org.simBio.bio.himeno_et_al_2008
クラス IKs

java.lang.Object
  org.simBio.core.Component
      org.simBio.core.Parameter
          org.simBio.core.Composite
              org.simBio.core.Reactor
                  org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter
                      org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.MembraneTransporter
                          org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.CfChannel
                              org.simBio.bio.himeno_et_al_2008.IKs

すべての実装されたインタフェース:

Node

public class IKs
extends CfChannel

Delayed rectifier K⁺ current, slow component (pA). Vm dependency of gate1 rate constants are changed according to Matsuura et al,

バージョン:

$Id: IKs.java,v 1.1 2008/02/04 02:22:25 mikaelwing Exp $

作成者:

Himeno

関連項目:

IKs

フィールドの概要

double	amplitudePKAf to modulate PKA effect
Node	Ca intracellular Ca2+ concentration
Node	gate1 the open probability of voltage-dependent gate
Node	gate2 the open probability of [Ca2+]i-dependent gate
Node	gateC2 the C2 state probability of [Ca2+]i-dependent gate
Node	KCNQ1
Node	KCNQ1free
Node	KCNQ1p
Node	KCNQ1p_ratio
double	permeabilityK0
Component	Phosphorylation
Node	PKA
double	PKAtot
Node	POpen
double	relativePNa the permeability ratio of K+ and Na+
Node	Vm Membrane Potential (mV)
double	Vshift

クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.CfChannel から継承されたフィールド

Cm, constantFieldCa, constantFieldCl, constantFieldK, constantFieldNa, permeabilityCa, permeabilityCl, permeabilityK, permeabilityNa, pOpen

クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.MembraneTransporter から継承されたフィールド

cCl, CCl, currentCl

クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter から継承されたフィールド

cCa, CCa, cK, CK, cNa, CNa, current, currentCa, currentK, currentNa, total

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド

value

コンストラクタの概要

IKs()

メソッドの概要

protected void	calculate(double t) CompartmentのCl電流に足し合わせる。
protected void	prepare() initialization for IKs.

クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド

accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド

addValue, getValue, getValueString, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField

クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド

addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks

クラス java.lang.Object から継承されたメソッド

clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド

addDydt, addValue, getValue, setValue

フィールドの詳細

gate1

public Node gate1

the open probability of voltage-dependent gate

gate2

public Node gate2

the open probability of [Ca²⁺]_i-dependent gate

gateC2

public Node gateC2

the C2 state probability of [Ca²⁺]_i-dependent gate

Ca

public Node Ca

intracellular Ca²⁺ concentration

Vm

public Node Vm

Membrane Potential (mV)

Vshift

public double Vshift

permeabilityK0

public double permeabilityK0

relativePNa

public double relativePNa

the permeability ratio of K⁺ and Na⁺

Phosphorylation

public Component Phosphorylation

PKA

public Node PKA

PKAtot

public double PKAtot

KCNQ1

public Node KCNQ1

KCNQ1p

public Node KCNQ1p

KCNQ1free

public Node KCNQ1free

POpen

public Node POpen

KCNQ1p_ratio

public Node KCNQ1p_ratio

amplitudePKAf

public double amplitudePKAf

to modulate PKA effect

コンストラクタの詳細

IKs

public IKs()

メソッドの詳細

prepare

protected void prepare()

initialization for IKs.

オーバーライド:

クラス MembraneTransporter 内の prepare

関連項目:

Component.prepare()

calculate

protected void calculate(double t)

クラス MembraneTransporter の記述:

CompartmentのCl電流に足し合わせる。

オーバーライド:

クラス CfChannel 内の calculate

パラメータ:

t - time

関連項目:

CfChannel.calculate(double)