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概要:  入れ子 | フィールド | コンストラクタ | メソッド 詳細:  フィールド | コンストラクタ | メソッド

org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.carrier
クラス NKCC

java.lang.Object
  上位を拡張 org.simBio.core.Component
      上位を拡張 org.simBio.core.Parameter
          上位を拡張 org.simBio.core.Composite
              上位を拡張 org.simBio.core.Reactor
                  上位を拡張 org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter
                      上位を拡張 org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.MembraneTransporter
                          上位を拡張 org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.carrier.NKCC
すべての実装されたインタフェース:
Node
public class NKCC
extends MembraneTransporter

Flux via Na+-K+-2Cl- cotransporter [amol/msec]. x1 for Na+ and K+, x2 for Cl-.

バージョン:
$Id: NKCC.java,v 1.2 2007/10/18 07:03:03 nsarai Exp $
作成者:
Keisuke Terashima
関連項目:
NKCC.ja.doc (Japanese, WORD doc) NKCC.xml Lytle et al, 1998 Ramasamy et al, 2001 Benjamin and Johnson, 1997

フィールドの概要
 Node ClFlux
          Cl- current carried by NKCC1 [pA]
 Node Cli
          concentration of intracellular Cl- [mM]
 Node Clo
          concentration of extracellular Cl- [mM]
 double F
          Faraday constant. default value is 96.4867 [C/mmol]
 double kbEmpty
          rate constant for the reaction pE1->pE2 [msec-1]
 double kbFull
          rate constant for the reaction pE2NaClKCl->pE1NaClKCl [msec-1]
 double KCl
          binding constant for Cl- [mM-1]
 double kfEmpty
          rate constant for the reaction pE2->pE1 [msec-1]
 double kfFull
          rate constant for the reaction pE1NaClKCl->pE2NaClKCl [msec-1]
 Node Ki
          concentration of intracellular K+ [mM]
 double KK
          binding constant for K+ [mM-1]
 double KNa
          binding constant for Na+ [mM-1]
 Node Ko
          concentration of extracellular K+ [mM]
 Node Nai
          concentration of intracellular Na+ [mM]
 Node Nao
          concentration of extracellular Na+ [mM]
 Node P
          factor to define the maximum flux via NKCC1 [amol]
 Node pE1S
          probability of pE1S
 
クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.MembraneTransporter から継承されたフィールド
cCl, CCl, currentCl
 
クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter から継承されたフィールド
cCa, CCa, cK, CK, cNa, CNa, current, currentCa, currentK, currentNa, total
 
クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド
value
 
コンストラクタの概要
NKCC()
           
 
メソッドの概要
protected  void calculate(double t)
           CompartmentのCl電流に足し合わせる。
 
クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter から継承されたメソッド
prepare
 
クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド
accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize
 
クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド
addValue, getValue, getValueString, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField
 
クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド
addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks
 
クラス java.lang.Object から継承されたメソッド
clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait
 
インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド
addDydt, addValue, getValue, setValue
 

フィールドの詳細

Nai

public Node Nai
concentration of intracellular Na+ [mM]

Ki

public Node Ki
concentration of intracellular K+ [mM]

Cli

public Node Cli
concentration of intracellular Cl- [mM]

Nao

public Node Nao
concentration of extracellular Na+ [mM]

Ko

public Node Ko
concentration of extracellular K+ [mM]

Clo

public Node Clo
concentration of extracellular Cl- [mM]

KNa

public double KNa
binding constant for Na+ [mM-1]

KCl

public double KCl
binding constant for Cl- [mM-1]

KK

public double KK
binding constant for K+ [mM-1]

kfFull

public double kfFull
rate constant for the reaction pE1NaClKCl->pE2NaClKCl [msec-1]

kbFull

public double kbFull
rate constant for the reaction pE2NaClKCl->pE1NaClKCl [msec-1]

kfEmpty

public double kfEmpty
rate constant for the reaction pE2->pE1 [msec-1]

kbEmpty

public double kbEmpty
rate constant for the reaction pE1->pE2 [msec-1]

pE1S

public Node pE1S
probability of pE1S

P

public Node P
factor to define the maximum flux via NKCC1 [amol]

F

public double F
Faraday constant. default value is 96.4867 [C/mmol]

ClFlux

public Node ClFlux
Cl- current carried by NKCC1 [pA]

コンストラクタの詳細

NKCC

public NKCC()
メソッドの詳細

calculate

protected void calculate(double t)
クラス MembraneTransporter の記述:
CompartmentのCl電流に足し合わせる。

オーバーライド:
クラス MembraneTransporter 内の calculate
パラメータ:
t - time
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???(C) 2002-2007 ?????????????????????