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C
c1
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
INaCa
の変数
c1
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
RateConstant
の変数
C1
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
Iha
の変数
c2
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
INaCa
の変数
c2
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
RateConstant
の変数
c2
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.
ComplexIV
の変数
cytochrome c2+ (reduced) concentration
C2
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
Iha
の変数
c3
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
RateConstant
の変数
c4
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
RateConstant
の変数
c5
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
RateConstant
の変数
c6
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
RateConstant
の変数
c7
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
RateConstant
の変数
Ca
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
ICaL
の変数
Ca
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
NSR
の変数
Ca
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
IKs
の変数
intracellular Ca
2+
concentration
Ca
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.molecule.
CaBuffer_RK
の変数
free Ca concentration (mM)
Ca
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.
Troponin
の変数
Ca
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
IKs
の変数
intracellular Ca
2+
concentration
Ca
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium.
IKs
の変数
intracellular Ca2+ concentration
Ca
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.
Analytic
の変数
Ca
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.
Analytic_RK
の変数
free calcium concentration (mM)
Ca
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.
InstantCaBuffer
の変数
Ca
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.
ODE
の変数
free Ca
2+
concentration (mM)
Ca
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.
TroponinNL
の変数
Ca
- クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.exp.
Model
の変数
Ca
- クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.
Qpump
の変数
Ca
- クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.
Qrel
の変数
Ca
- クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.
Troponin
の変数
Ca
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.function.
Electroneutrality
の変数
concentration of intracellular Ca
2+
[mM]
Ca
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium.
IKs
の変数
intracellular Ca
2+
concentration
CaBuffer
-
org.simBio.bio.faber_rudy_2000.molecule
の クラス
analytic equation of Calcium buffering.
CaBuffer()
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.molecule.
CaBuffer
のコンストラクタ
CaBuffer_RK
-
org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.molecule
の クラス
Calculate using ordinary differential equation, working with analytic buffer.
CaBuffer_RK()
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.molecule.
CaBuffer_RK
のコンストラクタ
CaCalmod
- クラス org.simBio.bio.noble_et_al_1998.
Model
の変数
CaCaM
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.
IPMCA
の変数
CachedBuffer
-
org.simBio.sim.analyzer.graph.results
の クラス
キャッシュ機能付きの、時系列データバッファ.
CachedBuffer(File)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.results.
CachedBuffer
のコンストラクタ
CaDiadic
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
ICaL
の変数
local Ca
2+
concentration near the mouth of L-type Ca channel (mM)
CaDiadic
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
ICaL
の変数
local Ca
2+
concentration near the mouth of L-type Ca channel (mM)
CaDiadic
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.
IRyR
の変数
local Ca
2+
concentration near the mouth of RyR channel.
CaDiadic
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
ICaL
の変数
local Ca2+ concentration near the mouth of L-type Ca channel (mM)
CaDiadic
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.channel.
IRyR
の変数
local Ca2+ concentration near the mouth of RyR channel
CaDiadic
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.current.cf.
ICaL
の変数
local Ca2+ concentration near the mouth of L-type Ca channel (mM)
CaDiadic
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
ICaL
の変数
local Ca
2+
concentration near the mouth of L-type Ca channel (mM)
CaDiadic
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
IRyR
の変数
local Ca2+ concentration near the mouth of RyR channel
CaDiadic
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
ICaL
の変数
local Ca
2+
concentration near the mouth of L-type Ca channel (mM)
Cads
- クラス org.simBio.bio.noble_et_al_1998.
Model
の変数
Caext
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.complex.
WaterFlux
の変数
concentration of extracellular Ca
2+
[mM]
Caext
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.experiment.
TonicityChange
の変数
concentration of extracellular Ca2+ [mM]
Caext
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.
Tonicity
の変数
concentration of extracellular Ca2+ [mM]
CaFigure
-
org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.figure
の クラス
Utility class to set figure parameters.
CaFigure()
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.figure.
CaFigure
のコンストラクタ
Cafree
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.molecule.
CaBuffer
の変数
Cafree
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.molecule.
DualCaBuffer
の変数
Cai
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
ICaL
の変数
Cai
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
IKs
の変数
Cai
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
INaCa
の変数
Cai
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
IpCa
の変数
Cai
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
RyR
の変数
Cai
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
SRCA
の変数
Cai
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
JSR
の変数
Cai
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
NSR
の変数
Cai
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
ICaL
の変数
intracellular Ca
2+
concentration (mM)
Cai
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
Ist
の変数
intracellular calcium concentration (mM)
Cai
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.complex.
SR
の変数
Cai
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
ICab
の変数
Cai
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
ICaL
の変数
Cai
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
INaCa
の変数
Cai
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
IpCa
の変数
Cai
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.
Leak
の変数
[Ca]
i
(mM)
Cai
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.
Release
の変数
Cai
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.
Uptake
の変数
[Ca
2+
]
i
(mM)
Cai
- クラス org.simBio.bio.kuratomi_et_al_2003.current.carrier.
INaCa
の変数
concentration of intracellular Calcium[mM]
Cai
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.
ICaPump
の変数
Ca2+ concentration in cytoplasm (mM)
Cai
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.
