org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.buffer
クラス HBuffering

java.lang.Object
  org.simBio.core.Component
      org.simBio.core.Parameter
          org.simBio.core.Composite
              org.simBio.core.Reactor
                  org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.buffer.HBuffering

すべての実装されたインタフェース:

Node

public class HBuffering
extends Reactor

Buffering capacity coefficient for H⁺ (r_buffer).

  rbuffer = cbuffer / c0
 where;
  c0 = (10^(- pH) - 10^(- pH - dpH)) / dpH
  dpH = 0.001
 

導入されたバージョン:

rc20

バージョン:

$Id: HBuffering.java,v 1.5 2006/05/30 07:16:39 nsarai Exp $

作成者:

SAITO Ryuta

関連項目:

Korzeniewski B & Zoladz JA, Biophys. Chem., 92, 17-34, 2001
Korzeniewski B & Zoladz JA, Jpn. J. Physiol., 53, 271-280, 2003
XML example
explanation (Japanese, WORD doc)

フィールドの概要

double	cbuffer Buffering capacity for H+ (cbuffer). 22.0 (mM Proton / pH) in matrix, 25.0 (mM Proton / pH) in cytosol.
Node	pH a measure of the activity of hydrogen ions (H+) in a solution

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド

value

コンストラクタの概要

HBuffering()

メソッドの概要

protected void

calculate(double t) calculate and set the value of rbuffer.

クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド

accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド

addValue, getValue, getValueString, prepare, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField

クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド

addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks

クラス java.lang.Object から継承されたメソッド

clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド

addDydt, addValue, getValue, setValue

フィールドの詳細

pH

public Node pH

a measure of the activity of hydrogen ions (H⁺) in a solution

cbuffer

public double cbuffer

Buffering capacity for H⁺ (c_buffer). 22.0 (mM Proton / pH) in matrix, 25.0 (mM Proton / pH) in cytosol.

コンストラクタの詳細

HBuffering

public HBuffering()

メソッドの詳細

calculate

protected void calculate(double t)

calculate and set the value of r_buffer.

定義:

クラス Reactor 内の calculate

パラメータ:

t -