概要
パッケージ
クラス
使用
階層ツリー
非推奨 API
索引
ヘルプ
前の文字
次の文字
フレームあり
フレームなし
すべてのクラス
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
I
I_K
-
org.simBio.bio.hodgkin_huxley_1952
の クラス
Potassium Channel.
I_K()
- クラス org.simBio.bio.hodgkin_huxley_1952.
I_K
のコンストラクタ
I_K
- クラス org.simBio.bio.hodgkin_huxley_1952.
Membrane
の変数
Potassium current (microA_per_cm2)
I_L
-
org.simBio.bio.hodgkin_huxley_1952
の クラス
leak component.
I_L()
- クラス org.simBio.bio.hodgkin_huxley_1952.
I_L
のコンストラクタ
I_L
- クラス org.simBio.bio.hodgkin_huxley_1952.
Membrane
の変数
Leak (Chloride) current (microA_per_cm2)
I_Na
-
org.simBio.bio.hodgkin_huxley_1952
の クラス
Sodium channel.
I_Na()
- クラス org.simBio.bio.hodgkin_huxley_1952.
I_Na
のコンストラクタ
I_Na
- クラス org.simBio.bio.hodgkin_huxley_1952.
Membrane
の変数
Sodium current (microA_per_cm2)
I_stim
-
org.simBio.bio.hodgkin_huxley_1952
の クラス
Stimulus current.
I_stim()
- クラス org.simBio.bio.hodgkin_huxley_1952.
I_stim
のコンストラクタ
I_stim
- クラス org.simBio.bio.hodgkin_huxley_1952.
Membrane
の変数
Stimulus current (microA_per_cm2)
IbCa
-
org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current
の クラス
Background Ca
2+
current.
IbCa()
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
IbCa
のコンストラクタ
IbNa
-
org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current
の クラス
Background Na
+
current.
IbNa()
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
IbNa
のコンストラクタ
iCa
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
RyR
の変数
ICa
-
org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current
の クラス
L-type Ca
2+
current.
ICa()
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
ICa
のコンストラクタ
ICab
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
Cell
の変数
ICab
-
org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current
の クラス
ICab()
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
ICab
のコンストラクタ
ICab
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.
Release
の変数
ICaL
-
org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current
の クラス
L-type Calcium channnel.
ICaL()
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
ICaL
のコンストラクタ
ICaL
-
org.simBio.bio.himeno_et_al_2008
の クラス
L-type Ca channel.
ICaL()
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
ICaL
のコンストラクタ
ICaL
-
org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current
の クラス
ICaL()
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
ICaL
のコンストラクタ
ICaL
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.
Release
の変数
ICaL
-
org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf
の クラス
L-type Ca channel.
ICaL()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
ICaL
のコンストラクタ
ICaL
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf
の クラス
L-type Ca channel.
ICaL()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
ICaL
のコンストラクタ
ICaL
- クラス org.simBio.bio.noble_et_al_1998.
Model
の変数
ICaL
-
org.simBio.bio.sarai_et_al_2003
の クラス
2次元表示のX軸で負の値が用いれないようなので、シフトさせる。
ICaL()
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2003.
ICaL
のコンストラクタ
ICaL
-
org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.current.cf
の クラス
L-type Ca channel with amplitude factor.
ICaL()
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.current.cf.
ICaL
のコンストラクタ
ICaL
-
org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current
の クラス
L-type Ca channel.
ICaL()
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
ICaL
のコンストラクタ
ICaL
-
org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf
の クラス
L-type Ca channel. 4 state voltage gate, from Shirokov et al. 1993, 4 state Calcium gate, from Shirokov et al. 1993, ultra-slow inactivation, ATP Dependency from Noma& Shibasaki 1985 J.Physiol,363:441-462.
ICaL()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
ICaL
のコンストラクタ
ICaLCa
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
Cell
の変数
ICaLK
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
Cell
の変数
ICaLNa
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
Cell
の変数
ICanvas
-
org.simBio.sim.analyzer.graph.simple
の インタフェース
draw axis and plot point to the canvas
SwingもしくはSWTに依存せず画面描画するためのインターフェイス。
ICaPump
-
org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier
の クラス
Ca pump on network SR.