IPMCA
の変数
Ca
2+
concentration in cytoplasm (mM)
Cai
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
ICaL
の変数
intracellular Ca
2+
concentration (mM)
Cai
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.
IRyR
の変数
intracellular calcium concentration (mM)
Cai
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.
ICaPump
の変数
Ca2+ concentration in cytoplasm (mM)
Cai
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.
INaCa
の変数
concentration of intracellular Calcium[mM]
Cai
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
ICaL
の変数
intracellular calcium concentration (mM)
Cai
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
ILCCa
の変数
intracellular calcium concentration (mM)
Cai
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
Ist
の変数
intracellular calcium concentration (mM)
Cai
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.channel.
IRyR
の変数
intracellular calcium concentration (mM)
Cai
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.
Diffusion
の変数
concentration of intracellular Ca2+ [mM]
Cai
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.
TroponinNL
の変数
Cai
- クラス org.simBio.bio.noble_et_al_1998.
Model
の変数
Cai
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.current.carrier.
IPMCA
の変数
Ca
2+
concentration in cytoplasm (mM)
Cai
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.current.cf.
ICaL
の変数
intracellular calcium concentration (mM)
Cai
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
ICaL
の変数
intracellular Ca
2+
concentration (mM)
Cai
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
INaCa
の変数
concentration of intracellular Ca
2+
[mM]
Cai
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
IRyR
の変数
intracellular calcium concentration (mM)
Cai
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
PMCA
の変数
concentration of intracellular Ca
2+
[mM]
Cai
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.complex.
SR
の変数
Cai
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.carrier.
INaCa
の変数
Cai
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
ICa
の変数
Cai
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
IpCa
の変数
Cai
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.flux.
Leak
の変数
Cai
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.flux.
Release
の変数
Cai
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.flux.
UpTake
の変数
Cai
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
ICaL
の変数
intracellular Ca
2+
concentration (mM)
Cai
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
ILCCa
の変数
intracellular calcium concentration (mM)
Cai
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
Ist
の変数
Cai
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.
Diffusion
の変数
concentration of intracellular Ca2+ [mM]
Cainitial
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.experiment.
TonicityChange
の変数
concentration of initial extracellular Ca2+ [mM]
Caint
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.complex.
WaterFlux
の変数
concentration of intracellular Ca
2+
[mM]
Caj
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.
Transfer
の変数
[Ca
2+
]
rel
(mM)
calcCurrent(double)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
LeadPotential
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.
Compartment
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.cor.
Hodgkin_huxley_squid_axon_1952_modified
のメソッド
Computation.
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.cor.
Vanderpol_model_1928
のメソッド
Computation.
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
Current
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
ICaL
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
ICaT
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
IK1
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
IKpl
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
IKr
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
IKs
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
INa
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
INaCa
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
INaK
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
IpCa
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
NSRLeak
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
RyR
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
SRCA
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.function.
Diffusion
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.function.
Stimulus
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.molecule.
CaBuffer
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.molecule.
DualCaBuffer
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
Cell
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
JSR
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
NSR
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.function.
Analytic2state
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.function.
StepChanger
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.henriquez_et_al_2001.
GapJunction
のメソッド
calculate the unitary gap junction conductance (pS) which depends on transjunctional voltage
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
ICaL
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
Iha
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
IKACh
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
IKs
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
Ist
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.hodgkin_huxley_1952.
I_K
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.hodgkin_huxley_1952.
I_L
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.hodgkin_huxley_1952.
I_Na
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.hodgkin_huxley_1952.
I_stim
のメソッド
apply stimulus current.
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.hodgkin_huxley_1952.
Membrane
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.complex.
SR
のメソッド
convert current (pA) to d[X]/dt (mM)
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
ICab
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
ICaL
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
IK1
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
IKr
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
IKs
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
INa
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
INab
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
INaCa
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
INaK
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
IpCa
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
Ito
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.
Leak
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.
Release
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.
Transfer
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.
Uptake
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.molecule.
CaBuffer_RK
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kuratomi_et_al_2003.current.carrier.
Carrier
のメソッド
calculate total charge movement using reduced 2 state model
2 state gateを用いて電流を計算する
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kuratomi_et_al_2003.current.carrier.
INaCa
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.
CrossBridgeLength
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.
IsotonicContraction
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.
Troponin
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.
Troponinmit
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.
ICaPump
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.
INaK
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.
IPMCA
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
ICaL
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
ICFTR
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
IKs
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.
IK1
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.
IRyR
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function.
Average
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function.
ConcentrationAMP
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function.
KoDependency_IK1
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function.
PA2MS
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
BetaAR_Gs
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
CAMP
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
PKA
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
PLB
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.
Compartment
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.complex.
ATPsynthesis
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.
Carrier
のメソッド
calculate total charge movement using reduced 2 state model
2 state gateを用いて電流を計算する
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.
ICaPump
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.
INaCa
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.
INaK
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
CfChannel
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
ICaL
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
ICaT
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
Iha
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
IKpl
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
ILCCa
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
INa
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
Ist
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
Ito
のメソッド
calculate transient outward current at time t
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.channel.
IRyR
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.
Diffusion
のメソッド
current = permeability * concentration gradient (in - out)
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.
