Model (simBio API)

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概要: 入れ子 | フィールド | コンストラクタ | メソッド

詳細: フィールド | コンストラクタ | メソッド

org.simBio.bio.noble_et_al_1998
クラス Model

java.lang.Object
  org.simBio.core.Component
      org.simBio.core.Parameter
          org.simBio.core.Composite
              org.simBio.core.Reactor
                  org.simBio.bio.noble_et_al_1998.Model

すべての実装されたインタフェース:: Node

public class Model
extends Reactor
extends Reactor

Noble98 Guinea-Pig Ventricular Cell Model by courtesy of Penny Noble.

Noble D, Varghese A, Kohl P, Noble P.
Improved guinea-pig ventricular cell model incorporating a diadic space, IKr and IKs, and length- and tension-dependent processes.
Can J Cardiol. 1998 Jan;14(1):123-34.

作成者:: Nobuaki Sarai
関連項目:: Noble et al, 1998

フィールドの概要
`Node`	`CaCalmod`
`Node`	`Cads`
`Node`	`Cai`
`Node`	`Carel`
`Node`	`CaTrop`
`Node`	`Caup`
`Node`	`CrossBridge`
`Node`	`d`
`Node`	`E`
`Node`	`f`
`Node`	`f2`
`Node`	`f2ds`
`Node`	`FrAct`
`Node`	`FrProd`
`Node`	`h`
`Node`	`ICaL`
`Node`	`IKr`
`Node`	`IKs`
`Node`	`Istim`
`Node`	`Ki`
`Node`	`Ko`
`Node`	`LightChain`
`Node`	`m`
`Node`	`Nai`
`double`	`period`
`Node`	`r`
`Node`	`s`
`Node`	`Tension`
`Node`	`xr1`
`Node`	`xr2`
`Node`	`xs`

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド
`value`

コンストラクタの概要
`Model()`

メソッドの概要
`protected void`	`calculate(double t)` write equations here, and calculate dy over dt.

クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド
`accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize`

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド
`addValue, getValue, getValueString, prepare, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField`

クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド
`addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks`

クラス java.lang.Object から継承されたメソッド
`clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait`

インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド
`addDydt, addValue, getValue, setValue`

フィールドの詳細

Ko

public Node Ko

E

public Node E

Ki

public Node Ki

Nai

public Node Nai

Cai

public Node Cai

Cads

public Node Cads

Caup

public Node Caup

Carel

public Node Carel

FrAct

public Node FrAct

FrProd

public Node FrProd

CaCalmod

public Node CaCalmod

CaTrop

public Node CaTrop

LightChain

public Node LightChain

CrossBridge

public Node CrossBridge

xr1

public Node xr1

xr2

public Node xr2

xs

public Node xs

r

public Node r

s

public Node s

m

public Node m

h

public Node h

d

public Node d

f

public Node f

f2

public Node f2

f2ds

public Node f2ds

Istim

public Node Istim

ICaL

public Node ICaL

IKr

public Node IKr

IKs

public Node IKs

Tension

public Node Tension

period

public double period

コンストラクタの詳細

Model

public Model()

メソッドの詳細

calculate

protected void calculate(double t)

クラス Reactor の記述:

write equations here, and calculate dy over dt.
計算中に呼び出される。計算式を記載する。dy/dtをここで計算する。

定義:: クラス Reactor 内の calculate

パラメータ:: t - elapsed time (ms)

概要