ICaPump()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.
ICaPump
のコンストラクタ
ICaPump
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier
の クラス
Ca pump on network SR.
ICaPump()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.
ICaPump
のコンストラクタ
ICaPump
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.current.carrier
の クラス
Ca pump on network SR.
ICaPump()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.current.carrier.
ICaPump
のコンストラクタ
ICaT
-
org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current
の クラス
T-Type Calcium Channel.
ICaT()
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
ICaT
のコンストラクタ
ICaT
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
Cell
の変数
ICaT
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf
の クラス
T-type Ca channel.
ICaT()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
ICaT
のコンストラクタ
ICaT
-
org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf
の クラス
T-type Ca channel.
ICaT()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
ICaT
のコンストラクタ
ICFTR
-
org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf
の クラス
Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator Cl
-
channel current.
ICFTR()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
ICFTR
のコンストラクタ
ICFTR
-
org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf
の クラス
Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator Cl- channel current.
ICFTR()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
ICFTR
のコンストラクタ
IClb
-
org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf
の クラス
IClb()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
IClb
のコンストラクタ
ICollection
-
org.simBio.sim.ps
の インタフェース
パラメータ空間のデータベース。
ICollector
-
org.simBio.sim.ps
の インタフェース
Collect parameters, evaluations, time series, result XML.
iconDir
- クラス org.simBio.sim.gui.
Constant
の static 変数
アイコン用のディレクトリ文字列(リソース内)
IEvals
-
org.simBio.sim.ps
の インタフェース
評価値を持っているマーク。
Iext
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
Cell
の変数
ignorableWhitespace(char[], int, int)
- クラス org.simBio.serialize.xml.
LogSax2
のメソッド
Reports ignorable whitespace in element content.
Iha
-
org.simBio.bio.himeno_et_al_2008
の クラス
Iha.
Iha()
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
Iha
のコンストラクタ
Iha
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf
の クラス
Hyperpolarization-activated cation current,
I
ha
.
Iha()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
Iha
のコンストラクタ
Iha
-
org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf
の クラス
Iha
Iha()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
Iha
のコンストラクタ
IK1
-
org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current
の クラス
time indipendent potassium channel Faber GM, Rudy Y.
IK1()
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
IK1
のコンストラクタ
IK1
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
Cell
の変数
IK1
-
org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current
の クラス
IK1()
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
IK1
のコンストラクタ
IK1
-
org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current
の クラス
Inward rectifired K current, Yan and Ishihara (2005) model.
IK1()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.
IK1
のコンストラクタ
IK1
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium
の クラス
Inward rectifired K current, Ishihara model.
IK1()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium.
IK1
のコンストラクタ
IK1
-
org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current
の クラス
Inward rectifier K
+
current.
IK1()
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
IK1
のコンストラクタ
IK1
-
org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium
の クラス
Inward rectifired K current, Ishihara model.
IK1()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium.
IK1
のコンストラクタ
IKACh
-
org.simBio.bio.himeno_et_al_2008
の クラス
ACh channel. normalized with membrane capacitance.
IKACh()
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
IKACh
のコンストラクタ
IKACh
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium
の クラス
ACh channel Iijima
IKACh()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium.
IKACh
のコンストラクタ
IKATP
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium
の クラス
ATP-sensitive potassium current.
IKATP()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium.
IKATP
のコンストラクタ
IKATP
-
org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium
の クラス
ATP-sensitive potassium current.
IKATP()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium.
IKATP
のコンストラクタ
IKeys
-
org.simBio.sim.ps
の インタフェース
変化させているパラメータのリストを持っているマーク。
IKpl
-
org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current
の クラス
plateau potassium channel Faber GM, Rudy Y.
IKpl()
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
IKpl
のコンストラクタ
IKpl
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
Cell
の変数
IKpl
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf
の クラス
non-specific, voltage-dependent outward current (plateau current).
