直列化された形式

パッケージ org.simBio.core

Class org.simBio.core.ReactorList extends java.util.ArrayList implements Serializable

直列化されたフィールド

rbcs

java.util.List rbcs

IResetBeforeCalcをimplimentsしているクラスのList

Class org.simBio.core.VariableList extends java.util.ArrayList implements Serializable

直列化されたフィールド

minDt

double minDt

minimum dt

maxDt

double maxDt

maxRthreshold

double maxRthreshold

minRthreshold

double minRthreshold

adjustDyY

double adjustDyY

ratio

double ratio

maxR

double maxR

reactors

ReactorList reactors

list of reactors

lest

double lest

パッケージ org.simBio.core.integrator

Class org.simBio.core.integrator.EulerList extends VariableList implements Serializable

Class org.simBio.core.integrator.RungeKuttaList extends VariableList implements Serializable

直列化されたフィールド

Eps

double Eps

ERRCON

double ERRCON

PGROW

double PGROW

PSHRNK

double PSHRNK

SAFETY

double SAFETY

dtNext

double dtNext

パッケージ org.simBio.sim.analyzer.graph

Class org.simBio.sim.analyzer.graph.OnScreen extends javax.swing.JFrame implements Serializable

直列化されたフィールド

target

IViewer target

パッケージ org.simBio.sim.gui

Class org.simBio.sim.gui.CheckedJTree extends javax.swing.JTree implements Serializable

Class org.simBio.sim.gui.CheckedJTree.CheckedJTreeCellRenderer extends javax.swing.JPanel implements Serializable

直列化されたフィールド

jCheckBox

javax.swing.JCheckBox jCheckBox

defaultTreeCellRenderer

javax.swing.tree.DefaultTreeCellRenderer defaultTreeCellRenderer

Class org.simBio.sim.gui.GUI extends javax.swing.JFrame implements Serializable

直列化されたフィールド

page

IViewer page

modelBufferClear

boolean modelBufferClear

計算開始時に、Viewer の再計算バッファをクリアするためのフラグ

model

Conductor model

thread

java.lang.Thread thread

viewers

java.util.List viewers

defaultDirectory

java.io.File defaultDirectory

設定ファイルを保持しておく基準ディレクトリ

statusProcessor

org.simBio.sim.gui.GUI.GUITargetFile statusProcessor

画面状態および、ファイルの管理・実施

hs

javax.help.HelpSet hs

JavaHelp用

hb

javax.help.HelpBroker hb

JavaHelp用

globalProperty

java.util.Properties globalProperty

画面全体のプロパティ

updateCounter

int updateCounter

変更チェック用

jThisFrame

javax.swing.JFrame jThisFrame

メインＵＩの生成

jContentPane

javax.swing.JPanel jContentPane

jSplitPane

javax.swing.JSplitPane jSplitPane

jScrollPane

javax.swing.JScrollPane jScrollPane

jTreeTable

JTreeTableSimBio jTreeTable

jPanel

javax.swing.JPanel jPanel

jToolBarMente

ToolBarMente jToolBarMente

jFileChooser

javax.swing.JFileChooser jFileChooser

jOptionPane

javax.swing.JOptionPane jOptionPane

jJMenuBar

javax.swing.JMenuBar jJMenuBar

jMenuFile

javax.swing.JMenu jMenuFile

jMenuModel

javax.swing.JMenu jMenuModel

jMenuTool

javax.swing.JMenu jMenuTool

jMenuHelp

javax.swing.JMenu jMenuHelp

jToolBar

DnDJToolBar jToolBar

dndActionOpen

DnDAction dndActionOpen

dndActionReload

DnDAction dndActionReload

dndActionSaveAs

DnDAction dndActionSaveAs

dndActionSave

DnDAction dndActionSave

dndActionClose

DnDAction dndActionClose

dndActionPrint

DnDAction dndActionPrint

dndActionExpCsv

DnDAction dndActionExpCsv

dndActionExit

DnDAction dndActionExit

dndActionStart

DnDAction dndActionStart

dndActionStop

DnDAction dndActionStop

dndActionTreeExpand

DnDAction dndActionTreeExpand

dndActionTreeCollapse

DnDAction dndActionTreeCollapse

dataModel

org.simBio.sim.gui.DataListTableModel dataModel

data

DataListTable data

Class org.simBio.sim.gui.GUI.JPrintablePanel extends javax.swing.JPanel implements Serializable

