org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function
クラス Diffusion

java.lang.Object
  org.simBio.core.Component
      org.simBio.core.Parameter
          org.simBio.core.Composite
              org.simBio.core.Reactor
                  org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.Diffusion

すべての実装されたインタフェース:

Node

public class Diffusion
extends Reactor

using dy/dt to calculate first order ordinary differential equation.

バージョン:

$Revision: 1.1 $

作成者:

Nobuaki Sarai

フィールドの概要

double	infinity
Variable	target
double	tau

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド

value

コンストラクタの概要

Diffusion()

メソッドの概要

protected void

calculate(double t) dy/dt = (inf - y)/ tau

クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド

accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド

addValue, getValue, getValueString, prepare, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField

クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド

addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks

クラス java.lang.Object から継承されたメソッド

clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド

addDydt, addValue, getValue, setValue

フィールドの詳細

target

public Variable target

infinity

public double infinity

tau

public double tau

コンストラクタの詳細

Diffusion

public Diffusion()

メソッドの詳細

calculate

protected void calculate(double t)

dy/dt = (inf - y)/ tau

定義:

クラス Reactor 内の calculate

パラメータ:

t - elapsed time (ms)