org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function
クラス GradientP

java.lang.Object
  上位を拡張 org.simBio.core.Component
      上位を拡張 org.simBio.core.Parameter
          上位を拡張 org.simBio.core.Composite
              上位を拡張 org.simBio.core.Reactor
                  上位を拡張 org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.GradientP
すべての実装されたインタフェース:
Node

public class GradientP
extends Reactor

proton driving force

  dP = 1/(1 - u) * dpH
 

導入されたバージョン:
rc20
バージョン:
$Log: GradientP.java,v $ Revision 1.1 2005/11/01 06:32:39 mikaelwing First version of simBio hosted on sourceforge, version 0.3 Revision 1.1 2005/09/12 04:57:23 sarai rearrenge folder structure as a Maven style Revision 1.2 2005/08/04 08:43:04 sarai revise Javadoc to suppress Warnings
2005/02/01 08:51:20 Some comments were updated to make Javadoc.
2004/12/17 05:43:03 update
2004/09/16 10:32:07 Created
作成者:
SAITO Ryuta
関連項目:
Matsuoka et al. (2004) Korzeniewski & Zoladz (2001)
GradientP XML example explanation (Japanese, WORD doc)

フィールドの概要
 Node dpH
          proton gradient between cytosol and matrix
 double myu
          u value
 
クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド
value
 
コンストラクタの概要
GradientP()
           
 
メソッドの概要
protected  void calculate(double t)
          write equations here, and calculate dy over dt.
 
クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド
accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize
 
クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド
addValue, getValue, getValueString, prepare, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField
 
クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド
addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks
 
クラス java.lang.Object から継承されたメソッド
clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait
 
インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド
addDydt, addValue, getValue, setValue
 

フィールドの詳細

dpH

public Node dpH
proton gradient between cytosol and matrix


myu

public double myu
u value

コンストラクタの詳細

GradientP

public GradientP()
メソッドの詳細

calculate

protected void calculate(double t)
クラス Reactor の記述:
write equations here, and calculate dy over dt.
計算中に呼び出される。 計算式を記載する。dy/dtをここで計算する。

定義:
クラス Reactor 内の calculate
パラメータ:
t - elapsed time (ms)


???(C) 2002-2007 ?????????????????????