org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function
クラス TotalVolume

java.lang.Object
  org.simBio.core.Component
      org.simBio.core.Parameter
          org.simBio.core.Composite
              org.simBio.core.Reactor
                  org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.TotalVolume

すべての実装されたインタフェース:

Node

public class TotalVolume
extends Reactor

Calculate total cell volume from cell volume accessible for ion diffusion.

バージョン:

$Log: TotalVolume.java,v $ Revision 1.1 2005/11/01 06:32:40 mikaelwing First version of simBio hosted on sourceforge, version 0.3 Revision 1.1 2005/10/17 07:53:05 mikael Moved from branch dev_terashima_et_al_2005 Revision 1.1.2.2 2005/07/01 12:21:55 sarai revised Javadoc
Revision 1.1.2.1 2005/06/30 08:21:07 sarai calculate total cell volume, separated from VolumeRatio

作成者:

Sarai

関連項目:

TotalVolume.xml for example

フィールドの概要

Node	Vi the osmotically active cell volume (um^3)
double	Vn the osmotically inactive cell volume (um^3)

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド

value

コンストラクタの概要

TotalVolume()

メソッドの概要

protected void	calculate(double t) calculate value = Vt.
protected void	end() Update the value at the end of calculation.
protected void	prepare() Keep initial volume.

クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド

accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize

クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド

addValue, getValue, getValueString, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField

クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド

addDydt, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks

クラス java.lang.Object から継承されたメソッド

clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド

addDydt, addValue, getValue, setValue

フィールドの詳細

Vi

public Node Vi

the osmotically active cell volume (um^3)

Vn

public double Vn

the osmotically inactive cell volume (um^3)

コンストラクタの詳細

TotalVolume

public TotalVolume()

メソッドの詳細

prepare

protected void prepare()

Keep initial volume.

オーバーライド:

クラス Parameter 内の prepare

関連項目:

Parameter.prepare()

calculate

protected void calculate(double t)

calculate value = Vt.

定義:

クラス Reactor 内の calculate

パラメータ:

t - elapsed time (ms)

関連項目:

Reactor.calculate(double)

end

protected void end()

Update the value at the end of calculation.

オーバーライド:

クラス Component 内の end

関連項目:

Component.end()