org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current
クラス Diffusion

java.lang.Object
  org.simBio.core.Component
      org.simBio.core.Parameter
          org.simBio.core.Composite
              org.simBio.core.Reactor
                  org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter
                      org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.MembraneTransporter
                          org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.Diffusion

すべての実装されたインタフェース:

Node

public class Diffusion
extends MembraneTransporter

Calculate current component of K, Na & Ca ion according to the diffusion.

導入されたバージョン:

rc20

バージョン:

$Revision: 1.1 $

作成者:

Nobuaki Sarai, modified by B.J. KIM

関連項目:

Diffusion

フィールドの概要

Node	Cai concentration of intracellular Ca2+ [mM]
Node	Cao concentration of extracellular Ca2+ [mM]
Node	Cli concentration of intracellular Cl- [mM]
Node	Clo concentration of extracellular Cl- [mM]
double	Cm membrane capacitance [pF]
Node	Ki concentration of intracellular K+ [mM]
Node	Ko concentration of extracellular K+ [mM]
Node	Nai concentration of intracellular Na+ [mM]
Node	Nao concentration of extracellular Na+ [mM]
double	permeabilityCa membrane permeability for Ca2+
double	permeabilityCl membrane permeability for Cl-
double	permeabilityK membrane permeability for K+
double	permeabilityNa membrane permeability for Na+

クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.MembraneTransporter から継承されたフィールド

cCl, CCl, currentCl

クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter から継承されたフィールド

cCa, CCa, cK, CK, cNa, CNa, current, currentCa, currentK, currentNa, total

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド

value

コンストラクタの概要

Diffusion()

メソッドの概要

protected void

calculate(double dt) current = permeability * concentration gradient (in - out)

クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter から継承されたメソッド

prepare

クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド

accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド

addValue, getValue, getValueString, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField

クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド

addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks

クラス java.lang.Object から継承されたメソッド

clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド

addDydt, addValue, getValue, setValue

フィールドの詳細

Nai

public Node Nai

concentration of intracellular Na+ [mM]

Nao

public Node Nao

concentration of extracellular Na+ [mM]

Ki

public Node Ki

concentration of intracellular K+ [mM]

Ko

public Node Ko

concentration of extracellular K+ [mM]

Cai

public Node Cai

concentration of intracellular Ca2+ [mM]

Cao

public Node Cao

concentration of extracellular Ca2+ [mM]

Cli

public Node Cli

concentration of intracellular Cl- [mM]

Clo

public Node Clo

concentration of extracellular Cl- [mM]

permeabilityNa

public double permeabilityNa

membrane permeability for Na+

permeabilityK

public double permeabilityK

membrane permeability for K+

permeabilityCa

public double permeabilityCa

membrane permeability for Ca2+

permeabilityCl

public double permeabilityCl

membrane permeability for Cl-

Cm

public double Cm

membrane capacitance [pF]

コンストラクタの詳細

Diffusion

public Diffusion()

メソッドの詳細

calculate

protected void calculate(double dt)

current = permeability * concentration gradient (in - out)

オーバーライド:

クラス MembraneTransporter 内の calculate

パラメータ:

dt - time