MembraneTransporter
のメソッド
Compartmentの電流に足し合わせる。
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.pipette.
CurrentClamp
のメソッド
apply stimulus pulsatile current
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.pipette.
VoltageClamp
のメソッド
to keep Vm constant, Iext is applied.
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium.
IK1
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium.
IKACh
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium.
IKATP
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium.
IKr
のメソッド
Calculate current
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium.
IKs
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium.
PureKchannel
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
Charge
のメソッド
dVm/dt = - I / Cm
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
ConstantField
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
Current
のメソッド
convert current (pA) to d[X]/dt (mM)
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
Diffusion
のメソッド
dy/dt = (inf - y)/ tau
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
Diffusion_a
のメソッド
y = inf -(inf - y_old) * exp(-t/tau)
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
Diffusion_t
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
KoDependency
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
RateConstant
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
RateConstantK
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
RateConstantVm
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
ReversalPotential
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
Volume
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.
Analytic
のメソッド
instantaneous equiribrium
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.
Analytic_RK
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.
InstantCaBuffer
のメソッド
instantaneous equiribrium is iteratively calculated.
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.
ODE
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.
TroponinNL
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.
TroponinNL_RK
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.enzyme.
CrossBridgeNL
のメソッド
calculate the rate of change in the cross bridge length, dX/dt
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.enzyme.
IsometricContraction
のメソッド
calculate the tension without contraction (isometric contraction)
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.enzyme.
IsotonicContraction
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.current.carrier.
ICaPump
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.current.carrier.
INaK
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.exp.
Anoxia
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
Acidity
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.chemical.
CN
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.chemical.
FCCP
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
ConcentrationAMP
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
ConcentrationCyta2
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
ConcentrationPi
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
GradientP
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
GradientpH
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
MassConservation
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
MassConservation2
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
MembranePotential
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
MetalFreeConcentration
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
PartialPotential
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
PressureToConcentration
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
RedoxPotential
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
RedoxPotentialCyta
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
VolumeRatio
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
Zvalue
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.buffer.Ca.
TroponinNL_RK
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.buffer.
HBuffering
のメソッド
calculate and set the value of r
buffer
.
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.
Diffusion
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.enzyme.
AK
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.enzyme.
CK
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.
ATPsynthase
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.
ComplexI
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.
ComplexIII
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.
ComplexIV
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.
OxidativePhosphorylation
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.
SubstrateDehydrogenation
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.Transporter.
ANT
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.Transporter.
PhosphateCarrier
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.Transporter.
ProtonLeak
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.
CrossBridge
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.exp.
IsotonicContraction
のメソッド
set force equilibrated length.
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.exp.
LChange
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.exp.
Model
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.
Qpump
のメソッド
Qpump=Kp/(1+(Km/[Ca2+])^2)
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.
Qrel
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.
Troponin
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.noble_et_al_1998.
Model
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.
JunctionalConductance
のメソッド
Calculate the junctional conductance (nS) using by Gj=N*gj*pOpen.
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.
JunctionalPotential
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.kinetics.
IndependentGate
のメソッド
Calculate the open probability.
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.kinetics.
MultiStateModel
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.kinetics.
RateConstantCaGate
のメソッド
Nothing performed
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.kinetics.
TwoStateModel
のメソッド
Calculate the open probability
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.structure.
GapJunction
のメソッド
Calculate the gap junctional current (pA)
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.structure.
GapJunctionK
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.
parabola
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2003.
VoltageClamp
のメソッド
SA nodeモデルでVmが設定値になったらVoltage Clampを開始する。
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.current.carrier.
IPMCA
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.current.cf.
ICaL
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.function.
Rate
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.function.
Ratio
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.sarai_noma_2004.fourState.
MonteCarlo
のメソッド
calculate single channels' state transition
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.sarai_noma_2004.fourState.
NaChannel
のメソッド
calculate state probability by ODE.
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.sarai_noma_2004.fourState.
ODE
のメソッド
calculate state probability by ODE.
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.sarai_noma_2004.structure.
GapJunction
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.sarai_noma_2004.
VoltageClamp
のメソッド
apply square voltage pulse
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
CfChannel
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
ICaL
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
INaCa
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
IRyR
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
PMCA
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.function.
Electroneutrality
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.function.
ENaCa
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.function.
Ouabain
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.complex.
SR
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.carrier.
Carrier
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.carrier.
INaCa
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.carrier.
INaK
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
IbCa
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
IbNa
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
ICa
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
IK1
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
IKr
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
IKs
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
INa
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
IpCa
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
IpK
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
Ito
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
Ito_endo
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.pipette.
CurrentClamp
のメソッド
apply stimulus pulsatile current
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.flux.
Leak
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.flux.
Release
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.flux.
UpTake
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.function.
Charge
のメソッド
dVm/dt = - I / Cm
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.function.
Current
のメソッド
convert current (pA) to d[X]/dt (mM)
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.function.
ReversalPotential2
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.complex.
WaterFlux
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.carrier.
NKCC
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
CfChannel
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
ICaL
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
ICaT
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
ICFTR
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
IClb
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
Iha
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
IKpl
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
ILCCa
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
INa
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
INab
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
Ist
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
Ito
のメソッド
calculate transient outward current at time t
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
IVRCC
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.
