Troponin (simBio API)

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概要: 入れ子 | フィールド | コンストラクタ | メソッド

詳細: フィールド | コンストラクタ | メソッド

org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction
クラス Troponin

java.lang.Object
  org.simBio.core.Component
      org.simBio.core.Parameter
          org.simBio.core.Composite
              org.simBio.core.Reactor
                  org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.Troponin

すべての実装されたインタフェース:: Node

直系の既知のサブクラス:: Troponinmit

public class Troponin
extends Reactor
extends Reactor

troponin of Negroni and Lascano contraction model. Modified the scale factor dX/dt to make stable with load.

バージョン:: $Id: Troponin.java,v 1.1 2007/12/15 07:21:54 nsarai Exp $
作成者:: SHIMAYOSHI Takao
関連項目:: Negroni JA and Lascano EC, J Mol Cell Cardiol 28: 915-929, 1996.

フィールドの概要
`Node`	`ATP`
`protected double`	`BIAS`
`Node`	`Ca`
`Node`	`CaTotal`
`Node`	`dATP`
`Node`	`dXdt`
`protected double`	`dXdtFactor`
`Node`	`L`
`protected double`	`La`
`protected double`	`r1`
`protected double`	`r2` adjusted by 2.5 * r1
`Node`	`T`
`Node`	`TCa`
`Node`	`TCaCB`
`Node`	`TCB`
`double`	`Tt`
`protected double`	`Y1`
`protected double`	`Y2`
`protected double`	`Y3`
`protected double`	`Y4`
`protected double`	`Yd`
`protected double`	`Z1`
`protected double`	`Z2`
`protected double`	`Z3`

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド
`value`

コンストラクタの概要
`Troponin()`

メソッドの概要
`protected void`	`calculate(double t)` write equations here, and calculate dy over dt.

クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド
`accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize`

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド
`addValue, getValue, getValueString, prepare, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField`

クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド
`addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks`

クラス java.lang.Object から継承されたメソッド
`clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait`

インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド
`addDydt, addValue, getValue, setValue`

フィールドの詳細

r1

protected double r1

r2

protected double r2

adjusted by 2.5 * r1

BIAS

protected double BIAS

Y1

protected double Y1

Z1

protected double Z1

Y2

protected double Y2

Z2

protected double Z2

Y3

protected double Y3

Z3

protected double Z3

Y4

protected double Y4

Yd

protected double Yd

La

protected double La

Tt

public double Tt

dXdtFactor

protected double dXdtFactor

T

public Node T

TCa

public Node TCa

TCaCB

public Node TCaCB

TCB

public Node TCB

L

public Node L

dXdt

public Node dXdt

Ca

public Node Ca

CaTotal

public Node CaTotal

ATP

public Node ATP

dATP

public Node dATP

コンストラクタの詳細

Troponin

public Troponin()

メソッドの詳細

calculate

protected void calculate(double t)

クラス Reactor の記述:

write equations here, and calculate dy over dt.
計算中に呼び出される。計算式を記載する。dy/dtをここで計算する。

定義:: クラス Reactor 内の calculate

パラメータ:: t - elapsed time (ms)

概要