org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.current.cf
クラス ICaL

java.lang.Object
  org.simBio.core.Component
      org.simBio.core.Parameter
          org.simBio.core.Composite
              org.simBio.core.Reactor
                  org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter
                      org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.CfChannel
                          org.simBio.bio.sarai_et_al_2006.current.cf.ICaL

すべての実装されたインタフェース:

Node

public class ICaL
extends CfChannel

L-type Ca channel with amplitude factor.

バージョン:

$Revision: 1.1 $

作成者:

B.J. Kim, Koabaysi

関連項目:


Sarai et al, 2006 Advance Publication

フィールドの概要

double	amplitude amplitude factor
Node	ATP intracellular ATP concentration (mM)
Node	CaDiadic local Ca2+ concentration near the mouth of L-type Ca channel (mM)
Node	Cai intracellular calcium concentration (mM)
Node	gate ultra-slow gate probability
Node	pAI AI state probability for voltage-dependent gate
Node	pAP AP state probability for voltage-dependent gate
Node	pC C state probability for calcium-dependent gate
double	permeabilityCaMax maximum Ca permeability
Node	pRP PR state probability for voltage-dependent gate
Node	pU U state probability for calcium-dependent gate
Node	pUCa UCa state probability for calcium-dependent gate
Node	sumCa integration of ICaL
Node	Vm membrane potential (mV)
double	Vshift a shift of activation potential for 4 state voltage gate

クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.cf.CfChannel から継承されたフィールド

constantFieldCa, constantFieldK, constantFieldNa, permeabilityCa, permeabilityK, permeabilityNa, pOpen

クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter から継承されたフィールド

cCa, CCa, cK, CK, cNa, CNa, current, currentCa, currentK, currentNa, total

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド

value

コンストラクタの概要

ICaL()

メソッドの概要

protected void	calculate(double t) Compartmentの電流に足し合わせる。
protected void	prepare() construct null current

クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド

accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド

addValue, getValue, getValueString, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField

クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド

addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks

クラス java.lang.Object から継承されたメソッド

clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド

addDydt, addValue, getValue, setValue

フィールドの詳細

amplitude

public double amplitude

amplitude factor

permeabilityCaMax

public double permeabilityCaMax

maximum Ca permeability

Vm

public Node Vm

membrane potential (mV)

Vshift

public double Vshift

a shift of activation potential for 4 state voltage gate

Cai

public Node Cai

intracellular calcium concentration (mM)

ATP

public Node ATP

intracellular ATP concentration (mM)

gate

public Node gate

ultra-slow gate probability

pRP

public Node pRP

PR state probability for voltage-dependent gate

pAP

public Node pAP

AP state probability for voltage-dependent gate

pAI

public Node pAI

AI state probability for voltage-dependent gate

pC

public Node pC

C state probability for calcium-dependent gate

pU

public Node pU

U state probability for calcium-dependent gate

pUCa

public Node pUCa

UCa state probability for calcium-dependent gate

CaDiadic

public Node CaDiadic

local Ca2+ concentration near the mouth of L-type Ca channel (mM)

sumCa

public Node sumCa

integration of ICaL

コンストラクタの詳細

ICaL

public ICaL()

メソッドの詳細

prepare

protected void prepare()

クラス MembraneTransporter の記述:

construct null current

オーバーライド:

クラス MembraneTransporter 内の prepare

関連項目:

Component.prepare()

calculate

protected void calculate(double t)

クラス MembraneTransporter の記述:

Compartmentの電流に足し合わせる。

オーバーライド:

クラス CfChannel 内の calculate

パラメータ:

t - time

関連項目:

Reactor.calculate(double)