org.simBio.core
クラス VariableList

java.lang.Object
  java.util.AbstractCollection
      java.util.AbstractList
          java.util.ArrayList
              org.simBio.core.VariableList

すべての実装されたインタフェース:

java.io.Serializable, java.lang.Cloneable, java.lang.Iterable, java.util.Collection, java.util.List, java.util.RandomAccess

直系の既知のサブクラス:

EulerList, RungeKuttaList

public abstract class VariableList
extends java.util.ArrayList

include euler engine & dt adjuster

バージョン:

$Id: VariableList.java,v 1.3 2007/02/02 04:53:32 nsarai Exp $

作成者:

Nobuaki Sarai

関連項目:

直列化された形式

フィールドの概要

protected double	minDt minimum dt
protected ReactorList	reactors list of reactors

クラス java.util.AbstractList から継承されたフィールド

modCount

コンストラクタの概要

VariableList()

メソッドの概要

protected double	adjustDt() restrict maximum dy/Y and adjust time step 全てのVariableの最大のdy/yが閾値に合うように、time stepを決定する。
void	logIndented() log all Euler's indented name 全てのVariableの名前をログに書き出す。
void	prepare(double min, double max, double dyY, double duration) call all Euler's start() dt controlの閾値を設定し、全てのVariableのstart()を呼び出す。
void	setLinks(ReactorList reactors) set reactor list for calculate dydt
abstract double	update(double t) solve ordinary differential equations

クラス java.util.ArrayList から継承されたメソッド

add, add, addAll, addAll, clear, clone, contains, ensureCapacity, get, indexOf, isEmpty, lastIndexOf, remove, remove, removeRange, set, size, toArray, toArray, trimToSize

クラス java.util.AbstractList から継承されたメソッド

equals, hashCode, iterator, listIterator, listIterator, subList

クラス java.util.AbstractCollection から継承されたメソッド

containsAll, removeAll, retainAll, toString

クラス java.lang.Object から継承されたメソッド

finalize, getClass, notify, notifyAll, wait, wait, wait

インタフェース java.util.List から継承されたメソッド

containsAll, equals, hashCode, iterator, listIterator, listIterator, removeAll, retainAll, subList

フィールドの詳細

minDt

protected double minDt

minimum dt

reactors

protected ReactorList reactors

list of reactors

コンストラクタの詳細

VariableList

public VariableList()

メソッドの詳細

update

public abstract double update(double t)

solve ordinary differential equations

パラメータ:

t - elapsed time

戻り値:

time step

setLinks

public void setLinks(ReactorList reactors)

set reactor list for calculate dydt

パラメータ:

reactors -

prepare

public void prepare(double min,
                    double max,
                    double dyY,
                    double duration)

call all Euler's start()
dt controlの閾値を設定し、全てのVariableのstart()を呼び出す。

パラメータ:

min - minimum time step

max - maximum time step

dyY - restrict maximum dy/Y and adjust time step

duration - to calculate

adjustDt

protected double adjustDt()

restrict maximum dy/Y and adjust time step
全てのVariableの最大のdy/yが閾値に合うように、time stepを決定する。 2004/11/12 dtが残り計算時間をオーバーしないように制限。 TODO 時々dt=0となってしまうことがある。

戻り値:

time step

logIndented

public void logIndented()

log all Euler's indented name
全てのVariableの名前をログに書き出す。