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概要:  入れ子 | フィールド | コンストラクタ | メソッド 詳細:  フィールド | コンストラクタ | メソッド

org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current
クラス IRyR

java.lang.Object
  上位を拡張 org.simBio.core.Component
      上位を拡張 org.simBio.core.Parameter
          上位を拡張 org.simBio.core.Composite
              上位を拡張 org.simBio.core.Reactor
                  上位を拡張 org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter
                      上位を拡張 org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.current.IRyR
すべての実装されたインタフェース:
Node
public class IRyR
extends MembraneTransporter

Calcium releasing channel on SR.

バージョン:
$Id: IRyR.java,v 1.1 2007/12/15 07:21:54 nsarai Exp $
作成者:
Hiroyuki Nakai, Masanori Kuzumoto
関連項目:
Kuzumoto et al, 2007., IRyR

フィールドの概要
 Node CaDiadic
          local Ca2+ concentration near the mouth of RyR channel.
 Node Cai
          intracellular calcium concentration (mM)
 Node Cao
          calcium concentration in SR release site (mM)
 Node CICRfactor
           
 Node close
          close state probability
 double Cm
          membrane capacitance (pF)
 double diadicFactor
          Ca diadicFactor
 Node K1
           
 Node k1xclose
           
 Node K2
           
 double k2_1
           
 double k2_2
           
 Node K3
           
 double k3_1
           
 double k3_hill
           
 Node open
          open state probability
 double permeabilityCa
          membrane permeability
 
クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.MembraneTransporter から継承されたフィールド
cCa, CCa, cK, CK, cNa, CNa, current, currentCa, currentK, currentNa, total
 
クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたフィールド
value
 
コンストラクタの概要
IRyR()
           
 
メソッドの概要
protected  void calculate(double t)
           Compartmentの電流に足し合わせる。
protected  void prepare()
          construct null current
 
クラス org.simBio.core.Composite から継承されたメソッド
accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize
 
クラス org.simBio.core.Parameter から継承されたメソッド
addValue, getValue, getValueString, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField
 
クラス org.simBio.core.Component から継承されたメソッド
addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks
 
クラス java.lang.Object から継承されたメソッド
clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait
 
インタフェース org.simBio.core.Node から継承されたメソッド
addDydt, addValue, getValue, setValue
 

フィールドの詳細

open

public Node open
open state probability

close

public Node close
close state probability

Cai

public Node Cai
intracellular calcium concentration (mM)

Cao

public Node Cao
calcium concentration in SR release site (mM)

CaDiadic

public Node CaDiadic
local Ca2+ concentration near the mouth of RyR channel.

diadicFactor

public double diadicFactor
Ca diadicFactor

Cm

public double Cm
membrane capacitance (pF)

permeabilityCa

public double permeabilityCa
membrane permeability

k2_1

public double k2_1

k2_2

public double k2_2

k3_1

public double k3_1

k3_hill

public double k3_hill

K1

public Node K1

K2

public Node K2

K3

public Node K3

CICRfactor

public Node CICRfactor

k1xclose

public Node k1xclose
コンストラクタの詳細

IRyR

public IRyR()
メソッドの詳細

prepare

protected void prepare()
クラス MembraneTransporter の記述:
construct null current

オーバーライド:
クラス MembraneTransporter 内の prepare
関連項目:
Component.prepare()

calculate

protected void calculate(double t)
クラス MembraneTransporter の記述:
Compartmentの電流に足し合わせる。

オーバーライド:
クラス MembraneTransporter 内の calculate
パラメータ:
t - time
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