org.simBio.bio.function
クラス Analytic2state

java.lang.Object
  org.simBio.core.Component
      org.simBio.core.Parameter
          org.simBio.core.Composite
              org.simBio.core.Reactor
                  org.simBio.bio.function.Function
                      org.simBio.bio.function.Analytic2state

すべての実装されたインタフェース:

Node

public class Analytic2state
extends Function

2 state gateの解析解を求めて現在の解に設定する。 「心臓のフィジオーム」p. 101-104参照。 時定数tauや収束値infinityがdtの間一定と見なせ、かつgateの変化がここだけで計算される場合に成り立つ。 ten Tusscher et al, 2004が公開しているソースでも用いられている方法。 dtを大きく取っても発散しないと思われる。 アドレスはhttp://www-binf.bio.uu.nl/khwjtuss/HVM 恐らくReference No 54の Rush and Larsen, IEEE Trans Biomed Eng 25:389-392, 1978 が詳しいと思われる。 xml/km/0005-2.xmlを参考にしてください。

バージョン:

$Revision: 1.1 $

作成者:

Nobuaki Sarai Created on 2004/05/25

フィールドの概要

Node	alfa
Node	beta
Node	dt
Node	previous

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド

value

コンストラクタの概要

Analytic2state()

メソッドの概要

protected void

calculate(double t) write equations here, and calculate dy over dt.

クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド

accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド

addValue, getValue, getValueString, prepare, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField

クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド

addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks

クラス java.lang.Object から継承されたメソッド

clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド

addDydt, addValue, getValue, setValue

フィールドの詳細

alfa

public Node alfa

beta

public Node beta

previous

public Node previous

dt

public Node dt

コンストラクタの詳細

Analytic2state

public Analytic2state()

メソッドの詳細

calculate

protected void calculate(double t)

クラス Reactor の記述:

write equations here, and calculate dy over dt.
計算中に呼び出される。 計算式を記載する。dy/dtをここで計算する。

定義:

クラス Reactor 内の calculate

パラメータ:

t - elapsed time (ms)