org.simBio.sim.analyzer.graph
クラス BasicGraph

java.lang.Object
  org.simBio.core.Component
      org.simBio.core.Parameter
          org.simBio.core.Composite
              org.simBio.core.Analyzer
                  org.simBio.sim.analyzer.VisualizeAnalyzer
                      org.simBio.sim.analyzer.graph.AbstractGraph
                          org.simBio.sim.analyzer.graph.BasicGraph

すべての実装されたインタフェース:

Node

直系の既知のサブクラス:

Graph, RelationGraph

public abstract class BasicGraph
extends AbstractGraph

時系列データを表示するGraph.

Notice

1. 再描画に対応しています。
2. 再描画処理について、画面向きの最適化を行っていません。
3. 一般的なGraph系のベースに使えるようになっています。

バージョン:

$Id: BasicGraph.java,v 1.3 2007/04/07 08:44:07 nsarai Exp $

作成者:

misaki

フィールドの概要

protected java.awt.Container	container Graphが属するViewerのcontainer
protected java.awt.Graphics2D	graphics2d analyze() 時に描画するためのGraphics2D
protected TimeSeriesValues	values 時系列データの保管場所

クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.AbstractGraph から継承されたフィールド

axisX, axisY, interval, log, maxTime, nextTime, nTarget, nTargetOrigin, page, plotDisplay, plotPrinter, target, targetName, targetScale, targetShortName, thisGraph, valuesBuffer

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド

value

コンストラクタの概要

BasicGraph()

メソッドの概要

protected void	analyzeSub(double t, double[] valuesBuffer, IPlot plot) Plot targets.
double	getTimeMax() Get maximum time
double	getTimeMin() Get minimum time
TimeSeriesSingle	getTimeSeries(java.lang.Object node) 指定したNodeについての時系列クラスを取得する。
protected void	paintGraph(java.awt.Graphics2D graphics2d, IPlot plot) Draw graph.
protected void	paintGraphSub(java.awt.Graphics2D graphics2d, IPlot plot) グラフ描画を行う。
protected void	prepare() Set link to the targets.
protected void	printGraph(java.awt.Graphics2D graphics2d, IPlot plot) Draw graph.
protected void	quit() called before destruction, instanceを破棄する前に呼び出されます。
void	resetBuffer() 画面状態をリセットする.
protected void	resize(IPlot plot) 現在の親ウィンドウの大きさに応じて、Graphサイズを再計算する.
protected void	setLinks() Link to the Viewer, AxisX, AxisY and count number of the target, get array.

クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.AbstractGraph から継承されたメソッド

analyze, changeScale, doRepaint, drawLine, drawPoint, paintAxises, paintBackground, paintComponent, paintLegend, prepareRepaint, printAxises, printBackground, printComponent, printLegend, setAreaChanged

クラス org.simBio.sim.analyzer.VisualizeAnalyzer から継承されたメソッド

getColorParameter, getDouble, getFontParameter, getNodeHierarchically, getNodeRecursive, repaint

クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド

accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド

addValue, getValue, getValueString, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField

クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド

addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented

クラス java.lang.Object から継承されたメソッド

clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド

addDydt, addValue, getValue, setValue

フィールドの詳細

values

protected TimeSeriesValues values

時系列データの保管場所

graphics2d

protected java.awt.Graphics2D graphics2d

analyze() 時に描画するためのGraphics2D

container

protected java.awt.Container container

Graphが属するViewerのcontainer

コンストラクタの詳細

BasicGraph

public BasicGraph()

メソッドの詳細

resetBuffer

public void resetBuffer()

クラス VisualizeAnalyzer の記述:

画面状態をリセットする. 新しいmodelをロードしたり(setLinks())、 時刻を変更した後に計算処理を行ったり(org.simBio.sim.gui.GUI#getJMenuModel()) した際に、呼び出され、描画再描画用のバッファなど、各Nodeで持っている内部状態を リセットします。
下位のnodeを持つ場合については、明示的に呼び出してやるように、super() を 呼ぶようにしてください。

オーバーライド:

クラス VisualizeAnalyzer 内の resetBuffer

quit

protected void quit()

クラス Component の記述:

called before destruction,
instanceを破棄する前に呼び出されます。

オーバーライド:

クラス Component 内の quit

setLinks

protected void setLinks()

クラス AbstractGraph の記述:

Link to the Viewer, AxisX, AxisY and count number of the target, get array.

オーバーライド:

クラス AbstractGraph 内の setLinks

関連項目:

Component.setLinks()

prepare

protected void prepare()

クラス AbstractGraph の記述:

Set link to the targets.

オーバーライド:

クラス AbstractGraph 内の prepare

関連項目:

Component.prepare()

analyzeSub

protected void analyzeSub(double t,
                          double[] valuesBuffer,
                          IPlot plot)

Plot targets.

定義:

クラス AbstractGraph 内の analyzeSub

パラメータ:

t - 時刻

valuesBuffer - 計算結果の配列

plot - 描画処理オブジェクト

関連項目:

AbstractGraph.analyzeSub(double, double[], IPlot)

resize

protected void resize(IPlot plot)

クラス AbstractGraph の記述:

現在の親ウィンドウの大きさに応じて、Graphサイズを再計算する.

オーバーライド:

クラス AbstractGraph 内の resize

パラメータ:

plot - 描画処理オブジェクト

paintGraph

protected void paintGraph(java.awt.Graphics2D graphics2d,
                          IPlot plot)

クラス AbstractGraph の記述:

Draw graph.

定義:

クラス AbstractGraph 内の paintGraph

パラメータ:

graphics2d - 描画されるGraphics

plot - 描画処理オブジェクト

printGraph

protected void printGraph(java.awt.Graphics2D graphics2d,
                          IPlot plot)

クラス AbstractGraph の記述:

Draw graph. Called by JPanel#printComponent() on Event thread.

オーバーライド:

クラス AbstractGraph 内の printGraph

パラメータ:

graphics2d - 描画されるGraphics

plot - 描画処理オブジェクト

paintGraphSub

protected void paintGraphSub(java.awt.Graphics2D graphics2d,
                             IPlot plot)

グラフ描画を行う。 各時刻での値を、忠実にプロットする。

パラメータ:

graphics2d - 描画対象のGraphics

plot - 描画処理オブジェクト

getTimeMax

public double getTimeMax()

Get maximum time

戻り値:

maximum time

getTimeMin

public double getTimeMin()

Get minimum time

戻り値:

minimum time

getTimeSeries

public TimeSeriesSingle getTimeSeries(java.lang.Object node)

指定したNodeについての時系列クラスを取得する。

パラメータ:

node - 取得したいNode

戻り値:

時系列クラスのインスタンス