org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current
クラス ICaL

java.lang.Object
  org.simBio.core.Component
      org.simBio.core.Parameter
          org.simBio.core.Composite
              org.simBio.core.Reactor
                  org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter
                      org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.MembraneTransporter
                          org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.CfChannel
                              org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.ICaL

すべての実装されたインタフェース:

Node

public class ICaL
extends CfChannel

L-type Ca channel. voltage gated, 4 state voltage gate, from Shirokov et al. 1993, 4 state Calcium gate, from Shirokov et al. 1993, ultra-slow inactivation, ATP Dependency from Noma& Shibasaki 1985 J.Physiol,363:441-462 The amplitude of this channel can be dynamically changed.

バージョン:

$Id: ICaL.java,v 1.1 2006/11/17 08:08:04 atakeuchi Exp $

作成者:

Ayako Takeuchi.

関連項目:

ICaL

フィールドの概要

Node	ATP intracellular ATP concentration (mM)
Node	CaDiadic local Ca2+ concentration near the mouth of L-type Ca channel (mM)
Node	Cai intracellular Ca2+ concentration (mM)
Node	gate ultra-slow gate probability
double	HillATP Hill constant of ATP dependency.
double	KmATP Michaelis constant of ATP dependency.
Node	pAI AI state probability for voltage-dependent gate
Node	pAP AP state probability for voltage-dependent gate
Node	pC C state probability for Ca2+-dependent gate
double	PKToPCa ratio of K+ to Ca2+ permeability
double	PNaToPCa ratio of Na+ to Ca2+ permeability
Node	pRP PR state probability for voltage-dependent gate
Node	pU U state probability for Ca2+-dependent gate
Node	pUCa UCa state probability for Ca2+-dependent gate
Node	Vm membrane potential (mV)

クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.CfChannel から継承されたフィールド

Cm, constantFieldCa, constantFieldCl, constantFieldK, constantFieldNa, permeabilityCa, permeabilityCl, permeabilityK, permeabilityNa, pOpen

クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.MembraneTransporter から継承されたフィールド

cCl, CCl, currentCl

クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter から継承されたフィールド

cCa, CCa, cK, CK, cNa, CNa, current, currentCa, currentK, currentNa, total

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド

value

コンストラクタの概要

ICaL()

メソッドの概要

protected void

calculate(double t) CompartmentのCl電流に足し合わせる。

クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter から継承されたメソッド

prepare

クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド

accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド

addValue, getValue, getValueString, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField

クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド

addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks

クラス java.lang.Object から継承されたメソッド

clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド

addDydt, addValue, getValue, setValue

フィールドの詳細

Vm

public Node Vm

membrane potential (mV)

pRP

public Node pRP

PR state probability for voltage-dependent gate

pAP

public Node pAP

AP state probability for voltage-dependent gate

pAI

public Node pAI

AI state probability for voltage-dependent gate

CaDiadic

public Node CaDiadic

local Ca²⁺ concentration near the mouth of L-type Ca channel (mM)

Cai

public Node Cai

intracellular Ca²⁺ concentration (mM)

pC

public Node pC

C state probability for Ca²⁺-dependent gate

pU

public Node pU

U state probability for Ca²⁺-dependent gate

pUCa

public Node pUCa

UCa state probability for Ca²⁺-dependent gate

gate

public Node gate

ultra-slow gate probability

ATP

public Node ATP

intracellular ATP concentration (mM)

KmATP

public double KmATP

Michaelis constant of ATP dependency.

HillATP

public double HillATP

Hill constant of ATP dependency.

PNaToPCa

public double PNaToPCa

ratio of Na⁺ to Ca²⁺ permeability

PKToPCa

public double PKToPCa

ratio of K⁺ to Ca²⁺ permeability

コンストラクタの詳細

ICaL

public ICaL()

メソッドの詳細

calculate

protected void calculate(double t)

クラス MembraneTransporter の記述:

CompartmentのCl電流に足し合わせる。

オーバーライド:

クラス CfChannel 内の calculate

パラメータ:

t - time