TwoStateModel (simBio API)

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概要: 入れ子 | フィールド | コンストラクタ | メソッド

詳細: フィールド | コンストラクタ | メソッド

org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.kinetics
クラス TwoStateModel

java.lang.Object
  org.simBio.core.Component
      org.simBio.core.Parameter
          org.simBio.core.Composite
              org.simBio.core.Reactor
                  org.simBio.bio.oka_et_al_2006.function.kinetics.TwoStateModel

すべての実装されたインタフェース:: Node

public class TwoStateModel
extends Reactor
extends Reactor

Two-state model. Open + nX <->Closed

バージョン:: $Revision: 1.1 $
作成者:: Chiaki Oka
関連項目:: TwoStateModel.ja.doc (Japanese, WORD doc)

フィールドの概要
`double`	`alpha` forward rate constant
`double`	`beta` backward rate constant
`Node`	`close` closed state probability
`Node`	`ligand` ligand concentration
`double`	`nHill` Hill coefficient
`Node`	`open` open state probability

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド
`value`

コンストラクタの概要
`TwoStateModel()`

メソッドの概要
`protected void`	`calculate(double t)` Calculate the open probability

クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド
`accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize`

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド
`addValue, getValue, getValueString, prepare, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField`

クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド
`addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks`