org.simBio.bio.sarai_noma_2004.fourState
クラス ODE

java.lang.Object
  org.simBio.core.Component
      org.simBio.core.Parameter
          org.simBio.core.Composite
              org.simBio.core.Reactor
                  org.simBio.bio.sarai_noma_2004.fourState.ODE

すべての実装されたインタフェース:

Node

直系の既知のサブクラス:

MonteCarlo

public abstract class ODE
extends Reactor

Created on 2003/10/30

バージョン:

$Revision: 1.1 $

作成者:

Nobuaki Sarai

フィールドの概要

protected Node	pAI
protected Node	pAP
protected Node	pRP

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド

value

コンストラクタの概要

ODE()

メソッドの概要

protected void	calculate(double t) calculate state probability by ODE.
protected void	prepare() read initial values from GUI.
protected void	setLinks() set arias for gates

クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド

accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド

addValue, getValue, getValueString, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField

クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド

addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit

クラス java.lang.Object から継承されたメソッド

clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド

addDydt, addValue, getValue, setValue

フィールドの詳細

pAI

protected Node pAI

pAP

protected Node pAP

pRP

protected Node pRP

コンストラクタの詳細

ODE

public ODE()

メソッドの詳細

setLinks

protected void setLinks()

set arias for gates

オーバーライド:

クラス Component 内の setLinks

関連項目:

Component.setLinks()

prepare

protected void prepare()

read initial values from GUI.

オーバーライド:

クラス Parameter 内の prepare

関連項目:

Component.prepare()

calculate

protected void calculate(double t)

calculate state probability by ODE.

定義:

クラス Reactor 内の calculate

パラメータ:

t -