org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.current.carrier
クラス ICaPump

java.lang.Object
  org.simBio.core.Component
      org.simBio.core.Parameter
          org.simBio.core.Composite
              org.simBio.core.Reactor
                  org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter
                      org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.Carrier
                          org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.ICaPump
                              org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.current.carrier.ICaPump

すべての実装されたインタフェース:

Node

public class ICaPump
extends ICaPump

Ca pump on network SR. Differential equation of ADP production is incorporated.

導入されたバージョン:

rc20

バージョン:

$Log: ICaPump.java,v $ Revision 1.1 2005/11/01 06:32:40 mikaelwing First version of simBio hosted on sourceforge, version 0.3 Revision 1.1 2005/09/12 04:57:39 sarai rearrenge folder structure as a Maven style Revision 1.2 2005/08/04 08:43:04 sarai revise Javadoc to suppress Warnings
2004/12/17 05:43:03 update
2004/09/22 06:41:39 Created.

作成者:

SAITO Ryuta

フィールドの概要

Node

ADP

クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.ICaPump から継承されたフィールド

ATP, ATPconsumingRate, ATPconsumption, Cai, Cao, dATP, F, KmATP, KmCaCp, KmCaSR, t0, Vi

クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.Carrier から継承されたフィールド

amplitude, Cm, E1A, E1B, E2A, E2B, gate, k1, k2, k3, k4, stoichiometryCa, stoichiometryK, stoichiometryNa

クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter から継承されたフィールド

cCa, CCa, cK, CK, cNa, CNa, current, currentCa, currentK, currentNa, total

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド

value

コンストラクタの概要

ICaPump()

メソッドの概要

protected void

calculate(double t) calculate total charge movement using reduced 2 state model 2 state gateを用いて電流を計算する

クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.ICaPump から継承されたメソッド

prepare

クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド

accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド

addValue, getValue, getValueString, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField

クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド

addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks

クラス java.lang.Object から継承されたメソッド

clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド

addDydt, addValue, getValue, setValue

フィールドの詳細

ADP

public Node ADP

コンストラクタの詳細

ICaPump

public ICaPump()

メソッドの詳細

calculate

protected void calculate(double t)

クラス Carrier の記述:

calculate total charge movement using reduced 2 state model
2 state gateを用いて電流を計算する

オーバーライド:

クラス ICaPump 内の calculate

パラメータ:

t - time