org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function
クラス MassConservation2

java.lang.Object
  org.simBio.core.Component
      org.simBio.core.Parameter
          org.simBio.core.Composite
              org.simBio.core.Reactor
                  org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.MassConservation2

すべての実装されたインタフェース:

Node

直系の既知のサブクラス:

ConcentrationAMP, ConcentrationAMP, ConcentrationPi

public class MassConservation2
extends Reactor

calculation of molecular concentration conformed to mass conservation law

  [A] = [A]total - [A']
 

導入されたバージョン:

rc20

バージョン:

$Log: MassConservation2.java,v $ Revision 1.1 2005/11/01 06:32:39 mikaelwing First version of simBio hosted on sourceforge, version 0.3 Revision 1.1 2005/09/12 04:57:23 sarai rearrenge folder structure as a Maven style Revision 1.2 2005/08/04 08:43:04 sarai revise Javadoc to suppress Warnings
2005/02/01 08:51:20 Some comments were updated to make Javadoc.
2004/12/17 05:43:03 update
2004/09/16 10:32:07 Created

作成者:

SAITO Ryuta

関連項目:

Matsuoka et al. (2004) Korzeniewski & Zoladz (2001)
MassConservation XML example explanation (Japanese, WORD doc)

フィールドの概要

double	other1 other concentration of the same molecular group
double	other2 other concentration of the same molecular group
double	total total concentration

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド

value

コンストラクタの概要

MassConservation2()

メソッドの概要

protected void

calculate(double t) write equations here, and calculate dy over dt.

クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド

accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド

addValue, getValue, getValueString, prepare, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField

クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド

addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks

クラス java.lang.Object から継承されたメソッド

clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド

addDydt, addValue, getValue, setValue

フィールドの詳細

total

public double total

total concentration

other1

public double other1

other concentration of the same molecular group

other2

public double other2

other concentration of the same molecular group

コンストラクタの詳細

MassConservation2

public MassConservation2()

メソッドの詳細

calculate

protected void calculate(double t)

クラス Reactor の記述:

write equations here, and calculate dy over dt.
計算中に呼び出される。 計算式を記載する。dy/dtをここで計算する。

定義:

クラス Reactor 内の calculate

パラメータ:

t - elapsed time (ms)