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前のクラス 次のクラス | フレームあり フレームなし | |||||||||
概要: 入れ子 | フィールド | コンストラクタ | メソッド | 詳細: フィールド | コンストラクタ | メソッド |
java.lang.Object org.simBio.core.Component org.simBio.core.Parameter org.simBio.core.Composite org.simBio.core.Reactor org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.MembraneTransporter org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.CfChannel org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.cf.ICaL
public class ICaL
L-type Ca channel. PKA factor is incorporated. 4 state voltage gate, from Shirokov et al. 1993, 4 state Calcium gate, from Shirokov et al. 1993, ultra-slow inactivation, ATP Dependency from Noma& Shibasaki 1985 J.Physiol,363:441-462.
ICaL
,
ICaL
フィールドの概要 | |
---|---|
Node |
ATP
intracellular ATP concentration (mM) |
Node |
CaDiadic
local Ca2+ concentration near the mouth of L-type Ca channel (mM) |
Node |
Cai
intracellular Ca2+ concentration (mM) |
Node |
gate
ultra-slow gate probability |
double |
hill_n
|
double |
KmPKA
|
double |
MAX
|
Node |
pAI
AI state probability for voltage-dependent gate |
Node |
pAP
AP state probability for voltage-dependent gate |
Node |
pC
C state probability for calcium-dependent gate |
Node |
PCa
|
Node |
PCl
|
Node |
PK
|
Node |
PKA
PKA catalitic domain I concentration |
Node |
PKA_fac
|
double |
PKA0
|
Node |
PNa
|
Node |
pRP
PR state probability for voltage-dependent gate |
Node |
pU
U state probability for calcium-dependent gate |
Node |
pUCa
UCa state probability for calcium-dependent gate |
Node |
SingleCurrentAMP
to see single current amplitude |
Node |
Vm
membrane potential (mV) |
double |
Vshift
a shift of activation potential for 4 state voltage gate |
クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.cf.CfChannel から継承されたフィールド |
---|
Cm, constantFieldCa, constantFieldCl, constantFieldK, constantFieldNa, permeabilityCa, permeabilityCl, permeabilityK, permeabilityNa, pOpen |
クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.MembraneTransporter から継承されたフィールド |
---|
cCl, CCl, currentCl |
クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter から継承されたフィールド |
---|
cCa, CCa, cK, CK, cNa, CNa, current, currentCa, currentK, currentNa, total |
クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド |
---|
value |
コンストラクタの概要 | |
---|---|
ICaL()
|
メソッドの概要 | |
---|---|
protected void |
calculate(double t)
CompartmentのCl電流に足し合わせる。 |
protected void |
prepare()
construct null current |
クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド |
---|
accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize |
クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド |
---|
addValue, getValue, getValueString, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField |
クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド |
---|
addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks |
クラス java.lang.Object から継承されたメソッド |
---|
clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait |
インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド |
---|
addDydt, addValue, getValue, setValue |
フィールドの詳細 |
---|
public Node Vm
public double Vshift
public Node Cai
public Node ATP
public Node pRP
public Node pAP
public Node pAI
public Node pC
public Node pU
public Node pUCa
public Node gate
public Node CaDiadic
public Node PKA
public double PKA0
public double MAX
public double KmPKA
public double hill_n
public Node PKA_fac
public Node SingleCurrentAMP
public Node PNa
public Node PK
public Node PCa
public Node PCl
コンストラクタの詳細 |
---|
public ICaL()
メソッドの詳細 |
---|
protected void prepare()
MembraneTransporter
の記述:
MembraneTransporter
内の prepare
Component.prepare()
protected void calculate(double t)
MembraneTransporter
の記述:
CfChannel
内の calculate
t
- timeCfChannel.calculate(double)
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