Diffusion
のメソッド
current = permeability * concentration gradient (in - out)
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.
MembraneTransporter
のメソッド
CompartmentのCl電流に足し合わせる。
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium.
IK1
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium.
IKATP
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium.
IKr
のメソッド
Calculate current
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium.
IKs
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium.
PureKchannel
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.experiment.
StepChanger
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.experiment.
StepChanger2
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.experiment.
TonicityChange
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.experiment.
VolumeRatio
のメソッド
calculate value = Vt ratio.
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.
AmplitudeNaK
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.
KoDependency
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.
KoDependency2
のメソッド
!!
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.
Tonicity
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.
TotalVolume
のメソッド
calculate value = Vt.
calculate(double)
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.
Volume
のメソッド
calculate(double)
- クラス org.simBio.core.
Conductor
のメソッド
call calculate(double t) of the every Reactor.
calculate(double)
- クラス org.simBio.core.
Reactor
のメソッド
write equations here, and calculate dy over dt.
calculate(double)
- クラス org.simBio.core.
ReactorList
のメソッド
clear value of All Reactors, and call calculate() of All Reactors
IResetBeforeCalcをimplimentsしているクラスの値をゼロにリセットした後、 全てのReactorのcalculate()を呼び出す。
calculate()
- クラス org.simBio.util.numerical.
MathFunction
のメソッド
The object's own value should be setted in this method.
CalculationObserver
-
org.simBio.core
の インタフェース
Conductor が計算を開始・終了した時に、監視オブジェクトに通知を行います。
CaLvsPMCAwoNCX
-
org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.figure
の クラス
Make Fig. 3C in Sarai et al. 2006 Visualize Ca max and min.
CaLvsPMCAwoNCX()
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.figure.
CaLvsPMCAwoNCX
のコンストラクタ
cAMP
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
Iha
の変数
cAMP concentration
cAMP
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function.
ConcentrationAMP
の変数
CAMP
-
org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule
の クラス
cAMP module.
CAMP()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
CAMP
のコンストラクタ
cAMP
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
CAMP
の変数
Phosphodiesterase concentration (mM)
cAMP
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
PKA
の変数
cAMP concentration (mM)
cAMP
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
ICFTR
の変数
concentration of intracellular cAMP [mM]
cAMP0
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
Iha
の変数
cAMP_Vshift
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
Iha
の変数
cAMPtot
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
CAMP
の変数
total cAMP concentration (mM)
cAMPtot
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
PKA
の変数
total cAMP concentration (mM)
Can
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.
Transfer
の変数
[Ca
2+
]
up
(mM)
cancelCellEditing()
- クラス org.simBio.sim.gui.
CheckedJTree.CheckedJTreeCellRenderer
のメソッド
canImport(JComponent, DataFlavor[])
- クラス org.simBio.sim.gui.toolKit.dndmenu.
DnDTransferHandler
のメソッド
ドロップ用: TransferableActionがドラッグされようとしてきた場合のみ、true を返す
Cao
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
ICaL
の変数
Cao
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
INaCa
の変数
Cao
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
ICab
の変数
Cao
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
INaCa
の変数
Cao
- クラス org.simBio.bio.kuratomi_et_al_2003.current.carrier.
INaCa
の変数
concentration of intracellular Calcium[mM]
Cao
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.
ICaPump
の変数
Ca2+ concentration in SR (mM, uptake site compartment)
Cao
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.
IPMCA
の変数
Ca
2+
concentration in external solution (mM)
Cao
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.
IRyR
の変数
calcium concentration in SR release site (mM)
Cao
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.
ICaPump
の変数
Ca2+ concentration in SR (mM, uptake site compartment)
Cao
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.
INaCa
の変数
concentration of intracellular Calcium[mM]
Cao
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.channel.
IRyR
の変数
extracellular calcium concentration (mM)
Cao
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.
Diffusion
の変数
concentration of extracellular Ca2+ [mM]
Cao
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.current.carrier.
IPMCA
の変数
Ca
2+
concentration in external solution (mM)
Cao
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
INaCa
の変数
concentration of extracellular Ca
2+
[mM]
Cao
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.carrier.
INaCa
の変数
Cao
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
ICa
の変数
Cao
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.
Diffusion
の変数
concentration of extracellular Ca2+ [mM]
Carel
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.
Release
の変数
Carel
- クラス org.simBio.bio.noble_et_al_1998.
Model
の変数
Carel
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
IRyR
の変数
calcium concentration in SR rel (mM)
CarelTotal
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.complex.
SR
の変数
CaRest
- クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.
Qrel
の変数
Carrier
-
org.simBio.bio.kuratomi_et_al_2003.current.carrier
の クラス
Abstract class for ping-pong model of the carrier.
Carrier()
- クラス org.simBio.bio.kuratomi_et_al_2003.current.carrier.
Carrier
のコンストラクタ
Carrier
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier
の クラス
Abstract class for ping-pong model of the carrier.
Carrier()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.
Carrier
のコンストラクタ
Carrier
-
org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.carrier
の クラス
abstract of ion carrier
Carrier()
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.carrier.
Carrier
のコンストラクタ
Casr
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
NSRLeak
の変数
Casr
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
RyR
の変数
Casr
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.flux.