直列化されたフィールド

rectPrintableArea

java.awt.Rectangle rectPrintableArea

Class org.simBio.sim.gui.JTreeTableSimBio extends sun.JTreeTable.JTreeTable implements Serializable

直列化されたフィールド

eventX

int eventX

eventY

int eventY

myPopupMenu

javax.swing.JPopupMenu myPopupMenu

decTooltipFormat

java.text.DecimalFormat decTooltipFormat

パッケージ org.simBio.sim.gui.toolKit

Class org.simBio.sim.gui.toolKit.HTMLViewJDialog extends javax.swing.JDialog implements Serializable

直列化されたフィールド

jThisDialog

HTMLViewJDialog jThisDialog

jEditorPane

javax.swing.JEditorPane jEditorPane

jButton

javax.swing.JButton jButton

jPanelButton

javax.swing.JPanel jPanelButton

jContentPane

javax.swing.JPanel jContentPane

パッケージ org.simBio.sim.gui.toolKit.dndmenu

Class org.simBio.sim.gui.toolKit.dndmenu.DnDAction extends javax.swing.AbstractAction implements Serializable

Class org.simBio.sim.gui.toolKit.dndmenu.DnDJButton extends javax.swing.JButton implements Serializable

直列化されたフィールド

thisButton

DnDJButton thisButton

myPopupMenu

javax.swing.JPopupMenu myPopupMenu

Class org.simBio.sim.gui.toolKit.dndmenu.DnDJList extends javax.swing.JList implements Serializable

Class org.simBio.sim.gui.toolKit.dndmenu.DnDJToolBar extends javax.swing.JToolBar implements Serializable

直列化されたフィールド

thisToolBar

DnDJToolBar thisToolBar

defaultDim

java.awt.Dimension defaultDim

Class org.simBio.sim.gui.toolKit.dndmenu.DnDTransferHandler extends javax.swing.TransferHandler implements Serializable

直列化されたフィールド

myComponent

javax.swing.JComponent myComponent

electedFlavor

java.awt.datatransfer.DataFlavor electedFlavor

canImport() で選定されたFlavor

Class org.simBio.sim.gui.toolKit.dndmenu.ToolBarMente extends javax.swing.JDialog implements Serializable

直列化されたフィールド

jContentPane

javax.swing.JPanel jContentPane

jList

javax.swing.JList jList

jScrollPane

javax.swing.JScrollPane jScrollPane

jList2

javax.swing.JList jList2

jScrollPane2

javax.swing.JScrollPane jScrollPane2

menuList

javax.swing.DefaultListModel menuList

menuItemList

java.util.ArrayList menuItemList

パッケージ org.simBio.sim.ps.view

Class org.simBio.sim.ps.view.AbstractPlot extends org.jfree.ui.ApplicationFrame implements Serializable

Class org.simBio.sim.ps.view.PlotContour extends AbstractPlot implements Serializable

serialVersionUID: 1L

直列化されたフィールド

plots

org.jfree.chart.plot.ContourPlot[] plots

indexX

int indexX

key index of the X axis

indexY

int indexY

key index of the Y axis

collection

ICollection collection

database

oDoubleX

java.util.List[] oDoubleX

oDoubleY

java.util.List[] oDoubleY

oDoubleZ

java.util.List[] oDoubleZ

Class org.simBio.sim.ps.view.PlotLine extends AbstractPlot implements Serializable

serialVersionUID: 1L

直列化されたフィールド

collection

ICollection collection

database

seriesCollections

org.jfree.data.xy.XYSeriesCollection[] seriesCollections

表示するx, y データセット

indexKey

int indexKey

indexEval

int indexEval

legendItems

org.jfree.chart.LegendItemCollection[] legendItems

Class org.simBio.sim.ps.view.PlotTimeSeries extends AbstractPlot implements Serializable

serialVersionUID: 1L

直列化されたフィールド

collection

ICollection collection

database

seriesCollections

org.jfree.data.xy.XYSeriesCollection[] seriesCollections

表示するx, y データセット

isPlotLastOnly

boolean isPlotLastOnly