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概要: 入れ子 | フィールド | コンストラクタ | メソッド | 詳細: フィールド | コンストラクタ | メソッド |
java.lang.Object org.simBio.core.Component org.simBio.core.Parameter org.simBio.core.Composite org.simBio.core.Reactor org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.Carrier
public abstract class Carrier
Abstract class for ping-pong model of the carrier. Calculate Na, K, Ca ion movements using reduced 2 state model.
フィールドの概要 | |
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Node |
amplitude
amplitude factor (A/F) |
double |
Cm
membrane capacitance (pF) |
protected double |
E1A
probabilities at each state |
protected double |
E1B
probabilities at each state |
protected double |
E2A
probabilities at each state |
protected double |
E2B
probabilities at each state |
Node |
gate
reduced 2-state gate |
protected double |
k1
rate constants (/ms) |
protected double |
k2
rate constants (/ms) |
protected double |
k3
rate constants (/ms) |
protected double |
k4
rate constants (/ms) |
double |
stoichiometryCa
stoichiometry for Ca2+ |
double |
stoichiometryK
stoichiometry for K+ |
double |
stoichiometryNa
stoichiometry for Na+ |
クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter から継承されたフィールド |
---|
cCa, CCa, cK, CK, cNa, CNa, current, currentCa, currentK, currentNa, total |
クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド |
---|
value |
コンストラクタの概要 | |
---|---|
Carrier()
|
メソッドの概要 | |
---|---|
protected void |
calculate(double t)
calculate total charge movement using reduced 2 state model 2 state gateを用いて電流を計算する |
クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter から継承されたメソッド |
---|
prepare |
クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド |
---|
accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize |
クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド |
---|
addValue, getValue, getValueString, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField |
クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド |
---|
addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks |
クラス java.lang.Object から継承されたメソッド |
---|
clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait |
インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド |
---|
addDydt, addValue, getValue, setValue |
フィールドの詳細 |
---|
public Node gate
public double stoichiometryNa
public double stoichiometryK
public double stoichiometryCa
public Node amplitude
public double Cm
protected double k1
protected double k2
protected double k3
protected double k4
protected double E1A
protected double E2A
protected double E1B
protected double E2B
コンストラクタの詳細 |
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public Carrier()
メソッドの詳細 |
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protected void calculate(double t)
MembraneTransporter
内の calculate
t
- time
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