Leak
の変数
Casr
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.flux.
Release
の変数
Catotal
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.molecule.
CaBuffer
の変数
Catotal
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.molecule.
DualCaBuffer
の変数
CaTotal
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
Cell
の変数
CaTotal
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
JSR
の変数
CaTotal
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.molecule.
CaBuffer_RK
の変数
total Ca concentration (mM)
CaTotal
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.
Troponin
の変数
CaTotal
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.
Analytic_RK
の変数
total calcium concentration (free calcium + buffered calcium + influx/efflux calcium) (mM)
CaTotal
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.
TroponinNL_RK
の変数
total Ca concentration
CaTotal
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.complex.
SR
の変数
CaTrop
- クラス org.simBio.bio.noble_et_al_1998.
Model
の変数
Caup
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.complex.
SR
の変数
Caup
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.
Leak
の変数
[Ca]
up
(mM)
Caup
- クラス org.simBio.bio.noble_et_al_1998.
Model
の変数
cbuffer
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.buffer.
HBuffering
の変数
Buffering capacity for H
+
(c
buffer
). 22.0 (mM Proton / pH) in matrix, 25.0 (mM Proton / pH) in cytosol.
cCa
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.
MembraneTransporter
の変数
CCa
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.
MembraneTransporter
の変数
to see Ca current component
CCa
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
LeadPotential
の変数
cCl
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.
MembraneTransporter
の変数
Cl component (pA)
CCl
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.
MembraneTransporter
の変数
to see Cl current component
CCl
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
LeadPotential
の変数
Cell
-
org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure
の クラス
Cell.
Cell()
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
Cell
のコンストラクタ
CfChannel
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf
の クラス
calculate current component of Na, K, Ca ion according to the constant field theory.
CfChannel()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
CfChannel
のコンストラクタ
CfChannel
-
org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current
の クラス
calculate current component of Na, K, Ca, and Cl ion according to the constant field theory.
CfChannel()
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
CfChannel
のコンストラクタ
CfChannel
-
org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf
の クラス
calculate current component of Na, K, Ca, and Cl ion according to the constant field theory.
CfChannel()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
CfChannel
のコンストラクタ
change()
- クラス org.simBio.sim.dm.
ParameterChanger
のメソッド
changeScale()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
AbstractGraph
のメソッド
表示位置/表示範囲が更新された際に、再描画に必要な準備を行う. 現在は、Viewerの同名メソッドを呼び出している。
changeScale()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
Graph
のメソッド
Makes the necessary preparations for redrawing, when the display position / display range has changed
changeScale()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
Viewer
のメソッド
表示位置/表示範囲が更新された際に、再描画に必要な準備を行う. 現在は、repaint() に処理を任せている。
Channel
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.channel
の クラス
template of Channel.
Channel()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.channel.
Channel
のコンストラクタ
characters(char[], int, int)
- クラス org.simBio.serialize.xml.
LogSax2
のメソッド
Logs character data when debugging.
characters(char[], int, int)
- クラス org.simBio.sim.ps.serialize.
TocReader
のメソッド
Charge
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function
の クラス
keep whole cell current from external solution.
Charge()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
Charge
のコンストラクタ
Charge
-
org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.function
の クラス
keep whole cell current from external solution.
Charge()
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.function.
Charge
のコンストラクタ
CheckedJTree
-
org.simBio.sim.gui
の クラス
チェックボックスによる選択機能を持ったJTree.
CheckedJTree(TreeModel)
- クラス org.simBio.sim.gui.
CheckedJTree
のコンストラクタ
CheckedJTree.CheckedJTreeCellRenderer
-
org.simBio.sim.gui
の クラス
チェック付きのTreeCellRenderer/TreeCellEditor.
CheckedJTree.CheckedJTreeCellRenderer()
- クラス org.simBio.sim.gui.
CheckedJTree.CheckedJTreeCellRenderer
のコンストラクタ
コンストラクタ.
CheckedJTree.CheckedJTreeCellRenderer(LayoutManager, boolean)
- クラス org.simBio.sim.gui.
CheckedJTree.CheckedJTreeCellRenderer
のコンストラクタ
推奨されていません。
CheckedJTreeModel
-
org.simBio.sim.gui
の インタフェース
CheckedJTree用の TreeModel.
checkException()
- クラス org.simBio.core.
Conductor
のメソッド
Check if this thread has thrown an exception.
childExchanger_
- クラス org.simBio.sim.dm.exchange.
Exchanger
の変数
CICRfactor
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.
IRyR
の変数
cK
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.
MembraneTransporter
の変数
CK
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.
MembraneTransporter
の変数
to see K current component
CK
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.enzyme
の クラス
Creatine Kinase (CK) System.
CK()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.enzyme.
CK
のコンストラクタ
CK
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
LeadPotential
の変数
Cl
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.function.
Electroneutrality
の変数
concentration of intracellular Cl
-
[mM]
CLASS_NAME
- クラス org.simBio.core.
Initializer
の static 変数
attribute name of the class
clear()
- クラス org.simBio.core.
Initializer
のメソッド
clear all attributes.
clear()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.results.
CachedBuffer
のメソッド
バッファの内容をクリアする.
