org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf
クラス ICaL

java.lang.Object
  上位を拡張 org.simBio.core.Component
      上位を拡張 org.simBio.core.Parameter
          上位を拡張 org.simBio.core.Composite
              上位を拡張 org.simBio.core.Reactor
                  上位を拡張 org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter
                      上位を拡張 org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.MembraneTransporter
                          上位を拡張 org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.CfChannel
                              上位を拡張 org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.ICaL
すべての実装されたインタフェース:
Node

public class ICaL
extends CfChannel

L-type Ca channel. PKA factor is incorporated. 4 state voltage gate, from Shirokov et al. 1993, 4 state Calcium gate, from Shirokov et al. 1993, ultra-slow inactivation, ATP Dependency from Noma& Shibasaki 1985 J.Physiol,363:441-462.

バージョン:
$Id: ICaL.java,v 1.1 2007/12/15 07:21:54 nsarai Exp $
作成者:
Hiroyuki Nakai, Masanori Kuzumoto
関連項目:
Kuzumoto et al, 2007., ICaL, ICaL

フィールドの概要
 Node ATP
          intracellular ATP concentration (mM)
 Node CaDiadic
          local Ca2+ concentration near the mouth of L-type Ca channel (mM)
 Node Cai
          intracellular Ca2+ concentration (mM)
 Node gate
          ultra-slow gate probability
 double hill_n
           
 double KmPKA
           
 double MAX
           
 Node pAI
          AI state probability for voltage-dependent gate
 Node pAP
          AP state probability for voltage-dependent gate
 Node pC
          C state probability for calcium-dependent gate
 Node PCa
           
 Node PCl
           
 Node PK
           
 Node PKA
          PKA catalitic domain I concentration
 Node PKA_fac
           
 double PKA0
           
 Node PNa
           
 Node pRP
          PR state probability for voltage-dependent gate
 Node pU
          U state probability for calcium-dependent gate
 Node pUCa
          UCa state probability for calcium-dependent gate
 Node SingleCurrentAMP
          to see single current amplitude
 Node Vm
          membrane potential (mV)
 double Vshift
          a shift of activation potential for 4 state voltage gate
 
クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.CfChannel から継承されたフィールド
Cm, constantFieldCa, constantFieldCl, constantFieldK, constantFieldNa, permeabilityCa, permeabilityCl, permeabilityK, permeabilityNa, pOpen
 
クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.MembraneTransporter から継承されたフィールド
cCl, CCl, currentCl
 
クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter から継承されたフィールド
cCa, CCa, cK, CK, cNa, CNa, current, currentCa, currentK, currentNa, total
 
クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド
value
 
コンストラクタの概要
ICaL()
           
 
メソッドの概要
protected  void calculate(double t)
           CompartmentのCl電流に足し合わせる。
protected  void prepare()
          construct null current
 
クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド
accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize
 
クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド
addValue, getValue, getValueString, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField
 
クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド
addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks
 
クラス java.lang.Object から継承されたメソッド
clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait
 
インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド
addDydt, addValue, getValue, setValue
 

フィールドの詳細

Vm

public Node Vm
membrane potential (mV)


Vshift

public double Vshift
a shift of activation potential for 4 state voltage gate


Cai

public Node Cai
intracellular Ca2+ concentration (mM)


ATP

public Node ATP
intracellular ATP concentration (mM)


pRP

public Node pRP
PR state probability for voltage-dependent gate


pAP

public Node pAP
AP state probability for voltage-dependent gate


pAI

public Node pAI
AI state probability for voltage-dependent gate


pC

public Node pC
C state probability for calcium-dependent gate


pU

public Node pU
U state probability for calcium-dependent gate


pUCa

public Node pUCa
UCa state probability for calcium-dependent gate


gate

public Node gate
ultra-slow gate probability


CaDiadic

public Node CaDiadic
local Ca2+ concentration near the mouth of L-type Ca channel (mM)


PKA

public Node PKA
PKA catalitic domain I concentration


PKA0

public double PKA0

MAX

public double MAX

KmPKA

public double KmPKA

hill_n

public double hill_n

PKA_fac

public Node PKA_fac

SingleCurrentAMP

public Node SingleCurrentAMP
to see single current amplitude


PNa

public Node PNa

PK

public Node PK

PCa

public Node PCa

PCl

public Node PCl
コンストラクタの詳細

ICaL

public ICaL()
メソッドの詳細

prepare

protected void prepare()
クラス MembraneTransporter の記述:
construct null current

オーバーライド:
クラス MembraneTransporter 内の prepare
関連項目:
Component.prepare()

calculate

protected void calculate(double t)
クラス MembraneTransporter の記述:
CompartmentのCl電流に足し合わせる。

オーバーライド:
クラス CfChannel 内の calculate
パラメータ:
t - time
関連項目:
CfChannel.calculate(double)


???(C) 2002-2007 ?????????????????????