IKpl()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
IKpl
のコンストラクタ
IKpl
-
org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf
の クラス
non-specific, voltage-dependent outward current (plateau current).
IKpl()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
IKpl
のコンストラクタ
IKr
-
org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current
の クラス
Rapidly Activating Potassium channel Faber GM, Rudy Y.
IKr()
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
IKr
のコンストラクタ
IKr
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
Cell
の変数
IKr
-
org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current
の クラス
IKr()
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
IKr
のコンストラクタ
IKr
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium
の クラス
Delayed rectifier K+ current channel.
IKr()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium.
IKr
のコンストラクタ
IKr
- クラス org.simBio.bio.noble_et_al_1998.
Model
の変数
IKr
-
org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current
の クラス
Rapid delayed rectifier current : IKr * @author Keiichi Asakura
IKr()
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
IKr
のコンストラクタ
IKr
-
org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium
の クラス
Delayed rectifier K
+
current channel.
IKr()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium.
IKr
のコンストラクタ
IKs
-
org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current
の クラス
slow time dependent potassium channel Faber GM, Rudy Y.
IKs()
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
IKs
のコンストラクタ
IKs
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
Cell
の変数
IKs
-
org.simBio.bio.himeno_et_al_2008
の クラス
Delayed rectifier K
+
current, slow component (pA).
IKs()
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
IKs
のコンストラクタ
IKs
-
org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current
の クラス
IKs()
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
IKs
のコンストラクタ
IKs
-
org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf
の クラス
Delayed rectifier K
+
current, slow component (pA).
IKs()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.
IKs
のコンストラクタ
IKs
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium
の クラス
Delayd rectifier K+ current, slow component (pA).
IKs()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.potassium.
IKs
のコンストラクタ
IKs
- クラス org.simBio.bio.noble_et_al_1998.
Model
の変数
IKs
-
org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current
の クラス
Slow delayed rectifier current.
IKs()
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
IKs
のコンストラクタ
IKs
-
org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium
の クラス
Delayed rectifier K
+
current, slow component (pA).
IKs()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.potassium.
IKs
のコンストラクタ
ILCCa
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf
の クラス
Calcium activated Non-Selective Cation current.
ILCCa()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
ILCCa
のコンストラクタ
ILCCa
-
org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf
の クラス
Calcium activated Non-Selective Cation current.
ILCCa()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
ILCCa
のコンストラクタ
Ileak
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.complex.
SR
の変数
importData(JComponent, Transferable)
- クラス org.simBio.sim.gui.toolKit.dndmenu.
DnDTransferHandler
のメソッド
ドロップ用:ツールバー設定用のDataFlavorがドラッグされた場合のみ、ドロップ処理を行い、true を返す
in
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
ConstantField
の変数
intracellular ion concentration (mM)
in
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
Current
の変数
internal ion concentration (mM)
in
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
ReversalPotential
の変数
intracellular ion concentration (mM)
in
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.function.
Current
の変数
INa
-
org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current
の クラス
fast sodium channel Faber GM, Rudy Y.
INa()
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
INa
のコンストラクタ
INa
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
Cell
の変数
INa
-
org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current
の クラス
INa()
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
INa
のコンストラクタ
INa
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf
の クラス
Na current, Ishihara model.
INa()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
INa
のコンストラクタ
INa
-
org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current
の クラス
Fast Na currnet : INa * @author Keiichi Asakura
INa()
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
INa
のコンストラクタ
INa
-
org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf
の クラス
Na current, Ishihara model.
INa()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
INa
のコンストラクタ
INab
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
Cell
の変数
INab
-
org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current
の クラス
INab()
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
INab
のコンストラクタ
INab
-
org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf
の クラス
background Sodium current.
INab()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
INab
のコンストラクタ
INaCa
-
org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current
の クラス
Sodium Calcium exchanger Faber GM, Rudy Y.