Clext
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.complex.
WaterFlux
の変数
concentration of extracellular Cl
-
[mM]
Clext
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.experiment.
TonicityChange
の変数
concentration of extracellular Cl- [mM]
Clext
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.
Tonicity
の変数
concentration of extracellular Cl- [mM]
ClFlux
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.carrier.
NKCC
の変数
Cl- current carried by NKCC1 [pA]
Cli
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.carrier.
NKCC
の変数
concentration of intracellular Cl
-
[mM]
Cli
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.
Diffusion
の変数
concentration of intracellular Cl- [mM]
Clinitial
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.experiment.
TonicityChange
の変数
concentration of initial extracellular Cl- [mM]
Clint
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.complex.
WaterFlux
の変数
concentration of intracellular Cl
-
[mM]
ClKratio
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
IClb
の変数
ratio of Cl- conductance to K+ conductance
Clo
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.carrier.
NKCC
の変数
concentration of extracellular Cl
-
[mM]
Clo
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.
Diffusion
の変数
concentration of extracellular Cl- [mM]
close
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.
IRyR
の変数
close state probability
close
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.channel.
IRyR
の変数
close state probability
close
- クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.kinetics.
MultiStateModel
の変数
closed state probability
close
- クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.kinetics.
TwoStateModel
の変数
closed state probability
close
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
IRyR
の変数
close state probability
close()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.results.
CachedBuffer
のメソッド
インスタンスを使用終了し、バッファファイルを開放する.
close()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.results.
TimeSeriesValues
のメソッド
インスタンスを使用終了し、バッファファイルを開放する.
close()
- クラス org.simBio.sim.dm.util.
StringInputStream
のメソッド
close()
- クラス org.simBio.sim.gui.toolKit.
SimpleGUIFrameWork
のメソッド
クローズする ファイルが読み込まれなくてもク終了時のローズされることがあるので、 状態遷移エラーは発生させない。
closedState1
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
Iha
の変数
closedState1
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
Iha
の変数
closedState2
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
Iha
の変数
closedState2
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
Iha
の変数
Cm
- クラス org.simBio.bio.hodgkin_huxley_1952.
Membrane
の変数
membrane capacitance, initial value = 1.0 (microF_per_cm2)
Cm
- クラス org.simBio.bio.kuratomi_et_al_2003.current.carrier.
Carrier
の変数
membrane capacitance (pF)
Cm
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.
IRyR
の変数
membrane capacitance (pF)
Cm
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.
Carrier
の変数
membrane capacitance (pF)
Cm
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.pipette.
VoltageClamp
の変数
membrane capacitance
Cm
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
Charge
の変数
membrane capacitance (pF)
Cm
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
KoDependency
の変数
membrane capacitance
Cm
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2003.
VoltageClamp
の変数
membrane capacitance (pF)
Cm
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
CfChannel
の変数
membrane capacitance [pF]
Cm
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
INaCa
の変数
membrane capacitance [pF]
Cm
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
IRyR
の変数
membrane capacitance (pF)
Cm
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
PMCA
の変数
membrane capacitance [pF]
Cm
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.function.
Current
の変数
Cm
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.complex.
WaterFlux
の変数
membrane capacitance [pF]
Cm
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
CfChannel
の変数
membrane capacitance [pF]
Cm
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.channel.
IRyR
の変数
membrane capacitance (pF)
Cm
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.
Diffusion
の変数
membrane capacitance [pF]
Cm
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium.
PureKchannel
の変数
Cm
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
Vmax
の変数
Cm
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
VmaxTime
の変数
membrane capacitance (pS)
Cm1
- クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.structure.
GapJunction
の変数
membrane capacitance of cell #1 (pF)
Cm1
- クラス org.simBio.bio.sarai_noma_2004.structure.
GapJunction
の変数
membrane capacitance of cell #1
Cm2
- クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.structure.
GapJunction
の変数
membrane capacitance of cell #2 (pS)
Cm2
- クラス org.simBio.bio.sarai_noma_2004.structure.
GapJunction
の変数
membrane capacitance of cell #2
cmdnbar
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.molecule.
DualCaBuffer
の変数
CN
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.chemical
の クラス
effect of CN addition.
CN()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.chemical.
CN
のコンストラクタ
CN
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.chemical.
CN
の変数
cyanide concentration
cNa
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.
MembraneTransporter
の変数
CNa
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.
MembraneTransporter
の変数
to see Na current component
CNa
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
LeadPotential
の変数
collapseAll()
- クラス org.simBio.sim.gui.
JTreeTableSimBio
のメソッド
TreeTableの階層全体を収納する。
Collector
-
org.simBio.serialize
の クラス
Make a List of all the Node values in the model tree.
Collector(Component, List)
- クラス org.simBio.serialize.
Collector
のコンストラクタ
Collect values.
collectXMLs()
- クラス org.simBio.sim.ps.serialize.
ParseXMLs
のメソッド
Check if XML-files should be collected in purpose to write a table of contents in a CSV- and a XML-file.
ColorUtil
-
org.simBio.sim.analyzer.graph
の クラス
色関係のユーティティクラス.
ColorUtil()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
ColorUtil
のコンストラクタ
comment(char[], int, int)
- クラス org.simBio.serialize.xml.
