org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function
クラス PA2MS

java.lang.Object
  org.simBio.core.Component
      org.simBio.core.Parameter
          org.simBio.core.Composite
              org.simBio.core.Reactor
                  org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function.Average
                      org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function.PA2MS

すべての実装されたインタフェース:

Node

public class PA2MS
extends Average

Average and Convert pA to M/S.

バージョン:

$Id: PA2MS.java,v 1.1 2007/12/15 07:21:54 nsarai Exp $

作成者:

Sarai

フィールドの概要

double	F Faraday Constant (Coulomb/mM)
double	valence ion valence
Node	Vi internal volume (um^3)

クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.function.Average から継承されたフィールド

converter, cycle, sum, t0, target

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド

value

コンストラクタの概要

PA2MS()

メソッドの概要

protected void	calculate(double t) write equations here, and calculate dy over dt.
protected void	prepare() 親が自分と同じ名前のpublic doubleを持っていれば、自分の値を設定する。

クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド

accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド

addValue, getValue, getValueString, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField

クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド

addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks

クラス java.lang.Object から継承されたメソッド

clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド

addDydt, addValue, getValue, setValue

フィールドの詳細

Vi

public Node Vi

internal volume (um^3)

valence

public double valence

ion valence

F

public double F

Faraday Constant (Coulomb/mM)

コンストラクタの詳細

PA2MS

public PA2MS()

メソッドの詳細

calculate

protected void calculate(double t)

クラス Reactor の記述:

write equations here, and calculate dy over dt.
計算中に呼び出される。 計算式を記載する。dy/dtをここで計算する。

オーバーライド:

クラス Average 内の calculate

パラメータ:

t - elapsed time (ms)

prepare

protected void prepare()

クラス Parameter の記述:

親が自分と同じ名前のpublic doubleを持っていれば、自分の値を設定する。

オーバーライド:

クラス Average 内の prepare

関連項目:

Component.prepare()