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概要: 入れ子 | フィールド | コンストラクタ | メソッド | 詳細: フィールド | コンストラクタ | メソッド |
java.lang.Object org.simBio.core.Component org.simBio.core.Parameter org.simBio.core.Composite org.simBio.core.Reactor org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.Transporter.ANT
public class ANT
ADP/ATP carrier, ADP/ATP translocase, SLC25A4.
フィールドの概要 | |
---|---|
Node |
ADPfcell
Mg free ADP concentration in cytosol (mM) |
Node |
ADPfmito
Mg free ADP concentration in mitohocndria (mM) |
Node |
ADPtcell
total ADP concentration in cytosol (mM) |
double |
Amp
amplifying factor described in Kuzumoto et al, 2007. |
Node |
ATPfcell
Mg free ATP concentration in cytosol (mM) |
Node |
ATPfmito
Mg free ATP concentration in mitohocndria (mM) |
Node |
ATPtcell
total ATP concentration in cytosol (mM) |
Node |
ATPtmito
total ATP concentration in mitohocndria (mM) |
Node |
dPsicell
membrane potential at matrix side of mitochondrial inner membrane (mV) |
Node |
dPsimito
membrane potential at matrix side of mitochondrial inner membrane (mV) |
Node |
Hmito
proton concentration in mitohocndria (mM) |
double |
kEX
rate constant of ADP/ATP carrier (mM/msec) |
double |
KmADP
dissociation constant of ADP for ADP/ATP carrier (mM) |
double |
myu
u value (=0.861) |
Node |
rbuffermito
buffering capacity for proton in mitochondrial matrix |
Node |
Rcm
ratio of cytosol volume and mitochondria volume |
double |
Zvalue
Z = 2.303 * R * T / F |
クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド |
---|
value |
コンストラクタの概要 | |
---|---|
ANT()
|
メソッドの概要 | |
---|---|
protected void |
calculate(double t)
write equations here, and calculate dy over dt. |
クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド |
---|
accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize |
クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド |
---|
addValue, getValue, getValueString, prepare, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField |
クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド |
---|
addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks |
クラス java.lang.Object から継承されたメソッド |
---|
clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait |
インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド |
---|
addDydt, addValue, getValue, setValue |
フィールドの詳細 |
---|
public Node dPsimito
public Node dPsicell
public Node ATPtcell
public Node ADPtcell
public Node ATPfcell
public Node ADPfcell
public Node ATPtmito
public Node ATPfmito
public Node ADPfmito
public Node Hmito
public double Zvalue
public Node Rcm
public Node rbuffermito
public double kEX
public double KmADP
public double myu
public double Amp
コンストラクタの詳細 |
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public ANT()
メソッドの詳細 |
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protected void calculate(double t)
Reactor
の記述:
Reactor
内の calculate
t
- elapsed time (ms)
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