INaCa()
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
INaCa
のコンストラクタ
INaCa
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
Cell
の変数
INaCa
-
org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current
の クラス
INaCa()
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
INaCa
のコンストラクタ
INaCa
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.
Release
の変数
INaCa
-
org.simBio.bio.kuratomi_et_al_2003.current.carrier
の クラス
Na/Ca exchanger.
INaCa()
- クラス org.simBio.bio.kuratomi_et_al_2003.current.carrier.
INaCa
のコンストラクタ
INaCa
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier
の クラス
Na/Ca exchanger.
INaCa()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.
INaCa
のコンストラクタ
INaCa
-
org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current
の クラス
Na
+
/Ca
2+
exchanger.
INaCa()
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
INaCa
のコンストラクタ
INaCa
-
org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.carrier
の クラス
Na+ / Ca2+ exchanger : INaCa * @author Asakurai
INaCa()
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.carrier.
INaCa
のコンストラクタ
inactivation
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
Ist
の変数
gate variable
inActivation
- クラス org.simBio.bio.kuratomi_et_al_2003.current.carrier.
INaCa
の変数
inactivation gate
inactivation
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
ICaT
の変数
open probability of inactivation gate
inactivation
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
Ist
の変数
gate variable
inactivation
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
ICaT
の変数
open probability of inactivation gate
inactivation
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
Ist
の変数
inActivation1
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
INaCa
の変数
I1 probability for inactivation gate 1 (Na-dependent)
inActivation2
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
INaCa
の変数
I2 probability for inactivation gate 2 (Ca-dependent)
inactive
- クラス org.simBio.bio.kuratomi_et_al_2003.current.carrier.
Carrier
の変数
probability at inactivated state.
INaK
-
org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current
の クラス
sodium potassium pump current Faber GM, Rudy Y.
INaK()
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
INaK
のコンストラクタ
INaK
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
Cell
の変数
INaK
-
org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current
の クラス
INaK()
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
INaK
のコンストラクタ
INaK
-
org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier
の クラス
Sodium Potassium pump current.
INaK()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.
INaK
のコンストラクタ
INaK
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier
の クラス
Sodium Potassium pump current.
INaK()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.
INaK
のコンストラクタ
INaK
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.current.carrier
の クラス
Sodium Potassium pump current.
INaK()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.current.carrier.
INaK
のコンストラクタ
INaK
-
org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.carrier
の クラス
Na+/K+ pump current * @author Asakura
INaK()
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.carrier.
INaK
のコンストラクタ
INaK
-
org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.carrier
の クラス
Calculate Ouabain effect on amplitude of INaK.
INaK()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.carrier.
INaK
のコンストラクタ
INaK
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
LeadPotential
の変数
INaKmax
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
INaK
の変数
inConstructor()
- クラス org.simBio.util.taglets.
Languages
のメソッド
IndependentGate
-
org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.kinetics
の クラス
Calculate the mean open probability of the gating model consisting of multiple independent gates.
IndependentGate()
- クラス org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.kinetics.
IndependentGate
のコンストラクタ
indexCurrent
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.results.
TimeSeriesValues
の変数
indexIteration_
- クラス org.simBio.sim.dm.exchange.
Exchanger
の変数
IndexNameExchanger
-
org.simBio.sim.dm.exchange
の クラス
Indexで名前をつけるクラス。
IndexNameExchanger(Node)
- クラス org.simBio.sim.dm.exchange.
IndexNameExchanger
のコンストラクタ
InextensibleLength
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.enzyme.
CrossBridgeNL
の変数
inField()
- クラス org.simBio.util.taglets.
Languages
のメソッド
infinity
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
Diffusion
の変数
infinity
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
Diffusion_a
の変数
infinity
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.
Diffusion_t
の変数
Inhib1
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
PLB
の変数
inhibitor-1 concentration (mM)
Inhib1p
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
PLB
の変数
phosphorylated inhibitor-1 concentration (mM)
Inhib1ptot
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
PLB
の変数
phosphorylated inhibitor-1 total (Inhib1p + PP1_Inhib) concentration (mM)
Inhib1tot
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
PLB
の変数
total inhibitor-1 concentration (mM)
init(int, int)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.plot.
