org.simBio.bio.function
Class Analytic2state
java.lang.Object
org.simBio.core.Component
org.simBio.core.Parameter
org.simBio.core.Composite
org.simBio.core.Reactor
org.simBio.bio.function.Function
org.simBio.bio.function.Analytic2state
- All Implemented Interfaces:
- Node
public class Analytic2state
- extends Function
2 state gateの解析解を求めて現在の解に設定する。
「心臓のフィジオーム」p. 101-104参照。
時定数tauや収束値infinityがdtの間一定と見なせ、かつgateの変化がここだけで計算される場合に成り立つ。
ten Tusscher et al, 2004が公開しているソースでも用いられている方法。
dtを大きく取っても発散しないと思われる。
アドレスはhttp://www-binf.bio.uu.nl/khwjtuss/HVM
恐らくReference No 54の
Rush and Larsen, IEEE Trans Biomed Eng 25:389-392, 1978
が詳しいと思われる。
xml/km/0005-2.xmlを参考にしてください。
- Version:
- $Revision: 1.1 $
- Author:
- Nobuaki Sarai
Created on 2004/05/25
Method Summary |
protected void |
calculate(double t)
write equations here, and calculate dy over dt. |
Methods inherited from class org.simBio.core.Component |
addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks |
Methods inherited from class java.lang.Object |
clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait |
alfa
public Node alfa
beta
public Node beta
previous
public Node previous
dt
public Node dt
Analytic2state
public Analytic2state()
calculate
protected void calculate(double t)
- Description copied from class:
Reactor
- write equations here, and calculate dy over dt.
計算中に呼び出される。
計算式を記載する。dy/dtをここで計算する。
- Specified by:
calculate
in class Reactor
- Parameters:
t
- elapsed time (ms)
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