org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function
クラス AmplitudeNaK

java.lang.Object
  org.simBio.core.Component
      org.simBio.core.Parameter
          org.simBio.core.Composite
              org.simBio.core.Reactor
                  org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.AmplitudeNaK

すべての実装されたインタフェース:

Node

public class AmplitudeNaK
extends Reactor

Calculate volume-dependency of INaK amplitude.

バージョン:

$Log: AmplitudeNaK.java,v $ Revision 1.1 2005/11/01 06:32:40 mikaelwing First version of simBio hosted on sourceforge, version 0.3 Revision 1.1 2005/10/17 07:53:05 mikael Moved from branch dev_terashima_et_al_2005 Revision 1.1.2.6 2005/07/01 11:55:43 sarai revised Javadoc
Revision 1.1.2.4 2005/07/01 01:19:50 sarai put links
2005/06/30 11:33:56 takeuchi Vt instead of Vi is used
2005/06/17 01:48:46 takeuchi The javadoc comments are revised.
2005/2/5 Takeuchi change permeability from double to Node, it can work in both Type

作成者:

Ayako Takeuchi

関連項目:

AmplitudeNaK.ja.doc (Japanese, WORD doc) AmplitudeNaK.xml Sasaki et al, 1994 Sasaki et al, 1999

フィールドの概要

double	amplitudeNaK factor to define the maximum INaK [pA msec/pF]
double	halfMaxVt cell volume at which the change in INaK is half of its maximum value [um^3]
double	maxFactor factor to define maximum INaK activation by swelling
double	slope slope [um^3]
Node	Vt total cell volume [um^3]

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド

value

コンストラクタの概要

AmplitudeNaK()

メソッドの概要

protected void

calculate(double t) write equations here, and calculate dy over dt.

クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド

accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド

addValue, getValue, getValueString, prepare, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField

クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド

addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks

クラス java.lang.Object から継承されたメソッド

clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド

addDydt, addValue, getValue, setValue

フィールドの詳細

amplitudeNaK

public double amplitudeNaK

factor to define the maximum INaK [pA msec/pF]

maxFactor

public double maxFactor

factor to define maximum INaK activation by swelling

slope

public double slope

slope [um^3]

halfMaxVt

public double halfMaxVt

cell volume at which the change in INaK is half of its maximum value [um^3]

Vt

public Node Vt

total cell volume [um^3]

コンストラクタの詳細

AmplitudeNaK

public AmplitudeNaK()

メソッドの詳細

calculate

protected void calculate(double t)

クラス Reactor の記述:

write equations here, and calculate dy over dt.
計算中に呼び出される。 計算式を記載する。dy/dtをここで計算する。

定義:

クラス Reactor 内の calculate

パラメータ:

t - elapsed time (ms)