LogSax2
のメソッド
Logs comments when debugging.
Compartment
-
org.simBio.bio
の クラス
Nodes folder, contain no equation.
Compartment()
- クラス org.simBio.bio.
Compartment
のコンストラクタ
Compartment
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003
の クラス
This class is used for Nodes folder, contain no equation.
Compartment()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.
Compartment
のコンストラクタ
ComplexI
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain
の クラス
NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I).
ComplexI()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.
ComplexI
のコンストラクタ
ComplexIII
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain
の クラス
Cytochrome bc1 Complex (complex III).
ComplexIII()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.
ComplexIII
のコンストラクタ
ComplexIV
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain
の クラス
Cytochrome c Oxidase (complex IV).
ComplexIV()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.
ComplexIV
のコンストラクタ
compliance
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
IVRCC
の変数
compliance of membrane
Component
-
org.simBio.core
の クラス
super class of the core package, similar to public String, Component of the Composite Pattern.
Component()
- クラス org.simBio.core.
Component
のコンストラクタ
Composer
-
org.simBio
の クラス
Compose model part xmls into a composed model xml.
Composer()
- クラス org.simBio.
Composer
のコンストラクタ
Composite
-
org.simBio.core
の クラス
Composite Pattern.
Composite()
- クラス org.simBio.core.
Composite
のコンストラクタ
Concentration
-
org.simBio.core.integrator
の クラス
The amount of ion (or molecule) is hold as value.
Concentration()
- クラス org.simBio.core.integrator.
Concentration
のコンストラクタ
ConcentrationAMP
-
org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function
の クラス
calculation of AMP concentration (conformed to mass conservation law).
ConcentrationAMP()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function.
ConcentrationAMP
のコンストラクタ
ConcentrationAMP
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function
の クラス
calculation of AMP concentration (conformed to mass conservation law) [Adenosine]total_cell = [ATP]cell + [ADP]cell + [AMP] [AMP] = [Adenosine]total_cell - [ATP]cell - [ADP]cell
ConcentrationAMP()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
ConcentrationAMP
のコンストラクタ
ConcentrationCyta2
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function
の クラス
Calculation of the concentration of Cytochrome a2+ [Cyt a2+] = [Cyt a]total/(1 + A_3/2) where; A_3/2 = 10^((Ema - Ema0)/Z) :ratio of oxidized cytochrome a3 to reduced cytochrome a3
ConcentrationCyta2()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
ConcentrationCyta2
のコンストラクタ
ConcentrationPi
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function
の クラス
calculation of iorganic phosphate concentration (conformed to mass conservation law) Pitotal = 3*[ATP]cell + 2*[ADP]cell + [AMP] + [PhosphoCreatine] + [Pi]cell + (3*[ATP]mito + 2*[ADP]mito + [Pi]mito) / Rcm [Pi]cell = Pitotal - (3*[ATP]cell + 2*[ADP]cell + [AMP] + [PhosphoCreatine] + (3*[ATP]mito + 2*[ADP]mito + [Pi]mito) / Rcm)
ConcentrationPi()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.
ConcentrationPi
のコンストラクタ
conductance
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
Current
の変数
conductance
- クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.structure.
GapJunction
の変数
conductance of gapjunction (nS)
conductance
- クラス org.simBio.bio.sarai_noma_2004.structure.
GapJunction
の変数
resistance of gapjunction
conductance
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
IbCa
の変数
conductance
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
IbNa
の変数
conductance
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
ICa
の変数
conductance
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
IK1
の変数
conductance
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
IKr
の変数
conductance
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
IKs
の変数
conductance
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
INa
の変数
conductance
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
IpCa
の変数
conductance
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
IpK
の変数
conductance
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
Ito
の変数
conductance
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
Ito_endo
の変数
Conductor
-
org.simBio.core
の クラス
root instance to conduct integration.
Conductor()
- クラス org.simBio.core.
Conductor
のコンストラクタ
configDirHomeWindows
- クラス org.simBio.sim.gui.
Constant
の static 変数
ホームディレクトリ取得の際に、システムプロパティ"user.home"に追加する文字列(Windows)
configDirKey
- クラス org.simBio.sim.gui.
Constant
の static 変数
ホームディレクトリを得るシステムプロパティ
confirmOverrideDialogBox(String)
- クラス org.simBio.sim.gui.toolKit.
SimpleGUIFrameWork
のメソッド
ファイル保存の際、上書きするかどうかの確認ダイアログボックスを開く
constant
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function.
KoDependency_IK1
の変数
constant value
constant
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
KoDependency
の変数
constant value
constant
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.
Diffusion
の変数
rate constant of diffusion
constant
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.
KoDependency
の変数
constant value
constant
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.
KoDependency2
の変数
constant
Constant
-
org.simBio.sim.gui
の クラス
Constants used in GUI.
Constant()
- クラス org.simBio.sim.gui.
Constant
のコンストラクタ
ConstantField
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function
の クラス
calculate constant field.
