クラス
org.simBio.core.Analyzer の使用

Analyzer を使用しているパッケージ

org.simBio.sim.analyzer	analyzers which inherit core.Analyzer, core.Analyserを継承するクラス群
org.simBio.sim.analyzer.csv	CSV maker 計算結果をCSV形式で書き出します。
org.simBio.sim.analyzer.csv.result
org.simBio.sim.analyzer.graph
org.simBio.sim.analyzer.graph.simple	2D Graph maker 計算結果を2次元グラフで表示する。
org.simBio.sim.analyzer.measure

org.simBio.sim.analyzer での Analyzer の使用

org.simBio.sim.analyzer での Analyzer のサブクラス

class	StopWatch
class	VisualizeAnalyzer base class for visualized Node(Viewer, Graph, Axis).

org.simBio.sim.analyzer.csv での Analyzer の使用

org.simBio.sim.analyzer.csv での Analyzer のサブクラス

class	CsvMaker csv形式で値をfileに書き出す。
class	Siblings should be placed into the xml file of the parent node from which one wants to get the childrens' parameters 親Reactorの持つ全てのVariableとReactorの値をcsv形式で書き出す
class	Total writes values of all parameters, variables and nodes to csv file 親Reactor以下のTreeに存在する全てのReactorとParameterの値をcsv fileに書き出す

org.simBio.sim.analyzer.csv.result での Analyzer の使用

org.simBio.sim.analyzer.csv.result での Analyzer のサブクラス

class	AbstractAppender append the parameters to CSV file at the end of calculation.
class	ALaCarte writes only chosen parameters, variables and nodes to csv file One has to write targets of desirable parameters in the xml file 特定のパラメータをCsvに書き込むクラス。

org.simBio.sim.analyzer.graph での Analyzer の使用

org.simBio.sim.analyzer.graph での Analyzer のサブクラス

class	AbstractGraph Graphのフレームワークを提供する. 本クラスでは、画面の再描画機能などは提供せずに、継承したGraph系クラスを シンプルに実装できるようにフレームワークを構成する。
class	AxisXLog x axis by log scale.
class	AxisYLog y axis by log scale.
class	BasicGraph 時系列データを表示するGraph.

org.simBio.sim.analyzer.graph.simple での Analyzer の使用

org.simBio.sim.analyzer.graph.simple での Analyzer のサブクラス

class	Axis
class	AxisX x axis
class	AxisXFix
class	AxisY y axis
class	Graph 2D graph. axis x is time.
class	Graph4State
class	RateGraph sample graph for bio.function
class	RateGraph_KA sample graph for bio.function
class	RelationGraph 2D graph of relation between two parameters
class	RelationGraph_LP 2D graph of relation between two parameters for org.simBio.sim.analyzer.measure.LeadPotential.
class	StepChart targetをずらして表示する。
class	Viewer graph viewer.

org.simBio.sim.analyzer.measure での Analyzer の使用

org.simBio.sim.analyzer.measure での Analyzer のサブクラス

class	AbstractMeasure Measuring.
class	Amplitude get the difference between the maximum and minimum value of the target.
class	AmplitudeInCycle get the difference between the maximum and minimum value of the target in a cycle.
class	APD Measuring Action Potential Duration.
class	APDforSA ペースメーカモデルの活動電位持続時間を計測する。
class	APDforSA2 ペースメーカモデルの活動電位持続時間を計測する。
class	HR 心拍数を計測する。
class	LeadPotential Lead Potentialを計算する。
class	Limitter targetの値が設定値を超えたら計算を終了する。
class	PeakDetect onsetとoffsetの間でtargetの極値を求める。
class	Sum targetsの和を求める。
class	Vmax Measuring dV/dt max.
class	VmaxTime measure Vmax and timing of Vmax.