org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function
クラス Current

java.lang.Object
  org.simBio.core.Component
      org.simBio.core.Parameter
          org.simBio.core.Composite
              org.simBio.core.Reactor
                  org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.Current

すべての実装されたインタフェース:

IResetBeforeCalc, Node

public class Current
extends Reactor
implements IResetBeforeCalc

Calculate concentration (mM) change from current (pA).

バージョン:

$Id: Current.java,v 1.2 2007/10/17 04:26:16 nsarai Exp $

作成者:

Nobuaki Sarai

関連項目:

XML example, explanation (Japanese, WORD doc)

フィールドの概要

double	F Faraday Constant (Coulomb/mM)
Node	in internal ion concentration (mM)
Node	out external ion concentration (mM)
double	valence ion valence
Node	Vi internal volume (um^3)
Node	Vo external volume (um^3)

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド

value

コンストラクタの概要

Current()

メソッドの概要

protected void	calculate(double t) convert current (pA) to d[X]/dt (mM)
protected void	prepare() 親が自分と同じ名前のpublic doubleを持っていれば、自分の値を設定する。

クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド

accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド

addValue, getValue, getValueString, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField

クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド

addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks

クラス java.lang.Object から継承されたメソッド

clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド

addDydt, addValue, getValue, setValue

フィールドの詳細

Vi

public Node Vi

internal volume (um^3)

Vo

public Node Vo

external volume (um^3)

in

public Node in

internal ion concentration (mM)

out

public Node out

external ion concentration (mM)

valence

public double valence

ion valence

F

public double F

Faraday Constant (Coulomb/mM)

コンストラクタの詳細

Current

public Current()

メソッドの詳細

calculate

protected void calculate(double t)

convert current (pA) to d[X]/dt (mM)

定義:

クラス Reactor 内の calculate

パラメータ:

t - elapsed time (ms)

関連項目:

Reactor.calculate(double)

prepare

protected void prepare()

クラス Parameter の記述:

親が自分と同じ名前のpublic doubleを持っていれば、自分の値を設定する。

オーバーライド:

クラス Parameter 内の prepare

関連項目:

Component.prepare()