AbstractPlot
のメソッド
init(int, int)
- インタフェース org.simBio.sim.analyzer.graph.plot.
IPlot
のメソッド
初期化を行う.
init(int, int)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.plot.
PlotDisplay
のメソッド
init(int, int)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.plot.
PlotPrinter
のメソッド
init(double)
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.results.
TimeSeriesValues
のメソッド
計算結果バッファを初期化する.
init()
- インタフェース org.simBio.sim.ps.
ICollector
のメソッド
結果を溜める準備をする。
init()
- クラス org.simBio.sim.ps.
ParameterSpace
のメソッド
initial
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.exp.
Anoxia
の変数
initial
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.chemical.
CN
の変数
rate constant of complex IV
initial
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.chemical.
FCCP
の変数
rate constant of proton leak
INITIAL_VALUE
- クラス org.simBio.core.
Initializer
の static 変数
attribute name of the initial value
initialize()
- クラス org.simBio.sim.gui.toolKit.dndmenu.
DnDAction
のメソッド
初期化処理を行う。
Initializer
-
org.simBio.core
の クラス
Keep values to initialize Component.
inMethod()
- クラス org.simBio.util.taglets.
Languages
のメソッド
inOverview()
- クラス org.simBio.util.taglets.
Languages
のメソッド
inPackage()
- クラス org.simBio.util.taglets.
Languages
のメソッド
InstantCaBuffer
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca
の クラス
instantaneous Ca buffer, iterative method.
InstantCaBuffer()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.
InstantCaBuffer
のコンストラクタ
integrate()
- クラス org.simBio.core.
Conductor
のメソッド
integrate ODEs.
internal
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.
Diffusion
の変数
internal concentration
internalEntityDecl(String, String)
- クラス org.simBio.serialize.xml.
LogSax2
のメソッド
Logs an internal entity declaration
interval
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.function.
Stimulus
の変数
interval
- クラス org.simBio.bio.hodgkin_huxley_1952.
I_stim
の変数
stimulus interval (milliS)
interval
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.pipette.
Pipette
の変数
stimulus interval (msec)
interval
- クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.
Qrel
の変数
interval
- クラス org.simBio.bio.sarai_noma_2004.
VoltageClamp
の変数
interval
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.pipette.
Pipette
の変数
stimulus interval (msec)
interval
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.experiment.
StepChanger
の変数
interval
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.experiment.
StepChanger2
の変数
interval
- クラス org.simBio.sim.analyzer.csv.
CsvMaker
の変数
interval
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
AbstractGraph
の変数
計算結果の処理間隔
interval
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.
Graph
の変数
time interval to plot
interval
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.
RelationGraph
の変数
interval
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
AbstractMeasure
の変数
interval
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
APD
の変数
interval
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
Vmax
の変数
inType()
- クラス org.simBio.util.taglets.
Languages
のメソッド
IParamSpaceObserver
-
org.simBio.sim.ps
の インタフェース
パラメータスペースが変化した通知を受ける。
IpCa
-
org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current
の クラス
Sarcolemmal Ca Pump Current Faber GM, Rudy Y.
IpCa()
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
IpCa
のコンストラクタ
IpCa
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
Cell
の変数
IpCa
-
org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current
の クラス
IpCa()
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
IpCa
のコンストラクタ
IpCa
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.flux.
Release
の変数
IpCa
-
org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current
の クラス
Plateau Ca current.
IpCa()
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
IpCa
のコンストラクタ
IpCamax
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
IpCa
の変数
IpK
-
org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current
の クラス
Plateau K current.
IpK()
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
IpK
のコンストラクタ
IPlot
-
org.simBio.sim.analyzer.graph.plot
の インタフェース
グラフ、描画対象(画面/プリンタ)毎の描画処理を行うためのインターフェイス.
