org.simBio.core.integrator
クラス Concentration

java.lang.Object
  org.simBio.core.Component
      org.simBio.core.Parameter
          org.simBio.core.integrator.Euler
              org.simBio.core.integrator.Positive
                  org.simBio.core.integrator.Concentration

すべての実装されたインタフェース:

Node, Variable

public class Concentration
extends Positive

The amount of ion (or molecule) is hold as value. The concentration (=amount/volume) is used as interface to other instance. The "volume" should be defined in advance in the XML.

バージョン:

$Log: Concentration.java,v $ Revision 1.1 2005/11/01 06:32:39 mikaelwing First version of simBio hosted on sourceforge, version 0.3 Revision 1.1 2005/09/12 04:57:29 sarai rearrenge folder structure as a Maven style Revision 1.4 2005/08/04 07:55:41 sarai revise Javadoc
Revision 1.3 2005/08/04 07:47:19 sarai merge with branch dev_terashima_et_al_2005
Revision 1.1.2.1 2005/06/15 05:33:38 sarai refactored Concentration to org.simBio.core.integrator

作成者:

Chiaki Oka

フィールドの概要

クラス org.simBio.core.integrator.Euler から継承されたフィールド

dydt

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド

value

インタフェース org.simBio.core.Variable から継承されたフィールド

TINY

コンストラクタの概要

Concentration()

メソッドの概要

void	addDydt(double d) always throws UnsupportedOperationException, need to implement 'Node'
void	addValue(double value) log warn, this Method should not be used.
double	getDydt() return dy/dt dy/dtの値を返す。
double	getValue() always throws UnsupportedOperationException, need to implement 'Node'
java.lang.String	getValueString() 文字列として現在値を返す。
void	setInitializer(Initializer initializer) set initial amount.
void	setValue(double newValue) log warn, this Method should not be used.
void	setValueString(java.lang.String label) 文字列を受け取り現在値に設定する。

クラス org.simBio.core.integrator.Positive から継承されたメソッド

update

クラス org.simBio.core.integrator.Euler から継承されたメソッド

getDydtOverY

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド

prepare, setValueToField

クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド

accept, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks

クラス java.lang.Object から継承されたメソッド

clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

コンストラクタの詳細

Concentration

public Concentration()

メソッドの詳細

addDydt

public void addDydt(double d)

クラス Component の記述:

always throws UnsupportedOperationException, need to implement 'Node'

定義:

インタフェース Node 内の addDydt

オーバーライド:

クラス Euler 内の addDydt

パラメータ:

d - dy/dt

関連項目:

Euler.addDydt(double)

getDydt

public double getDydt()

インタフェース Variable の記述:

return dy/dt
dy/dtの値を返す。

定義:

インタフェース Variable 内の getDydt

オーバーライド:

クラス Euler 内の getDydt

戻り値:

dy/dt

関連項目:

Euler.getDydt()

addValue

public void addValue(double value)

クラス Euler の記述:

log warn, this Method should not be used.

定義:

インタフェース Node 内の addValue

オーバーライド:

クラス Euler 内の addValue

関連項目:

Node.addValue(double)

getValue

public double getValue()

クラス Component の記述:

always throws UnsupportedOperationException, need to implement 'Node'

定義:

インタフェース Node 内の getValue

オーバーライド:

クラス Parameter 内の getValue

戻り値:

value

関連項目:

Node.getValue()

getValueString

public java.lang.String getValueString()

クラス Component の記述:

文字列として現在値を返す。

オーバーライド:

クラス Parameter 内の getValueString

戻り値:

value as String

関連項目:

Parameter.getValueString()

setInitializer

public void setInitializer(Initializer initializer)

set initial amount.

オーバーライド:

クラス Parameter 内の setInitializer

関連項目:

Parameter.setInitializer(org.simBio.core.Initializer)

setValue

public void setValue(double newValue)

クラス Euler の記述:

log warn, this Method should not be used.

定義:

インタフェース Node 内の setValue

オーバーライド:

クラス Euler 内の setValue

関連項目:

Node.setValue(double)

setValueString

public void setValueString(java.lang.String label)

クラス Component の記述:

文字列を受け取り現在値に設定する。 updateObserverに通知する。

オーバーライド:

クラス Parameter 内の setValueString

パラメータ:

label - value as String

関連項目:

Parameter.setValueString(java.lang.String)