycle
cycle - クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.AmplitudeInCycle の変数
cycle
Cytc2 - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.OxidativePhosphorylation の変数
cytochrome c2+ (reduced) concentration

A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z
???(C) 2002-2007 ?????????????????????