org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.exp
クラス Model

java.lang.Object
  org.simBio.core.Component
      org.simBio.core.Parameter
          org.simBio.core.Composite
              org.simBio.core.Reactor
                  org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.exp.Model

すべての実装されたインタフェース:

Node

public class Model
extends Reactor

Cardiac Muscle Model by Negroni and Lascano.

バージョン:

$Log: Model.java,v $ Revision 1.1 2005/11/01 06:32:39 mikaelwing First version of simBio hosted on sourceforge, version 0.3 Revision 1.1 2005/09/12 04:57:21 sarai rearrenge folder structure as a Maven style Revision 1.3 2005/08/04 07:13:45 sarai merge with branch dev_terashima_et_al_2005 Revision 1.2 2005/06/15 02:13:59 sarai revised javadoc
2005/06/06 06:13:17 put a DOI link to the paper
2005/05/12 03:09:24 moved to exp package
2005/02/08 08:44:44 created.

作成者:

Sarai

関連項目:

Negroni JA and Lascano EC, J Mol Cell Cardiol 28: 915-929, 1996. XML example explanation

フィールドの概要

double	A
double	B
double	bias
Node	Ca
Node	Fb
Node	Fp
double	hc
double	K
Node	L
double	L0
double	La
double	R
Node	TCa
Node	TCaCB
Node	TCB
double	Tt
Node	X
double	Y1
double	Y2
double	Y3
double	Y4
double	Yd
double	Z1
double	Z2
double	Z3

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド

value

コンストラクタの概要

Model()

メソッドの概要

protected void

calculate(double t) write equations here, and calculate dy over dt.

クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド

accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド

addValue, getValue, getValueString, prepare, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField

クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド

addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks

クラス java.lang.Object から継承されたメソッド

clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド

addDydt, addValue, getValue, setValue

フィールドの詳細

bias

public double bias

Y1

public double Y1

Z1

public double Z1

Y2

public double Y2

Z2

public double Z2

Y3

public double Y3

Z3

public double Z3

Y4

public double Y4

Yd

public double Yd

Tt

public double Tt

B

public double B

hc

public double hc

La

public double La

L0

public double L0

K

public double K

A

public double A

R

public double R

L

public Node L

Fp

public Node Fp

Fb

public Node Fb

Ca

public Node Ca

TCa

public Node TCa

TCaCB

public Node TCaCB

TCB

public Node TCB

X

public Node X

コンストラクタの詳細

Model

public Model()

メソッドの詳細

calculate

protected void calculate(double t)

クラス Reactor の記述:

write equations here, and calculate dy over dt.
計算中に呼び出される。 計算式を記載する。dy/dtをここで計算する。

定義:

クラス Reactor 内の calculate

パラメータ:

t - elapsed time (ms)