org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function
クラス Diffusion_a

java.lang.Object
  org.simBio.core.Component
      org.simBio.core.Parameter
          org.simBio.core.Composite
              org.simBio.core.Reactor
                  org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.function.Diffusion_a

すべての実装されたインタフェース:

Node

public class Diffusion_a
extends Reactor

The first order ordinary differential equation is solved using analytic equation. The tau and infinity is assumed constant during dt. This class doesn't work under Runge-Kutta, use Diffusion.java instead. Created on 2004/05/26

バージョン:

$Revision: 1.1 $

作成者:

Nobuaki Sarai

フィールドの概要

Node	dt
double	infinity
Node	target
double	tau

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド

value

コンストラクタの概要

Diffusion_a()

メソッドの概要

protected void

calculate(double t) y = inf -(inf - y_old) * exp(-t/tau)

クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド

accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド

addValue, getValue, getValueString, prepare, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField

クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド

addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks

クラス java.lang.Object から継承されたメソッド

clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド

addDydt, addValue, getValue, setValue

フィールドの詳細

target

public Node target

dt

public Node dt

infinity

public double infinity

tau

public double tau

コンストラクタの詳細

Diffusion_a

public Diffusion_a()

メソッドの詳細

calculate

protected void calculate(double t)

y = inf -(inf - y_old) * exp(-t/tau)

定義:

クラス Reactor 内の calculate

パラメータ:

t - elapsed time (ms)

関連項目:

Diffusion.calculate(double)