org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier
クラス INaCa

java.lang.Object
  上位を拡張 org.simBio.core.Component
      上位を拡張 org.simBio.core.Parameter
          上位を拡張 org.simBio.core.Composite
              上位を拡張 org.simBio.core.Reactor
                  上位を拡張 org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter
                      上位を拡張 org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.Carrier
                          上位を拡張 org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.INaCa
すべての実装されたインタフェース:
Node

public class INaCa
extends Carrier

Na/Ca exchanger.

作成者:
modified by B.J. Kim, Nobuaki Sarai
関連項目:
Eqs (2)-(9) in Table 7 in Matsuoka et al, 2003
XML example
explanation (Japanese, WORD doc)

フィールドの概要
 Node Cai
          concentration of intracellular Calcium[mM]
 Node Cao
          concentration of intracellular Calcium[mM]
 double F
          Faraday constant default value is 96.4867[C/mmol]
 double KmCai
          dissociation constant for intracellular Calcium [mM]
 double KmCao
          dissociation constant for intracellular Calcium [mM]
 double KmNai
          dissociation constant for intracellular Sodium[mM]
 double KmNao
          dissociation constant for extracellular Sodium[mM]
 Node Nai
          concentration of intracellular Sodium [mM]
 Node Nao
          concentration of intracellular Sodium [mM]
 double nHNa
          experimental index for Hill constant about Sodium
 double partition
          distribution constant
 double R
          gas constant default value is 8.3143[C*mV/K/mmol]
 Node T
          absolute temperature[K]
 Node Vm
          membrane potential of cell[mV]
 
クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.Carrier から継承されたフィールド
amplitude, Cm, E1A, E1B, E2A, E2B, gate, k1, k2, k3, k4, stoichiometryCa, stoichiometryK, stoichiometryNa
 
クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter から継承されたフィールド
cCa, CCa, cK, CK, cNa, CNa, current, currentCa, currentK, currentNa, total
 
クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド
value
 
コンストラクタの概要
INaCa()
           
 
メソッドの概要
protected  void calculate(double t)
          calculate total charge movement using reduced 2 state model
2 state gateを用いて電流を計算する
 void prepare()
          construct null current
 
クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド
accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize
 
クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド
addValue, getValue, getValueString, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField
 
クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド
addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks
 
クラス java.lang.Object から継承されたメソッド
clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait
 
インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド
addDydt, addValue, getValue, setValue
 

フィールドの詳細

Nai

public Node Nai
concentration of intracellular Sodium [mM]


Nao

public Node Nao
concentration of intracellular Sodium [mM]


Cai

public Node Cai
concentration of intracellular Calcium[mM]


Cao

public Node Cao
concentration of intracellular Calcium[mM]


Vm

public Node Vm
membrane potential of cell[mV]


T

public Node T
absolute temperature[K]


R

public double R
gas constant default value is 8.3143[C*mV/K/mmol]


F

public double F
Faraday constant default value is 96.4867[C/mmol]


KmNao

public double KmNao
dissociation constant for extracellular Sodium[mM]


KmNai

public double KmNai
dissociation constant for intracellular Sodium[mM]


KmCao

public double KmCao
dissociation constant for intracellular Calcium [mM]


KmCai

public double KmCai
dissociation constant for intracellular Calcium [mM]


nHNa

public double nHNa
experimental index for Hill constant about Sodium


partition

public double partition
distribution constant

コンストラクタの詳細

INaCa

public INaCa()
メソッドの詳細

calculate

protected void calculate(double t)
クラス Carrier の記述:
calculate total charge movement using reduced 2 state model
2 state gateを用いて電流を計算する

オーバーライド:
クラス Carrier 内の calculate
パラメータ:
t - time

prepare

public void prepare()
クラス MembraneTransporter の記述:
construct null current

オーバーライド:
クラス MembraneTransporter 内の prepare
関連項目:
Component.prepare()


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