org.simBio.core
クラス Reactor

java.lang.Object
  org.simBio.core.Component
      org.simBio.core.Parameter
          org.simBio.core.Composite
              org.simBio.core.Reactor

すべての実装されたインタフェース:

Node

直系の既知のサブクラス:

Acidity, AK, AmplitudeNaK, Anoxia, ANT, ATPsynthase, ATPsynthesis, Average, BetaAR_Gs, Buffer, CaBuffer, CAMP, Charge, Charge, CK, CN, Compartment, Compartment, ComplexI, ComplexIII, ComplexIV, ConcentrationCyta2, Conductor, ConstantField, CrossBridge, CrossBridgeLength, CrossBridgeNL, Current, Current, Current, Diffusion, Diffusion, Diffusion, Diffusion_a, Diffusion_t, DualCaBuffer, Electroneutrality, ENaCa, FCCP, Function, GapJunction, GradientP, GradientpH, HBuffering, Hodgkin_huxley_squid_axon_1952_modified, I_K, I_L, I_Na, I_stim, IsotonicContraction, JunctionalConductance, KoDependency, LChange, Leak, Leak, MassConservation, MassConservation2, Membrane, MembranePotential, MembraneTransporter, MetalFreeConcentration, Model, Model, MultiStateModel, NSRLeak, ODE, Ouabain, OxidativePhosphorylation, parabola, PartialPotential, PhosphateCarrier, PKA, PLB, PressureToConcentration, ProtonLeak, Qpump, Qrel, Rate, RateConstant, Ratio, RedoxPotential, RedoxPotentialCyta, Release, Release, ReversalPotential, ReversalPotential2, RyR, SR, SR, SRCA, StepChanger, StepChanger2, Stimulus, SubstrateDehydrogenation, TonicityChange, TotalVolume, Transfer, Troponin, Troponin, TwoStateModel, Uptake, UpTake, Vanderpol_model_1928, VoltageClamp, Volume, VolumeRatio, VolumeRatio, WaterFlux, Zvalue

public abstract class Reactor
extends Composite

set of equations.

バージョン:

$Revision: 1.1 $

作成者:

Nobuaki Sarai

フィールドの概要

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド

value

コンストラクタの概要

Reactor()

メソッドの概要

protected abstract void

calculate(double t) write equations here, and calculate dy over dt.

クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド

accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド

addValue, getValue, getValueString, prepare, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField

クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド

addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks

クラス java.lang.Object から継承されたメソッド

clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド

addDydt, addValue, getValue, setValue

コンストラクタの詳細

Reactor

public Reactor()

メソッドの詳細

calculate

protected abstract void calculate(double t)

write equations here, and calculate dy over dt.
計算中に呼び出される。 計算式を記載する。dy/dtをここで計算する。

パラメータ:

t - elapsed time (ms)