org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier
クラス Carrier

java.lang.Object
  上位を拡張 org.simBio.core.Component
      上位を拡張 org.simBio.core.Parameter
          上位を拡張 org.simBio.core.Composite
              上位を拡張 org.simBio.core.Reactor
                  上位を拡張 org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter
                      上位を拡張 org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.Carrier
すべての実装されたインタフェース:
Node
直系の既知のサブクラス:
ICaPump, ICaPump, INaCa, INaK, INaK, IPMCA, IPMCA

public abstract class Carrier
extends MembraneTransporter

Abstract class for ping-pong model of the carrier. Calculate Na, K, Ca ion movements using reduced 2 state model.

バージョン:
$Revision: 1.5 $
作成者:
Nobuaki Sarai
関連項目:
Eqs (10)-(12), (23)-(25), (35)-(37) in Table 7 in Matsuoka et al, 2003

フィールドの概要
 Node amplitude
          amplitude factor (A/F)
 double Cm
          membrane capacitance (pF)
protected  double E1A
          probabilities at each state
protected  double E1B
          probabilities at each state
protected  double E2A
          probabilities at each state
protected  double E2B
          probabilities at each state
 Node gate
          reduced 2-state gate
protected  double k1
          rate constants (/ms)
protected  double k2
          rate constants (/ms)
protected  double k3
          rate constants (/ms)
protected  double k4
          rate constants (/ms)
 double stoichiometryCa
          stoichiometry for Ca2+
 double stoichiometryK
          stoichiometry for K+
 double stoichiometryNa
          stoichiometry for Na+
 
クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter から継承されたフィールド
cCa, CCa, cK, CK, cNa, CNa, current, currentCa, currentK, currentNa, total
 
クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド
value
 
コンストラクタの概要
Carrier()
           
 
メソッドの概要
protected  void calculate(double t)
          calculate total charge movement using reduced 2 state model
2 state gateを用いて電流を計算する
 
クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter から継承されたメソッド
prepare
 
クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド
accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize
 
クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド
addValue, getValue, getValueString, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField
 
クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド
addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks
 
クラス java.lang.Object から継承されたメソッド
clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait
 
インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド
addDydt, addValue, getValue, setValue
 

フィールドの詳細

gate

public Node gate
reduced 2-state gate


stoichiometryNa

public double stoichiometryNa
stoichiometry for Na+


stoichiometryK

public double stoichiometryK
stoichiometry for K+


stoichiometryCa

public double stoichiometryCa
stoichiometry for Ca2+


amplitude

public Node amplitude
amplitude factor (A/F)


Cm

public double Cm
membrane capacitance (pF)


k1

protected double k1
rate constants (/ms)


k2

protected double k2
rate constants (/ms)


k3

protected double k3
rate constants (/ms)


k4

protected double k4
rate constants (/ms)


E1A

protected double E1A
probabilities at each state


E2A

protected double E2A
probabilities at each state


E1B

protected double E1B
probabilities at each state


E2B

protected double E2B
probabilities at each state

コンストラクタの詳細

Carrier

public Carrier()
メソッドの詳細

calculate

protected void calculate(double t)
calculate total charge movement using reduced 2 state model
2 state gateを用いて電流を計算する

オーバーライド:
クラス MembraneTransporter 内の calculate
パラメータ:
t - time


???(C) 2002-2007 ?????????????????????