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E

E - クラス org.simBio.bio.noble_et_al_1998.Model の変数

E - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.Axis の変数

E1A - クラス org.simBio.bio.kuratomi_et_al_2003.current.carrier.Carrier の変数

probabilities at each state

E1A - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.Carrier の変数

probabilities at each state

E1B - クラス org.simBio.bio.kuratomi_et_al_2003.current.carrier.Carrier の変数

probabilities at each state

E1B - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.Carrier の変数

probabilities at each state

E2A - クラス org.simBio.bio.kuratomi_et_al_2003.current.carrier.Carrier の変数

probabilities at each state

E2A - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.Carrier の変数

probabilities at each state

E2B - クラス org.simBio.bio.kuratomi_et_al_2003.current.carrier.Carrier の変数

probabilities at each state

E2B - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.carrier.Carrier の変数

probabilities at each state

E_MAXIMUM - クラス org.simBio.sim.ps.view.PlotLine の static 変数

評価値の軸の最大値

E_MINIMUM - クラス org.simBio.sim.ps.view.PlotLine の static 変数

評価値の軸の最小値

E_R - クラス org.simBio.bio.hodgkin_huxley_1952.I_K の変数

reversal potential (millivolt)

E_R - クラス org.simBio.bio.hodgkin_huxley_1952.I_L の変数

reversal potential (millivolt)

E_R - クラス org.simBio.bio.hodgkin_huxley_1952.I_Na の変数

reversal potential (millivolt)

ECa - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.function.ENaCa の変数

equilibrium potential for Ca²⁺ [mV]

eCa - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.IbCa の変数

eCa - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.ICa の変数

ECa - クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.LeadPotential の変数

ECaL - クラス org.simBio.bio.kurata_et_al_2005.current.ICaL の変数

ECl - クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.LeadPotential の変数

eK - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.IK1 の変数

eK - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.IKr の変数

eK - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.IpK の変数

eK - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.Ito の変数

eK - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.Ito_endo の変数

EK - クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.LeadPotential の変数

eKs - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.IKs の変数

elapsedTime - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.current.pipette.Pipette の変数

elapsedTime - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.exp.Anoxia の変数

elapsedTime - クラス org.simBio.bio.negroni_lascano_1996.Qrel の変数

elapsedTime - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.experiment.TonicityChange の変数

elapsedTime - クラス org.simBio.core.Conductor の変数

elapsed time

elapsedTime - クラス org.simBio.sim.analyzer.csv.CsvMaker の変数

elapsedTime - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.simple.AxisX の変数

time at start integration

elapsedTime - クラス org.simBio.sim.analyzer.StopWatch の変数

Electroneutrality - org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.function の クラス

Calculate difference between total amounts of cations and anions.

Electroneutrality() - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.function.Electroneutrality のコンストラクタ

elementDecl(String, String) - クラス org.simBio.serialize.xml.LogSax2 のメソッド

Logs element names and models when debugging

Em0 - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.RedoxPotential の変数

standard free-energy chage of reaction

Ema - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.ConcentrationCyta2 の変数

redox potential of cytochrome a

Ema0 - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.ConcentrationCyta2 の変数

standard free-energy change

Emc - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.function.RedoxPotentialCyta の変数

redox potential of cytochrome c

Emc - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.ComplexIII の変数

redox potential for cytochrome c

EmN - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.ComplexI の変数

redox potential for NADH

EmU - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.ComplexI の変数

redox potential for ubiquinone

EmU - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.RespiratoryChain.ComplexIII の変数

redox potential for ubiquinone

ENa - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.function.ENaCa の変数

equilibrium potential for Na⁺ [mV]

eNa - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.IbNa の変数

eNa - クラス org.simBio.bio.tenTusscher_et_al_2004.current.INa の変数

ENa - クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.LeadPotential の変数

ENaCa - org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.function の クラス

equilibrium potential for Na⁺/Ca²⁺ exchanger.

ENaCa() - クラス org.simBio.bio.takeuchi_et_al_2006.function.ENaCa のコンストラクタ

end() - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2003.molecule.buffer.Ca.Analytic のメソッド

終了時にCaの値をバッファリングされた値に更新するためにcalculateを呼び出す。

end() - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.current.carrier.INaK のメソッド

end() - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.experiment.VolumeRatio のメソッド

Update the value at the end of calculation.

end() - クラス org.simBio.bio.terashima_et_al_2006.function.TotalVolume のメソッド

Update the value at the end of calculation.

end() - クラス org.simBio.core.Component のメソッド

called at the end of integration,
計算終了時に呼ばれます。

end() - クラス org.simBio.core.Conductor のメソッド

end of integration

end() - クラス org.simBio.sim.analyzer.csv.CsvMaker のメソッド

Close csv file.

end() - クラス org.simBio.sim.analyzer.csv.result.AbstractAppender のメソッド

close csv file.

end() - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.Graph のメソッド

Called when the calculations finish, and makes adjustments to the X axis, if necessary.

end() - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.Viewer のメソッド

end() - クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.Amplitude のメソッド

apply scaling factor and substract minimum from maximum.

end() - クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.AmplitudeInCycle のメソッド

end() - クラス org.simBio.sim.analyzer.StopWatch のメソッド

endCDATA() - クラス org.simBio.serialize.xml.LogSax2 のメソッド

Logs the end of a CDATA section.