IPlot.Item
-
org.simBio.sim.analyzer.graph.plot
の インタフェース
タイトル/凡例描画用のオブジェクト
IPMCA
-
org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier
の クラス
Ca pump on cell membrane. 1 ATP extrudes 1 Ca
2+
and imports 1 H
+
The H
+
movement is not included in calculation.
IPMCA()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.carrier.
IPMCA
のコンストラクタ
IPMCA
-
org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.current.carrier
の クラス
Ca pump on cell membrane. 1 ATP extrudes 1 Ca
2+
and imports 1 H
+
The H
+
movement is not included in calculation.
IPMCA()
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.current.carrier.
IPMCA
のコンストラクタ
IPMCA_CCa
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
LeadPotential
の変数
IReciever
-
org.simBio.sim.ps
の インタフェース
Receive result data.
Irel
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.complex.
SR
の変数
IResetBeforeCalc
-
org.simBio.core
の インタフェース
Mark for Reactor to reset before calculation
計算開始時にクリアする必要のあるリアクターにつけるマーク。
IRyR
-
org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current
の クラス
Calcium releasing channel on SR.
IRyR()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.
IRyR
のコンストラクタ
IRyR
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.channel
の クラス
Calcium releasing channel on SR.
IRyR()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.channel.
IRyR
のコンストラクタ
IRyR
-
org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current
の クラス
Calcium releasing channel on SR.
IRyR()
- クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.
IRyR
のコンストラクタ
IRyR
-
org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.channel
の クラス
Calcium releasing channel on SR.
IRyR()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.channel.
IRyR
のコンストラクタ
isActive
- クラス org.simBio.sim.analyzer.csv.
CsvMaker
の変数
isCellEditable(EventObject)
- クラス org.simBio.sim.gui.
CheckedJTree.CheckedJTreeCellRenderer
のメソッド
isDataFlavorSupported(DataFlavor)
- クラス org.simBio.sim.gui.toolKit.dndmenu.
DnDTransferBean
のメソッド
isInlineTag()
- クラス org.simBio.util.taglets.
Languages
のメソッド
Will return true since this is an inline tag.
isLoaded()
- クラス org.simBio.sim.gui.toolKit.
SimpleGUIFrameWork
のメソッド
動作モードが読込中であるかどうか確認する。
isModified()
- クラス org.simBio.sim.gui.toolKit.
SimpleGUIFrameWork
のメソッド
値が変更されているかどうか確認する。
isNamed(String)
- クラス org.simBio.core.
Component
のメソッド
compare s with name
引数の文字列が、自分の名前と一致すればtrueを返す。
Iso
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.molecule.
BetaAR_Gs
の変数
total ligand concentration
isOk()
- インタフェース org.simBio.sim.analyzer.graph.plot.
IPlot.Item
のメソッド
描画準備が出来ているかどうかを取得する.
isOk()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.plot.
PlotPrinter.LegendItem
のメソッド
isOk()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.plot.
PlotPrinter.TitleItem
のメソッド
IsometricContraction
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.enzyme
の クラス
Isometric Contraction
IsometricContraction()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.enzyme.
IsometricContraction
のコンストラクタ
isOpened()
- クラス org.simBio.sim.gui.toolKit.
SimpleGUIFrameWork
のメソッド
ファイルが開かれているかどうか確認する。
isOperated()
- クラス org.simBio.sim.gui.toolKit.
SimpleGUIFrameWork
のメソッド
動作モードが演算後であるかどうか確認する。
isOperating()
- クラス org.simBio.sim.gui.toolKit.
SimpleGUIFrameWork
のメソッド
動作モードが演算中であるかどうか確認する。
Isoprenaline
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
ICFTR
の変数
concentration of extracellular isoprenaline [uM]
IsotonicContraction
-
org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction
の クラス
Calculation of half sarcomere length in isotonic experiments.
IsotonicContraction()
- クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.
IsotonicContraction
のコンストラクタ
IsotonicContraction
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.enzyme
の クラス
Isotonic Contraction
IsotonicContraction()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.enzyme.
IsotonicContraction
のコンストラクタ
IsotonicContraction
-
org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.exp
の クラス
Calculate force equilibrated length.
