simBioプラグイン

simBioのEclipseプラグインの機能を説明します。

GUIでシミュレーションを実行する

1つ以上のsimBio用モデルXMLを選択・右クリックし、［simBio］→［Run on GUI］をクリックすると、GUI※でシミュレーションを実行します。

GUI

Graphical User Interfaceの略。情報の表示にグラフィックを多用し、基礎的な操作をマウスなどによって行なうことができるユーザインターフェースのこと。

一度実行すると起動構成を保存しますので、2回目からはクールバーから実行できます。

もしくはメニューの［実行］から前回の構成で起動できます。

プロトコルXMLを選択・右クリックし、［simBio］→［Run Protocol］をクリックすると、ResultGeneratorで実行します。

Composer用モデル構築XMLを選択・右クリックし、［simBio］→［Compose and Run］をクリックすると、モデルXMLを構築し、GUIで実行します。実行後はcomposed.xmlファイルが作成されていますので、フォルダーを更新してください。

一つ以上のReactorもしくはAnalyzerを選択・右クリックし、 [simBio］→［generate XML］をクリックすると、XMLファイルを生成します。