org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.enzyme
クラス CrossBridgeNL

java.lang.Object
  org.simBio.core.Component
      org.simBio.core.Parameter
          org.simBio.core.Composite
              org.simBio.core.Reactor
                  org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.enzyme.CrossBridgeNL

すべての実装されたインタフェース:

Node

直系の既知のサブクラス:

IsometricContraction, IsotonicContraction

public abstract class CrossBridgeNL
extends Reactor

Cross bridge kinetics of Cardiac Muscle Model by Negroni and Lascano.

バージョン:

$Log: CrossBridgeNL.java,v $ Revision 1.1 2005/11/01 06:32:40 mikaelwing First version of simBio hosted on sourceforge, version 0.3 Revision 1.1 2005/09/12 04:57:34 sarai rearrenge folder structure as a Maven style Revision 1.4 2005/08/29 02:02:49 sarai dX/dT^2 is the same as in the Matsuoka et al, 2004

作成者:

Nobuaki Sarai, modified by Kim

関連項目:

Negroni JA and Lascano EC, A cardiac muscle model relating sarcomere dynamics to calcium kinetics. J Mol Cell Cardiol 28: 915-929, 1996., explanation (WORD doc)

フィールドの概要

Node	forceCB
protected double	ForceEcomp
Node	forceExt
protected double	forceFactor
Node	h
Node	halfsarcomerelength
Node	InextensibleLength
protected double	KForceEC
protected double	KForceLinearEc
protected double	NewCBF
protected double	optimumHSL
TroponinNL	troponin
protected double	ZeroForceEL

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド

value

コンストラクタの概要

CrossBridgeNL()

メソッドの概要

protected void	calculate(double t) calculate the rate of change in the cross bridge length, dX/dt
double	getCBfactor()
double	getEffectiveFraction()

クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド

accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド

addValue, getValue, getValueString, prepare, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField

クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド

addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks

クラス java.lang.Object から継承されたメソッド

clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド

addDydt, addValue, getValue, setValue

フィールドの詳細

forceExt

public Node forceExt

forceCB

public Node forceCB

halfsarcomerelength

public Node halfsarcomerelength

NewCBF

protected double NewCBF

optimumHSL

protected double optimumHSL

KForceEC

protected double KForceEC

ZeroForceEL

protected double ZeroForceEL

KForceLinearEc

protected double KForceLinearEc

forceFactor

protected double forceFactor

ForceEcomp

protected double ForceEcomp

h

public Node h

troponin

public TroponinNL troponin

InextensibleLength

public Node InextensibleLength

コンストラクタの詳細

CrossBridgeNL

public CrossBridgeNL()

メソッドの詳細

getCBfactor

public double getCBfactor()

戻り値:

dydtCBL²

getEffectiveFraction

public double getEffectiveFraction()

戻り値:

-20(hSL-optimumHSL)²

calculate

protected void calculate(double t)

calculate the rate of change in the cross bridge length, dX/dt

定義:

クラス Reactor 内の calculate

パラメータ:

t - elapsed time (ms)