endDocument() - クラス org.simBio.serialize.xml.LogSax2 のメソッド

Reports the end of the document.

endDTD() - クラス org.simBio.serialize.xml.LogSax2 のメソッド

Logs the end of a DTD section.

endElement(String, String, String) - クラス org.simBio.serialize.xml.LogSax2 のメソッド

Reports the end of an element.

endElement(String, String, String) - クラス org.simBio.sim.ps.serialize.TocReader のメソッド

endEntity(String) - クラス org.simBio.serialize.xml.LogSax2 のメソッド

Logs the end of an entity.

endFix - クラス org.simBio.sim.analyzer.measure.LeadPotential の変数

endPrefixMapping(String) - クラス org.simBio.serialize.xml.LogSax2 のメソッド

Reports the end of a prefix-URI mapping.

EnOff - org.simBio.util.taglets の クラス

Inline taglet for English languages.

EnOff() - クラス org.simBio.util.taglets.EnOff のコンストラクタ

EnOn - org.simBio.util.taglets の クラス

Inline taglet for English languages.

EnOn() - クラス org.simBio.util.taglets.EnOn のコンストラクタ

Entry - org.simBio の クラス

Entry for every main()

ep - クラス org.simBio.bio.faber_rudy_2000.current.Current の変数

Euler - org.simBio.core.integrator の クラス

the variable calculated by euler method
オイラー法で計算される変数

Euler() - クラス org.simBio.core.integrator.Euler のコンストラクタ

EulerList - org.simBio.core.integrator の クラス

include euler engine & dt adjuster

EulerList() - クラス org.simBio.core.integrator.EulerList のコンストラクタ

evals - クラス org.simBio.sim.ps.serialize.ParseXMLs.Result の変数

evaluate(double) - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.CrossBridgeForce のメソッド

evaluate(double) - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.ForceEquilibrium のメソッド

evaluate(double) - クラス org.simBio.bio.kuzumoto_et_al_2007.contraction.ParallelElementForce のメソッド

evaluate(double[]) - クラス org.simBio.util.numerical.MathMultivariableFunction のメソッド

Evaluates this function at specified values.

evaluate(double) - クラス org.simBio.util.numerical.MathUnivariableFunction のメソッド

Evaluates this function at specified value.

exchange() - クラス org.simBio.sim.dm.exchange.Exchanger のメソッド

exchange() - クラス org.simBio.sim.dm.exchange.FileNameExchanger のメソッド

exchange() - クラス org.simBio.sim.dm.exchange.IndexNameExchanger のメソッド

exchange() - クラス org.simBio.sim.dm.exchange.ListExchanger のメソッド

exchange() - クラス org.simBio.sim.dm.exchange.LogRatioExchanger のメソッド

exchange() - クラス org.simBio.sim.dm.exchange.NullExchanger のメソッド

exchange() - クラス org.simBio.sim.dm.exchange.NumericalExchanger のメソッド

exchange() - クラス org.simBio.sim.dm.exchange.SelectedValuesExchanger のメソッド

exchange() - クラス org.simBio.sim.dm.exchange.UniformRatioExchanger のメソッド

exchange() - クラス org.simBio.sim.dm.exchange.UniformValueExchanger のメソッド

Exchanger - org.simBio.sim.dm.exchange の クラス

値変換クラス群が継承する抽象クラス

Exchanger() - クラス org.simBio.sim.dm.exchange.Exchanger のコンストラクタ

ExchangerFactory - org.simBio.sim.dm.exchange の クラス

Exchangerの列を生成するファクトリ（？）

ExchangerFactory(Document, Node, String) - クラス org.simBio.sim.dm.exchange.ExchangerFactory のコンストラクタ

exit() - クラス org.simBio.core.Conductor のメソッド

exit run() of this Thread. set active flag = false

exit() - クラス org.simBio.sim.dm.ParameterChanger のメソッド

exit() - インタフェース org.simBio.sim.ps.ICollector のメソッド

全ての計算が終了したとき、データを保存する。

exit() - インタフェース org.simBio.sim.ps.IParamSpaceObserver のメソッド

データの追加が終了したことを通知。

exit() - インタフェース org.simBio.sim.ps.IReciever のメソッド

Finish one record of the result.

exit() - クラス org.simBio.sim.ps.ParameterSpace のメソッド

exit() - クラス org.simBio.sim.ps.serialize.TocWriter のメソッド

Close the XML file.

exit() - クラス org.simBio.sim.ps.view.PlotLouncher のメソッド

expandAll() - クラス org.simBio.sim.gui.JTreeTableSimBio のメソッド

TreeTableの階層全体を展開する。

extendMode - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.Axis の変数

動作モード

extendModeDefault - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.Axis の変数

デフォルト動作モード

extendRateDefault - クラス org.simBio.sim.analyzer.graph.Axis の変数

計算結果が表示範囲を超えた時に、スクロール or 拡張する領域の割合（標準値）

external - クラス org.simBio.bio.matsuoka_et_al_2004.molecule.Diffusion の変数

external concentration

externalEntityDecl(String, String, String) - クラス org.simBio.serialize.xml.LogSax2 のメソッド

Logs a parsed external entity declaration.