NaChannel (simBio API)

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概要: 入れ子 | フィールド | コンストラクタ | メソッド

詳細: フィールド | コンストラクタ | メソッド

org.simBio.bio.sarai_noma_2004.fourState
クラス NaChannel

java.lang.Object
  org.simBio.core.Component
      org.simBio.core.Parameter
          org.simBio.core.Composite
              org.simBio.core.Reactor
                  org.simBio.bio.sarai_noma_2004.fourState.ODE
                      org.simBio.bio.sarai_noma_2004.fourState.MonteCarlo
                          org.simBio.bio.sarai_noma_2004.fourState.NaChannel

すべての実装されたインタフェース:: Node

public class NaChannel
extends MonteCarlo
extends MonteCarlo

4 state gate of fast Sodium channel calculated by Monte Carlo method and ordinary differential Equations. Separated into three classes.

affiliation Department of Pysiology, Kyoto Graduate School of Medicine, Kyoto Japan

バージョン:: $Revision: 1.1 $ Created on 2003/10/28
作成者:: Nobuaki Sarai

フィールドの概要

クラス org.simBio.bio.sarai_noma_2004.fourState.ODE から継承されたフィールド
`pAI, pAP, pRP`

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド
`value`

コンストラクタの概要
`NaChannel()`

メソッドの概要
`protected void`	`calculate(double t)` calculate state probability by ODE.
`protected void`	`prepare()` read initial values from GUI.
`protected void`	`setLinks()` set arias for gates

クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド
`accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize`

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド
`addValue, getValue, getValueString, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField`

クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド
`addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit`

クラス java.lang.Object から継承されたメソッド
`clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait`

インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド
`addDydt, addValue, getValue, setValue`

コンストラクタの詳細

NaChannel

public NaChannel()

メソッドの詳細

setLinks

protected void setLinks()

クラス ODE の記述:

set arias for gates

オーバーライド:: クラス MonteCarlo 内の setLinks

関連項目:: Component.setLinks()

prepare

protected void prepare()

read initial values from GUI.

オーバーライド:: クラス MonteCarlo 内の prepare

関連項目:: Component.prepare()

calculate

protected void calculate(double t)

calculate state probability by ODE.

オーバーライド:: クラス MonteCarlo 内の calculate

パラメータ:: t -

概要