ConstantField()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
ConstantField
のコンストラクタ
constantFieldCa
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
CfChannel
の変数
Ca2+ flux calculated by constant field theory [mM]
constantFieldCa
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
CfChannel
の変数
Ca2+ flux calculated by constant field theory [mM]
constantFieldCa
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
CfChannel
の変数
Ca2+ flux calculated by constant field theory [mM]
constantFieldCl
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
CfChannel
の変数
Cl- flux calculated by constant field theory [mM]
constantFieldCl
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
CfChannel
の変数
Cl- flux calculated by constant field theory [mM]
constantFieldK
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
CfChannel
の変数
K+ flux calculated by constant field theory [mM]
constantFieldK
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
CfChannel
の変数
K+ flux calculated by constant field theory [mM]
constantFieldK
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
CfChannel
の変数
K+ flux calculated by constant field theory [mM]
constantFieldNa
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
CfChannel
の変数
Na+ flux calculated by constant field theory [mM]
constantFieldNa
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
CfChannel
の変数
Na+ flux calculated by constant field theory [mM]
constantFieldNa
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
CfChannel
の変数
Na+ flux calculated by constant field theory [mM]
container
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
BasicGraph
の変数
Graphが属するViewerのcontainer
contentsChange()
- クラス org.simBio.sim.gui.toolKit.
SimpleGUIFrameWork
のメソッド
内容が変更された事を登録する。
converter
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function.
Average
の変数
convert unit
converter
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.function.
Rate
の変数
convert unit
Couabain
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.
INaK
の変数
ouabain concentration
Couabain
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.carrier.
INaK
の変数
ouabain concentration (mM)
cPKA
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
ICFTR
の変数
fraction of cAMP-activated PKA
Cr
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.enzyme.
CK
の変数
creatine concentration in cytosol
createTransferable(JComponent)
- クラス org.simBio.sim.gui.toolKit.dndmenu.
DnDTransferHandler
のメソッド
ドラッグ用:データ転送のソースとして使用する Transferable を作成するハンドラ。
crel
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.flux.
Release
の変数
crossBridge
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.
TroponinNL
の変数
CrossBridge
-
org.simBio.bio.negroni_lascano_1996
の クラス
Cross bridge kinetics of Cardiac Muscle Model by Negroni and Lascano.
CrossBridge()
- クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.
CrossBridge
のコンストラクタ
CrossBridge
- クラス org.simBio.bio.noble_et_al_1998.
Model
の変数
CrossBridgeForce
-
org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction
の クラス
Cross bridge force of NL contraction model, Negroni JA and Lascano EC.
CrossBridgeForce()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.
CrossBridgeForce
のコンストラクタ
CrossBridgeLength
-
org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction
の クラス
Length of cross bridge of NL contraction model, Negroni JA and Lascano EC.
CrossBridgeLength()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.
CrossBridgeLength
のコンストラクタ
CrossBridgeNL
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.enzyme
の クラス
Cross bridge kinetics of Cardiac Muscle Model by Negroni and Lascano.
CrossBridgeNL()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.enzyme.
CrossBridgeNL
のコンストラクタ
CsvDialog
-
org.simBio.sim.gui
の クラス
CSV出力ダイアログ.
CsvDialog(Frame, Conductor, double, double, double, double, String)
- クラス org.simBio.sim.gui.
CsvDialog
のコンストラクタ
This is the default constructor
CsvHandler
-
org.simBio.util
の クラス
Convert csv file to XY series data.
CsvHandler()
- クラス org.simBio.util.
CsvHandler
のコンストラクタ
CsvMaker
-
org.simBio.sim.analyzer.csv
の クラス
csv形式で値をfileに書き出す。
CsvMaker()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.csv.
CsvMaker
のコンストラクタ
Current
-
org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current
の クラス
sodium background current.
Current()
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
Current
のコンストラクタ
current
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.
MembraneTransporter
の変数
Current
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function
の クラス
Calculate concentration (mM) change from current (pA).
Current()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
Current
のコンストラクタ
Current
-
org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.function
の クラス
calculate concentration (M) change from current (A).
Current()
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.function.
Current
のコンストラクタ
currentCa
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.
MembraneTransporter
の変数
currentCa
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
LeadPotential
の変数
currentCl
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.
MembraneTransporter
の変数
link to the Cl component (pA) of compartment
currentCl
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
LeadPotential
の変数
CurrentClamp
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.pipette
の クラス
current clamp, external current in the RC membrane model.
CurrentClamp()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.pipette.
CurrentClamp
のコンストラクタ
CurrentClamp
-
org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.pipette
の クラス
current clamp, external current in the RC membrane model.
CurrentClamp()
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.pipette.
CurrentClamp
のコンストラクタ
currentK
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.
MembraneTransporter
の変数
currentK
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
LeadPotential
の変数
currentNa
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.
MembraneTransporter
の変数
currentNa
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
LeadPotential
の変数
cutDuration
- クラス org.simBio.
ResultGenerator
の static 変数
cycle
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function.
Average
の変数
cycle
cycle
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
AmplitudeInCycle
の変数
cycle
Cytc2
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.
OxidativePhosphorylation
の変数
cytochrome c2+ (reduced) concentration
概要
パッケージ
クラス
使用
階層ツリー
非推奨 API
索引
ヘルプ
前の文字
次の文字
フレームあり
フレームなし
すべてのクラス
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
???(C) 2002-2007 ?????????????????????