org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca
クラス TroponinNL_RK

java.lang.Object
  上位を拡張 org.simBio.core.Component
      上位を拡張 org.simBio.core.Parameter
          上位を拡張 org.simBio.core.Composite
              上位を拡張 org.simBio.core.Reactor
                  上位を拡張 org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Buffer
                      上位を拡張 org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.TroponinNL
                          上位を拡張 org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.TroponinNL_RK
すべての実装されたインタフェース:
Node
直系の既知のサブクラス:
TroponinNL_RK

public class TroponinNL_RK
extends TroponinNL

Troponin state transition of Negroni and Lascano contraction model for Runge-Kutta.

バージョン:
$Log: TroponinNL_RK.java,v $ Revision 1.1 2005/11/01 06:32:40 mikaelwing First version of simBio hosted on sourceforge, version 0.3 Revision 1.1 2005/09/12 04:57:32 sarai rearrenge folder structure as a Maven style Revision 1.4 2005/08/29 02:01:22 sarai revised javadoc
2005/02/22 10:29:10 Some comments are added.
2004/09/17 05:21:24 delete dupricated portion.
2004/7/24 calculate ATP consumption.
作成者:
Nobuaki Sarai
関連項目:
Negroni JA and Lascano EC, 1996.
XML example
explanation (WORD doc)

フィールドの概要
 Node CaTotal
          total Ca concentration
 
クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.TroponinNL から継承されたフィールド
alfa1, alfa2, alfa3, alfa4, alfa5, ATP, ATPconsumingRate, ATPconsumption, beta1, beta2, beta3, bias, Ca, Cai, crossBridge, dATP, pCa, pCaCB, pCB, Q1, Q2, Q3, Q4, Q5, t0, TCa, TCaCB, TCB
 
クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Buffer から継承されたフィールド
free, total
 
クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド
value
 
コンストラクタの概要
TroponinNL_RK()
           
 
メソッドの概要
protected  void calculate(double t)
          write equations here, and calculate dy over dt.
 
クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.TroponinNL から継承されたメソッド
getCBbound, prepare
 
クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド
accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize
 
クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド
addValue, getValue, getValueString, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField
 
クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド
addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks
 
クラス java.lang.Object から継承されたメソッド
clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait
 
インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド
addDydt, addValue, getValue, setValue
 

フィールドの詳細

CaTotal

public Node CaTotal
total Ca concentration

コンストラクタの詳細

TroponinNL_RK

public TroponinNL_RK()
メソッドの詳細

calculate

protected void calculate(double t)
クラス Reactor の記述:
write equations here, and calculate dy over dt.
計算中に呼び出される。 計算式を記載する。dy/dtをここで計算する。

オーバーライド:
クラス TroponinNL 内の calculate
パラメータ:
t - elapsed time (ms)


???(C) 2002-2007 ?????????????????????