org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca
クラス Analytic

java.lang.Object
  org.simBio.core.Component
      org.simBio.core.Parameter
          org.simBio.core.Composite
              org.simBio.core.Reactor
                  org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Buffer
                      org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.Analytic

すべての実装されたインタフェース:

Node

public class Analytic
extends Buffer

instantaneous Ca buffer, using analytic equation as for Zeng et al, 1995 J. Zeng, K. R. Laurita, D. S. Rosenbaum, Y. Rudy, Two Components of the Delayed Rectifier K+ Current in Ventricular Myocytes of the Guinea Pig Type Theoretical Formulation and Their Role in Repolarization, Circulation Research. 1995;77:140-152. http://circres.ahajournals.org/cgi/content/abstract/77/1/140?ijkey=e93a018c45e7d0bfaf1ee5d9cbbbededc669ee45&keytype2=tf_ipsecsha
free Caを、解析式を使って求める。 Runge-Kuttaで計算するときは、freeをVariableとしておくと、 前回の計算サイクルの値を使うことが出来る。

作成者:

Nobuaki Sarai

フィールドの概要

Node	Ca
double	Km

クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Buffer から継承されたフィールド

free, total

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド

value

コンストラクタの概要

Analytic()

メソッドの概要

protected void	calculate(double t) instantaneous equiribrium
protected void	end() 終了時にCaの値をバッファリングされた値に更新するためにcalculateを呼び出す。

クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド

accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド

addValue, getValue, getValueString, prepare, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField

クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド

addDydt, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks

クラス java.lang.Object から継承されたメソッド

clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド

addDydt, addValue, getValue, setValue

フィールドの詳細

Km

public double Km

Ca

public Node Ca

コンストラクタの詳細

Analytic

public Analytic()

メソッドの詳細

calculate

protected void calculate(double t)

instantaneous equiribrium

定義:

クラス Reactor 内の calculate

パラメータ:

t - elapsed time (ms)

end

protected void end()

終了時にCaの値をバッファリングされた値に更新するためにcalculateを呼び出す。

オーバーライド:

クラス Component 内の end

関連項目:

Component.end()