IRyR (simBio API)

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概要: 入れ子 | フィールド | コンストラクタ | メソッド

詳細: フィールド | コンストラクタ | メソッド

org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current
クラス IRyR

java.lang.Object
  org.simBio.core.Component
      org.simBio.core.Parameter
          org.simBio.core.Composite
              org.simBio.core.Reactor
                  org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter
                      org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.current.IRyR

すべての実装されたインタフェース:: Node

public class IRyR
extends MembraneTransporter
extends MembraneTransporter

Calcium releasing channel on SR. k1 depends on iCaL only, which is different from the model of Matsuoka et al, 2003.

バージョン:: $Id: IRyR.java,v 1.1 2006/11/17 08:08:04 atakeuchi Exp $
作成者:: Ayako Takeuchi
関連項目:: "Table S11 in Takeuchi et al, 2006"

フィールドの概要
`Node`	`CaDiadic` local Ca2+ concentration near the mouth of RyR channel
`Node`	`Cai` intracellular calcium concentration (mM)
`Node`	`Carel` calcium concentration in SR rel (mM)
`Node`	`close` close state probability
`double`	`Cm` membrane capacitance (pF)
`double`	`diadicFactor` Ca diadicFactor
`Node`	`open` open state probability
`double`	`permeabilityCa` membrane permeability

クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter から継承されたフィールド
`cCa, CCa, cK, CK, cNa, CNa, current, currentCa, currentK, currentNa, total`

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド
`value`

コンストラクタの概要
`IRyR()`

メソッドの概要
`protected void`	`calculate(double t)` Compartmentの電流に足し合わせる。
`protected void`	`prepare()` construct null current

クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド
`accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize`

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド
`addValue, getValue, getValueString, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField`

クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド
`addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks`