org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function
クラス ConcentrationAMP

java.lang.Object
  上位を拡張 org.simBio.core.Component
      上位を拡張 org.simBio.core.Parameter
          上位を拡張 org.simBio.core.Composite
              上位を拡張 org.simBio.core.Reactor
                  上位を拡張 org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.MassConservation2
                      上位を拡張 org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.ConcentrationAMP
すべての実装されたインタフェース:
Node

public class ConcentrationAMP
extends MassConservation2

calculation of AMP concentration (conformed to mass conservation law)

  [Adenosine]total_cell = [ATP]cell + [ADP]cell + [AMP]
  [AMP] = [Adenosine]total_cell - [ATP]cell - [ADP]cell
 

導入されたバージョン:
rc20
バージョン:
$Log: ConcentrationAMP.java,v $ Revision 1.1 2005/11/01 06:32:39 mikaelwing First version of simBio hosted on sourceforge, version 0.3 Revision 1.1 2005/09/12 04:57:24 sarai rearrenge folder structure as a Maven style Revision 1.2 2005/08/04 08:43:04 sarai revise Javadoc to suppress Warnings
2005/02/01 08:51:20 Some comments were updated to make Javadoc.
2004/12/17 05:43:03 update
2004/09/16 10:32:07 Created
作成者:
SAITO Ryuta
関連項目:
Matsuoka et al. (2004) Korzeniewski & Zoladz (2001)
ConcentrationAMP XML example explanation (Japanese, WORD doc)

フィールドの概要
 Node AdenosineTotal
           
 Node ADPtcell
           
 Node ATPtcell
           
 
クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.MassConservation2 から継承されたフィールド
other1, other2, total
 
クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド
value
 
コンストラクタの概要
ConcentrationAMP()
           
 
メソッドの概要
protected  void calculate(double t)
          write equations here, and calculate dy over dt.
 
クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド
accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize
 
クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド
addValue, getValue, getValueString, prepare, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField
 
クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド
addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks
 
クラス java.lang.Object から継承されたメソッド
clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait
 
インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド
addDydt, addValue, getValue, setValue
 

フィールドの詳細

AdenosineTotal

public Node AdenosineTotal

ATPtcell

public Node ATPtcell

ADPtcell

public Node ADPtcell
コンストラクタの詳細

ConcentrationAMP

public ConcentrationAMP()
メソッドの詳細

calculate

protected void calculate(double t)
クラス Reactor の記述:
write equations here, and calculate dy over dt.
計算中に呼び出される。 計算式を記載する。dy/dtをここで計算する。

オーバーライド:
クラス MassConservation2 内の calculate
パラメータ:
t - elapsed time (ms)


???(C) 2002-2007 ?????????????????????