IsotonicContraction()
- クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.exp.
IsotonicContraction
のコンストラクタ
isPlotEvals
- クラス org.simBio.sim.ps.view.
AbstractPlot
の static 変数
flag to plot each evaluation
isPlotLabel
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
Axis
の変数
ラベルを表示するか
isPlotLabel
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.
Axis
の変数
isPlots
- クラス org.simBio.sim.ps.view.
PlotLouncher
の static 変数
Flag to plot PlotLine, PlotContour, PlotTimeSeries
isPrefixed(String)
- クラス org.simBio.core.
Component
のメソッド
check name whether start with s or not
引数の文字列が、自分の名前の先頭と一致すればtrueを返す。
isRandomizer(InputStream)
- クラス org.simBio.sim.dm.
ParameterChanger
の static メソッド
Check if the file is a randomizer or not.
isResizing()
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.
Viewer
のメソッド
画面再描画中かどうかを調べる.
isSelected(Object)
- インタフェース org.simBio.sim.gui.
CheckedJTreeModel
のメソッド
node にチェックが入っている場合は true を返します.
Ist
-
org.simBio.bio.himeno_et_al_2008
の クラス
Sustained inward current for pacemaker model.
Ist()
- クラス org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.
Ist
のコンストラクタ
Ist
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf
の クラス
Sustained inward current for pacemaker model.
Ist()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
Ist
のコンストラクタ
Ist
-
org.simBio.bio.sarai_et_al_2003
の クラス
2次元表示のX軸で負の値が用いれないようなので、Vshiftをシフトさせる。
Ist()
- クラス org.simBio.bio.sarai_et_al_2003.
Ist
のコンストラクタ
Ist
-
org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf
の クラス
Sustained inward current reversal potential of about +13 mV.
Ist()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
Ist
のコンストラクタ
Istim
- クラス org.simBio.bio.noble_et_al_1998.
Model
の変数
It
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
APD
の変数
It
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
Vmax
の変数
iteratorSelected()
- インタフェース org.simBio.sim.gui.
CheckedJTreeModel
のメソッド
選択されているNodeを繰り返し処理する反復子を返します.
ITimeSeries
-
org.simBio.sim.ps
の インタフェース
時系列データを持っていることのマーク。
Ito
-
org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current
の クラス
Ito()
- クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.
Ito
のコンストラクタ
Ito
-
org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf
の クラス
Transient outward current, Ito (pA)
Ito()
- クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.
Ito
のコンストラクタ
Ito
-
org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current
の クラス
Transient outward current : Ito * @author Asakura
Ito()
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
Ito
のコンストラクタ
Ito
-
org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf
の クラス
Transient outward current.
Ito()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
Ito
のコンストラクタ
Ito_endo
-
org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current
の クラス
Transient outward current.
Ito_endo()
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.
Ito_endo
のコンストラクタ
iTotal
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
RyR
の変数
itotal
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
Cell
の変数
iTotal
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
APDforSA2
の変数
総電流 (pA)
iTotal
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
HR
の変数
総電流 (pA)
Itotal
- クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.
VmaxTime
の変数
total membrane current (pA)
itotalCa
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
Cell
の変数
itotalK
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
Cell
の変数
itotalNa
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.structure.
Cell
の変数
Iup
- クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.complex.
SR
の変数
iupbar
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
NSRLeak
の変数
iupbar
- クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.
SRCA
の変数
iv
- クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.
RateGraph_KA
の変数
IViewer
-
org.simBio.sim.analyzer.graph
の インタフェース
Enable both new graph and previous graph components to work.
IVRCC
-
org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf
の クラス
volume-regulated Cl- current.
IVRCC()
- クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.
IVRCC
のコンストラクタ
概要
パッケージ
クラス
使用
階層ツリー
非推奨 API
索引
ヘルプ
前の文字
次の文字
フレームあり
フレームなし
すべてのクラス
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
???(C) 2002-2007 ?????????????????????